Traitement en cours

Veuillez attendre...

Paramétrages

Paramétrages

Aller à Demande

1. WO2020109600 - MÉTHODE DE PRÉDICTION DE RÉSISTANCE À LA TUBERCULOSE

Numéro de publication WO/2020/109600
Date de publication 04.06.2020
N° de la demande internationale PCT/EP2019/083171
Date du dépôt international 29.11.2019
CIB
C12Q 1/689 2018.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
QPROCÉDÉS DE MESURE OU DE TEST FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES, DES ACIDES NUCLÉIQUES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
68faisant intervenir des acides nucléiques
6876Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p.ex. amorces ou sondes
6888pour la détection ou l’identification d’organismes
689pour les bactéries
G16B 20/20 2019.01
GPHYSIQUE
16TECHNOLOGIES DE L’INFORMATION ET DE LA COMMUNICATION SPÉCIALEMENT ADAPTÉES À DES DOMAINES D’APPLICATION SPÉCIFIQUES
BBIO-INFORMATIQUE, c. à d. TECHNOLOGIES DE L’INFORMATION ET DE LA COMMUNICATION SPÉCIALEMENT ADAPTÉES AU TRAITEMENT DES DONNÉES GÉNÉTIQUES OU PROTÉIQUES DANS LA BIOLOGIE MOLÉCULAIRE INFORMATIQUE
20TIC spécialement adaptées à la génomique ou protéomique fonctionnelle, p. ex. corrélations génotype-phénotype
20Détection d’allèles ou de variantes, p. ex. détection de polymorphisme d’un seul nucléotide
CPC
C12Q 1/689
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
6888for detection or identification of organisms
689for bacteria
C12Q 2600/106
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
2600Oligonucleotides characterized by their use
106Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
C12Q 2600/156
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
2600Oligonucleotides characterized by their use
156Polymorphic or mutational markers
G16B 20/20
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
20ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
20Allele or variant detection, e.g. single nucleotide polymorphism [SNP] detection
Déposants
  • UNIVERSITÄT ZÜRICH [CH]/[CH]
Inventeurs
  • BUCH, Thorsten
  • PRAJWAL, Prajwal
  • DÜMCKE, Sebastian
Mandataires
  • SCHULZ JUNGHANS PATENTANWÄLTE PARTGMBB
Données relatives à la priorité
18209254.429.11.2018EP
19158962.122.02.2019EP
Langue de publication anglais (EN)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) TUBERCULOSIS RESISTANCE PREDICTION METHOD
(FR) MÉTHODE DE PRÉDICTION DE RÉSISTANCE À LA TUBERCULOSE
Abrégé
(EN)
The invention relates to a method for predicting mycobacterial drug resistance by isolating mycobacterial nucleic acid from a sample, obtaining a sample sequence from the nucleic acid, aligning and comparing the sample sequence to a reference sequence and determining for each reference position whether the sample sequence value is the same as a particular sequence value assigned to the position in a table. If both values are the same, a position weight value is assigned to the position. A predictor value is obtained by adding all position weight values and the predictor value is compared to a threshold value. If the predictor value is smaller than the threshold value, drug resistance is predicted. The invention encompasses a system for practicing the method, and the use of certain antibacterial drugs to treat infections by pathogens, resistance of which has been determined by the method of the invention.
(FR)
L'invention concerne une méthode de prédiction de la résistance aux médicaments mycobactériens consistant à isoler de l'acide nucléique mycobactérien à partir d'un échantillon, à obtenir une séquence d'échantillon à partir de l'acide nucléique, à aligner et comparer la séquence d'échantillon à une séquence de référence et à déterminer, pour chaque position de référence, si la valeur de séquence d'échantillon est identique à une valeur de séquence particulière attribuée à la position dans une table. Si les deux valeurs sont les mêmes, une pondération de position est attribuée à la position. Une valeur de prédiction est obtenue en additionnant toutes les pondérations de position et la valeur de prédiction est comparée à une valeur de seuil. Si la valeur de prédiction est inférieure à la valeur seuil, la résistance aux médicaments est prédite. L'invention concerne un système pour mettre en œuvre la méthode, et l'utilisation de certains médicaments antibactériens pour traiter des infections par des pathogènes, dont la résistance a été déterminée par le procédé de l'invention.
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international