(EN) The present disclosure relates to modeling biological systems and biochemical processes. In order to accurately model these systems and processes, the behavior at the boundary of models of the system and processes is important. Some embodiments include representing rates of change of concentrations of molecules at the boundaries of models as dynamic and responsive rather than static and invariant. The rates of change of the concentrations of molecules may be modeled as proportional controllers. In some embodiments, the proportional controllers may be saturable. Using responsive boundaries reduces model complexity, thereby increasing computational speed and efficiency. Additionally, the responsive boundaries may more accurately and realistically depict the behavior of components within a system compared to other boundary modeling techniques. Alternatively or additionally, some embodiments may include using a result of a model with responsive boundaries to engineer or alter a biological system.
(FR) La présente divulgation concerne la modélisation de systèmes biologiques et de procédés biochimiques. Afin de modéliser avec précision ces systèmes et procédés, le comportement à la limite de modèles du système et des procédés est important. Certains modes de réalisation comprennent la représentation de vitesses de changement de concentrations de molécules aux limites de modèles en tant que dynamiques et sensibles plutôt que statiques et invariables. Les vitesses de changement des concentrations de molécules peuvent être modélisées sous la forme de régulateurs proportionnels. Selon certains modes de réalisation, les régulateurs proportionnels peuvent être saturables. L'utilisation de limites sensibles réduit la complexité du modèle, ce qui permet d'augmenter la vitesse et l'efficacité de calcul. De plus, les limites sensibles peuvent représenter de manière plus précise et réaliste le comportement de composants à l'intérieur d'un système par comparaison avec d'autres techniques de modélisation de limite. En variante ou en outre, certains modes de réalisation peuvent comprendre l'utilisation d'un résultat d'un modèle comportant des limites sensibles pour concevoir ou modifier un système biologique.