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1. WO2020167597 - SYSTÈMES RAPPORTEURS TRANSACTIVÉS EN PHASE SOLUTION DESTINÉS À ÊTRE UTILISÉS DANS DES DÉTECTIONS DE SÉQUENCES D'ACIDES NUCLÉIQUES À BASE DE CRISPR

Numéro de publication WO/2020/167597
Date de publication 20.08.2020
N° de la demande internationale PCT/US2020/017169
Date du dépôt international 07.02.2020
CIB
C12Q 1/6869 2018.1
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
QPROCÉDÉS DE MESURE OU DE TEST FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES, DES ACIDES NUCLÉIQUES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
68faisant intervenir des acides nucléiques
6869Méthodes de séquençage
CPC
C12Q 1/6897
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6897involving reporter genes operably linked to promoters
Déposants
  • TOKITAE LLC [US]/[US]
Inventeurs
  • BAUGHMAN, Ted
  • LE NY, Anne-Laure M.
  • LEUNG, Philip
  • MADAN, Damian
  • NALEFSKI, Eric
Mandataires
  • SCHUBERT, Elizabeth L.
  • STEWART, John C.
  • BOWERS, Jeffrey A.
  • GOODALL, Eleanor V.
Données relatives à la priorité
62/803,90111.02.2019US
Langue de publication anglais (EN)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) SOLUTION-PHASE, TRANS-ACTIVATED REPORTER SYSTEMS FOR USE IN CRISPR-BASED NUCLEIC ACID SEQUENCE DETECTIONS
(FR) SYSTÈMES RAPPORTEURS TRANSACTIVÉS EN PHASE SOLUTION DESTINÉS À ÊTRE UTILISÉS DANS DES DÉTECTIONS DE SÉQUENCES D'ACIDES NUCLÉIQUES À BASE DE CRISPR
Abrégé
(EN)
Embodiments disclosed herein include devices, methods, and systems for direct, selective, and sensitive detection of single-stranded and double-stranded target nucleic acid sequences from various sources in a solution-based system. When activated by binding a target nucleic acid sequence, the Cas protein cleaves a tether separating a reporter molecule from a capture moiety. The capture moiety can then be used to remove, localize, or sequester uncleaved molecule containing intact tethers. In some embodiments, the systems, methods, and devices may include a filter, a membrane, or other molecules that may help to separate the tethered and untethered reporter molecules and/or capture the reporter molecules. These devices, systems, and techniques allow a user to rapidly process samples that may contain the target nucleic acid, in some cases, without needing to amplify the target sequences, and without the need for sophisticated or expensive laboratory equipment. These devices and methods may be used to assay a wide variety of samples and target nucleic acid sources, for the presence or absence of a specific target sequences. Compositions and kits, useful in practicing these methods, for example detecting a target RNA or DNA in a biological sample, are also described.
(FR)
Des modes de réalisation de la présente invention comprennent des dispositifs, des procédés et des systèmes pour la détection directe, sélective et sensible de séquences d'acide nucléique cible simple brin et double-brin émanant de diverses sources dans un système à base de solution. Lorsqu'elle est activée par liaison d'une séquence d'acide nucléique cible, la protéine Cas clive une attache séparant une molécule rapporteur d'une fraction de capture. La fraction de capture peut ensuite être utilisée pour éliminer, localiser ou séquestrer une molécule non clivée contenant des attaches intactes. Dans certains modes de réalisation, les systèmes, procédés et dispositifs peuvent comprendre un filtre, une membrane ou d'autres molécules qui peuvent aider à séparer les molécules rapporteurs attachées et non attachées. Ces dispositifs, systèmes et techniques permettent à un utilisateur de traiter rapidement des échantillons qui peuvent contenir l'acide nucléique cible, dans certains cas sans avoir besoin d'amplifier les séquences cibles et sans avoir besoin d'un équipement de laboratoire sophistiqué ou coûteux. Ces dispositifs et procédés peuvent être utilisés pour doser une large gamme d'échantillons et de sources d'acide nucléique cible, pour la présence ou l'absence de séquences cibles spécifiques. L'invention concerne également des compositions et des kits, utiles dans la mise en œuvre de ces procédés, par exemple pour la détection d'un ADN ou d'un ARN dans un échantillon biologique.
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