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1. WO2019242597 - MESURE ET PRÉDICTION DE MOTIFS DE MUTATION GÉNÉTIQUE VIRALE

Numéro de publication WO/2019/242597
Date de publication 26.12.2019
N° de la demande internationale PCT/CN2019/091652
Date du dépôt international 18.06.2019
CIB
C12Q 1/68 2018.1
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
QPROCÉDÉS DE MESURE OU DE TEST FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES, DES ACIDES NUCLÉIQUES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
68faisant intervenir des acides nucléiques
A61P 31/00 2006.1
ANÉCESSITÉS COURANTES DE LA VIE
61SCIENCES MÉDICALE OU VÉTÉRINAIRE; HYGIÈNE
PACTIVITÉ THÉRAPEUTIQUE SPÉCIFIQUE DE COMPOSÉS CHIMIQUES OU DE PRÉPARATIONS MÉDICINALES
31Agents anti-infectieux, c. à d. antibiotiques, antiseptiques, chimiothérapeutiques
CPC
A61P 31/00
AHUMAN NECESSITIES
61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
31Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
C12N 2760/16121
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
2760ssRNA Viruses negative-sense
00011ssRNA Viruses negative-sense
16011Orthomyxoviridae
16111Influenzavirus A, i.e. influenza A virus
16121Viruses as such, e.g. new isolates, mutants or their genomic sequences
C12N 2760/16122
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
2760ssRNA Viruses negative-sense
00011ssRNA Viruses negative-sense
16011Orthomyxoviridae
16111Influenzavirus A, i.e. influenza A virus
16122New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
C12N 7/00
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
7Viruses; Bacteriophages; Compositions thereof; Preparation or purification thereof
G06F 30/20
GPHYSICS
06COMPUTING; CALCULATING; COUNTING
FELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING
30Computer-aided design [CAD]
20Design optimisation, verification or simulation
G16B 10/00
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
10ICT specially adapted for evolutionary bioinformatics, e.g. phylogenetic tree construction or analysis
Déposants
  • THE CHINESE UNIVERSITY OF HONG KONG [CN]/[CN]
Inventeurs
  • WANG, Maggie Haitian
  • ZEE, Benny Chung Ying
  • LOU, Jingzhi
  • CHONG, Ka Chun
Mandataires
  • INSIGHT INTELLECTUAL PROPERTY LIMITED
Données relatives à la priorité
62/687,64520.06.2018US
Langue de publication Anglais (en)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) MEASUREMENT AND PREDICTION OF VIRUS GENETIC MUTATION PATTERNS
(FR) MESURE ET PRÉDICTION DE MOTIFS DE MUTATION GÉNÉTIQUE VIRALE
Abrégé
(EN) Mutation patterns of a virus (e.g., influenza virus) are identified and predicted based on identifying effective mutations in an amino acid sequence of the virus and an effective mutation period during which the mutation enables the virus to escape from human immunity. Based on analysis of existing virus composition and infection rates, a measure of genetic mutation activity ( "g-measure" ) is determined, and one or more associated parameters that further characterize virus genetic activity may also be optimized. The g-measure and/or associated parameters can be used to predict future genetic activity of the virus, which can aid in selection of strains for a future vaccine and/or predictions of infectious-disease outbreaks.
(FR) Des motifs de mutation d'un virus (par exemple, le virus de la grippe) sont identifiés et prédits sur la base de l'identification de mutations effectives dans une séquence d'acides aminés du virus et d'une période de mutation effective pendant laquelle la mutation permet au virus de s'échapper de l'immunité humaine. Sur la base de l'analyse de la composition virale existante et des taux d'infection, une mesure de l'activité de mutation génétique ("mesure g") est déterminée, et un ou plusieurs paramètres associés qui caractérisent en outre l'activité génétique virale peuvent également être optimisés. La mesure g et/ou les paramètres associés peuvent être utilisés pour prédire l'activité génétique future du virus, ce qui peut aider à la sélection de souches pour un futur vaccin et/ou des prédictions d'épidémies de maladie infectieuse.
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