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1. WO2022094519 - MODÉLISATION DE RÉACTION COMPORTANT DES SOURCES ET DES PUITS DYNAMIQUES

Numéro de publication WO/2022/094519
Date de publication 05.05.2022
N° de la demande internationale PCT/US2021/071738
Date du dépôt international 06.10.2021
CIB
G16B 25/10 2019.1
GPHYSIQUE
16TECHNOLOGIES DE L’INFORMATION ET DE LA COMMUNICATION SPÉCIALEMENT ADAPTÉES À DES DOMAINES D’APPLICATION SPÉCIFIQUES
BBIO-INFORMATIQUE, c. à d. TECHNOLOGIES DE L’INFORMATION ET DE LA COMMUNICATION SPÉCIALEMENT ADAPTÉES AU TRAITEMENT DES DONNÉES GÉNÉTIQUES OU PROTÉIQUES DANS LA BIOLOGIE MOLÉCULAIRE INFORMATIQUE
25TIC spécialement adaptées à l’hybridation; TIC spécialement adaptées à l’expression de gènes ou de protéines
10Profilage de l’expression de gènes ou de protéines; Estimation ou normalisation de ratio d’expression
G16C 10/00 2019.1
GPHYSIQUE
16TECHNOLOGIES DE L’INFORMATION ET DE LA COMMUNICATION SPÉCIALEMENT ADAPTÉES À DES DOMAINES D’APPLICATION SPÉCIFIQUES
CCHIMIE COMPUTATIONNELLE; CHÉMO-INFORMATIQUE; SCIENCE INFORMATIQUE DES MATÉRIAUX
10Chimie théorique computationnelle, c. à d. TIC spécialement adaptées aux aspects théoriques de la chimie quantique, de la mécanique moléculaire, de la dynamique moléculaire ou similaires
G16C 20/60 2019.1
GPHYSIQUE
16TECHNOLOGIES DE L’INFORMATION ET DE LA COMMUNICATION SPÉCIALEMENT ADAPTÉES À DES DOMAINES D’APPLICATION SPÉCIFIQUES
CCHIMIE COMPUTATIONNELLE; CHÉMO-INFORMATIQUE; SCIENCE INFORMATIQUE DES MATÉRIAUX
20Chémo-informatique, c. à d. TIC spécialement adaptées au traitement des données physicochimiques ou structurelles des particules, des éléments, des composés ou des mélanges chimiques
60Chimie combinatoire in silico
CPC
G16B 5/00
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
5ICT specially adapted for modelling or simulations in systems biology, e.g. gene-regulatory networks, protein interaction networks or metabolic networks
G16C 20/10
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
CCOMPUTATIONAL CHEMISTRY; CHEMOINFORMATICS; COMPUTATIONAL MATERIALS SCIENCE
20Chemoinformatics, i.e. ICT specially adapted for the handling of physicochemical or structural data of chemical particles, elements, compounds or mixtures
10Analysis or design of chemical reactions, syntheses or processes
Déposants
  • X DEVELOPMENT LLC [US]/[US]
Inventeurs
  • RUSSO, Frank
Mandataires
  • HSU, David
  • GAUDRY, Katherine
  • ROTHWELL, Rodney H.
Données relatives à la priorité
16/949,49530.10.2020US
Langue de publication Anglais (en)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) REACTION MODELING WITH DYNAMIC SOURCES AND SINKS
(FR) MODÉLISATION DE RÉACTION COMPORTANT DES SOURCES ET DES PUITS DYNAMIQUES
Abrégé
(EN) The present disclosure relates to modeling biological systems and biochemical processes. In order to accurately model these systems and processes, the behavior at the boundary of models of the system and processes is important. Some embodiments include representing rates of change of concentrations of molecules at the boundaries of models as dynamic and responsive rather than static and invariant. The rates of change of the concentrations of molecules may be modeled as proportional controllers. In some embodiments, the proportional controllers may be saturable. Using responsive boundaries reduces model complexity, thereby increasing computational speed and efficiency. Additionally, the responsive boundaries may more accurately and realistically depict the behavior of components within a system compared to other boundary modeling techniques. Alternatively or additionally, some embodiments may include using a result of a model with responsive boundaries to engineer or alter a biological system.
(FR) La présente divulgation concerne la modélisation de systèmes biologiques et de procédés biochimiques. Afin de modéliser avec précision ces systèmes et procédés, le comportement à la limite de modèles du système et des procédés est important. Certains modes de réalisation comprennent la représentation de vitesses de changement de concentrations de molécules aux limites de modèles en tant que dynamiques et sensibles plutôt que statiques et invariables. Les vitesses de changement des concentrations de molécules peuvent être modélisées sous la forme de régulateurs proportionnels. Selon certains modes de réalisation, les régulateurs proportionnels peuvent être saturables. L'utilisation de limites sensibles réduit la complexité du modèle, ce qui permet d'augmenter la vitesse et l'efficacité de calcul. De plus, les limites sensibles peuvent représenter de manière plus précise et réaliste le comportement de composants à l'intérieur d'un système par comparaison avec d'autres techniques de modélisation de limite. En variante ou en outre, certains modes de réalisation peuvent comprendre l'utilisation d'un résultat d'un modèle comportant des limites sensibles pour concevoir ou modifier un système biologique.
Documents de brevet associés
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