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1. WO2019136376 - SÉQUENÇAGE À HAUT DÉBIT À DÉTECTION À SEMI-CONDUCTEUR

Numéro de publication WO/2019/136376
Date de publication 11.07.2019
N° de la demande internationale PCT/US2019/012536
Date du dépôt international 07.01.2019
Demande présentée en vertu du Chapitre 2 08.11.2019
CIB
G01N 21/64 2006.01
GPHYSIQUE
01MÉTROLOGIE; TESTS
NRECHERCHE OU ANALYSE DES MATÉRIAUX PAR DÉTERMINATION DE LEURS PROPRIÉTÉS CHIMIQUES OU PHYSIQUES
21Recherche ou analyse des matériaux par l'utilisation de moyens optiques, c. à d. en utilisant des rayons infrarouges, visibles ou ultraviolets
62Systèmes dans lesquels le matériau analysé est excité de façon à ce qu'il émette de la lumière ou qu'il produise un changement de la longueur d'onde de la lumière incidente
63excité optiquement
64Fluorescence; Phosphorescence
B01L 3/00 2006.01
BTECHNIQUES INDUSTRIELLES; TRANSPORTS
01PROCÉDÉS OU APPAREILS PHYSIQUES OU CHIMIQUES EN GÉNÉRAL
LAPPAREILS DE LABORATOIRE POUR LA CHIMIE OU LA PHYSIQUE, À USAGE GÉNÉRAL
3Récipients ou ustensiles pour laboratoires, p.ex. verrerie de laboratoire; Compte-gouttes
C12Q 1/68 2018.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
QPROCÉDÉS DE MESURE OU DE TEST FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES, DES ACIDES NUCLÉIQUES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
68faisant intervenir des acides nucléiques
C40B 30/04 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
40TECHNOLOGIE COMBINATOIRE
BCHIMIE COMBINATOIRE; BIBLIOTHÈQUES, p.ex. CHIMIOTHÈQUES, BIBLIOTHÈQUES VIRTUELLES (IN SILICO)
30Procédés de criblage des bibliothèques
04en mesurant l'aptitude spécifique à se lier à une molécule cible, p.ex. liaison anticorps-antigène, liaison récepteur-ligand
H01L 27/146 2006.01
HÉLECTRICITÉ
01ÉLÉMENTS ÉLECTRIQUES FONDAMENTAUX
LDISPOSITIFS À SEMI-CONDUCTEURS; DISPOSITIFS ÉLECTRIQUES À L'ÉTAT SOLIDE NON PRÉVUS AILLEURS
27Dispositifs consistant en une pluralité de composants semi-conducteurs ou d'autres composants à l'état solide formés dans ou sur un substrat commun
14comprenant des composants semi-conducteurs sensibles aux rayons infrarouges, à la lumière, au rayonnement électromagnétique d'ondes plus courtes ou au rayonnement corpusculaire, et spécialement adaptés, soit comme convertisseurs de l'énergie dudit rayonnement en énergie électrique, soit comme dispositifs de commande de l'énergie électrique par ledit rayonnement
144Dispositifs commandés par rayonnement
146Structures de capteurs d'images
C40B 50/14 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
40TECHNOLOGIE COMBINATOIRE
BCHIMIE COMBINATOIRE; BIBLIOTHÈQUES, p.ex. CHIMIOTHÈQUES, BIBLIOTHÈQUES VIRTUELLES (IN SILICO)
50Procédés de création de bibliothèques, p.ex. synthèse combinatoire
14Synthèse en phase solide, c. à d. dans laquelle au moins un bloc servant à créer la bibliothèque est lié à un support solide au cours de la création de la bibliothèque; Procédés particuliers de clivage à partir du support solide
CPC
B01L 2200/147
BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
LCHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
2200Solutions for specific problems relating to chemical or physical laboratory apparatus
14Process control and prevention of errors
143Quality control, feedback systems
147Employing temperature sensors
B01L 2300/0636
BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
LCHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
2300Additional constructional details
06Auxiliary integrated devices, integrated components
0627Sensor or part of a sensor is integrated
0636Integrated biosensor, microarrays
B01L 2300/0645
BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
LCHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
2300Additional constructional details
06Auxiliary integrated devices, integrated components
0627Sensor or part of a sensor is integrated
0645Electrodes
B01L 2300/0663
BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
LCHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
2300Additional constructional details
06Auxiliary integrated devices, integrated components
0627Sensor or part of a sensor is integrated
0663Whole sensors
B01L 2300/0893
BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
LCHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
2300Additional constructional details
08Geometry, shape and general structure
0893having a very large number of wells, microfabricated wells
B01L 3/502715
BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
LCHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
3Containers or dishes for laboratory use, e.g. laboratory glassware
50Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes
502with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures
5027by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip
502715characterised by interfacing components, e.g. fluidic, electrical, optical or mechanical interfaces
Déposants
  • ILLUMINA, INC. [US]/[US]
Inventeurs
  • DEHLINGER, Dietrich
  • AGAH, Ali
  • FUNG, Tracy Helen
  • KOSTEM, Emrah
Mandataires
  • HAYNES, Mark A.
