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1. WO2020113673 - PROCÉDÉ DE CLASSIFICATION DE SOUS-TYPES DE CANCERS UTILISANT UNE INTÉGRATION MULTIOMIQUE

Numéro de publication WO/2020/113673
Date de publication 11.06.2020
N° de la demande internationale PCT/CN2018/121838
Date du dépôt international 18.12.2018
CIB
G16B 40/00 2019.01
GPHYSIQUE
16TECHNOLOGIES DE L’INFORMATION ET DE LA COMMUNICATION SPÉCIALEMENT ADAPTÉES À DES DOMAINES D’APPLICATION SPÉCIFIQUES
BBIO-INFORMATIQUE, c. à d. TECHNOLOGIES DE L’INFORMATION ET DE LA COMMUNICATION SPÉCIALEMENT ADAPTÉES AU TRAITEMENT DES DONNÉES GÉNÉTIQUES OU PROTÉIQUES DANS LA BIOLOGIE MOLÉCULAIRE INFORMATIQUE
40TIC spécialement adaptées aux biostatistiques; TIC spécialement adaptées à l’apprentissage automatique ou à l’exploration de données liées à la bio-informatique, p.ex. extraction de connaissances ou détection de motifs
Déposants
  • 深圳先进技术研究院 SHENZHEN INSTITUTES OF ADVANCED TECHNOLOGY [CN]/[CN]
Inventeurs
  • 杨超 YANG, Chao
  • 殷鹏 YIN, Peng
  • 蒋佳新 JIANG, Jiaxin
Mandataires
  • 深圳市科进知识产权代理事务所(普通合伙) SHENZHEN KEJIN INTELLECTUAL PROPERTY OFFICE
Données relatives à la priorité
201811496363.307.12.2018CN
Langue de publication chinois (ZH)
Langue de dépôt chinois (ZH)
États désignés
Titre
(EN) CANCER SUBTYPE CLASSIFICATION METHOD EMPLOYING MULTIOMICS INTEGRATION
(FR) PROCÉDÉ DE CLASSIFICATION DE SOUS-TYPES DE CANCERS UTILISANT UNE INTÉGRATION MULTIOMIQUE
(ZH) 一种基于多组学集成的癌症亚型分类方法
Abrégé
(EN)
The present application provides a cancer subtype classification method employing multiomics integration. The method comprises: acquiring target multiomics data of each patient in a target cancer patient group; calculating to obtain an omics similarity matrix; performing prediction on each omics similarity matrix to obtain a predicted similarity matrix; using the omics similarity matrix to correct the predicted similarity matrix, and acquiring a corrected matrix; performing weighted fusion to obtain a fusion matrix; and performing spectral clustering on the fusion matrix, and establishing a cancer subtype category label corresponding to the fusion matrix of each patient. The present application improves the accuracy of classification evaluation of cancer subtypes, while also using a more flexible integration method to classify patients, thereby improving the efficiency of data analysis, and facilitating research on cancer subtypes.
(FR)
La présente invention concerne un procédé de classification de sous-types de cancers utilisant une intégration multiomique. Le procédé comprend les étapes consistant : à acquérir des données multiomiques cibles de chaque patient dans un groupe cible de patients atteints de cancer ; à réaliser un calcul pour obtenir une matrice de similarité omique ; à effectuer une prédiction sur chaque matrice de similarité omique pour obtenir une matrice de similarité prédite ; à utiliser la matrice de similarité omique pour corriger la matrice de similarité prédite et à acquérir une matrice corrigée ; à effectuer une fusion pondérée pour obtenir une matrice de fusion ; et à effectuer un regroupement spectral sur la matrice de fusion et à établir une étiquette de catégorie de sous-type de cancer correspondant à la matrice de fusion de chaque patient. La présente invention améliore la précision de l'évaluation de classification de sous-types de cancers, tout en utilisant également un procédé d'intégration plus flexible pour classer des patients, améliorant ainsi l'efficacité d'analyse de données et facilitant la recherche sur des sous-types de cancers.
(ZH)
本申请提供了一种基于多组学集成的癌症亚型分类方法,包括:获取目标癌症患者群中的每个患者的目标多组学数据;计算得到组学相似度矩阵;对每个所述组学相似度矩阵进行预测,得到预测相似度矩阵;利用所述组学相似度矩阵修正所述预测相似度矩阵得到修正矩阵;进行加权融合,得到融合矩阵;对所述融合矩阵进行谱聚类,并建立与每个患者的所述融合矩阵对应的癌症亚型类别标签。本申请提高了癌症亚型的分类评价的准确性,并通过更灵活的整合方法实现对于患者进行分类,提高了数据分析效率,为对于癌症亚型的研究提供了方便。
Également publié en tant que
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