  • DURDIK, Paul A.
  • WOLFELD, Warren S.
  • BEFFEL, JR., Ernest J.
  • DUNLAP, Andrew L.
Données relatives à la priorité
202075812.04.2018NL
62/614,93008.01.2018US
62/614,93408.01.2018US
Langue de publication anglais (EN)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) HIGH-THROUGHPUT SEQUENCING WITH SEMICONDUCTOR-BASED DETECTION
(FR) SÉQUENÇAGE À HAUT DÉBIT À DÉTECTION À SEMI-CONDUCTEUR
Abrégé
(EN)
A biosensor (300) for base calling is provided. The biosensor (300) comprises a sampling device, which includes a sample surface (334) that has an array of pixel areas (306', 308', 310', 312', 314') and a solid-state imager (322) that has an array of sensors (306, 308, 310, 312, 314). Each sensor (306, 308, 310, 312, 314) generates pixel signals in each base calling cycle. Each pixel signal represents light gathered in one base calling cycle from one or more clusters (306A, 306B; 308A, 308B; 310A, 310B; 312A, 312B; 314A, 314B) in a corresponding pixel area (306', 308', 310', 312', 314') of the sample surface (334). The biosensor (300) further comprises a signal processor configured for connection to the sampling device. The signal processor receives and processes the pixel signals from the sensors (306, 308, 310, 312, 314) for base calling in a base calling cycle, and uses the pixel signals from fewer sensors (306, 308, 310, 312, 314) than a number of clusters (306A, 306B; 308A, 308B; 310A, 310B; 312A, 312B; 314A, 314B) base called in the base calling cycle. Pixel signals from the fewer sensors (306, 308, 310, 312, 314) include at least one pixel signal representing light gathered from at least two clusters (306A, 306B; 308A, 308B; 310A, 310B; 312A, 312B; 314A, 314B) in the corresponding pixel area (306', 308', 310', 312', 314').
(FR)
L'invention concerne un biocapteur (300) d'appel de base. Le biocapteur (300) comprend un dispositif d'échantillonnage qui comprend une surface d'échantillon (334) comprenant un réseau de zones de pixels (306', 308', 310', 312', 314') et un imageur à semi-conducteurs (322) qui possède un réseau de capteurs (306, 308, 310, 312, 314). Chaque capteur (306, 308, 310, 312, 314) génère des signaux de pixel dans chaque cycle d'appel de base. Chaque signal de pixel représente la lumière recueillie dans un cycle d'appel de base à partir d'un ou de plusieurs groupe(s) (306A, 306B; 308A, 308B; 310A, 310B; 312A, 312B; 314A, 314B) dans une zone de pixel correspondante (306', 308', 310', 312', 314') de la surface d'échantillon (334). Le biocapteur (300) comprend en outre un processeur de signal conçu pour une connexion au dispositif d'échantillonnage. Le processeur de signaux reçoit et traite les signaux de pixels provenant des capteurs (306, 308, 310, 312, 314) pour l'appel de base dans un cycle d'appel de base, et met en œuvre les signaux de pixels provenant de moins de capteurs (306, 308, 310, 312, 314) qu'un certain nombre de groupes (306A, 306B; 308A, 308B; 310A, 310B; 312A, 312B; 314A, 314B) appelés dans le cycle d'appel de base. Des signaux de pixels provenant des capteurs moins nombreux (306, 308, 310, 312, 314) comprennent au moins un signal de pixel représentant la lumière recueillie à partir d'au moins deux groupes (306A, 306B; 308A, 308B; 310A, 310B; 312A, 312B; 314A, 314B) dans la zone de pixel correspondante (306', 308', 310', 312', 314').
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international