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1. (WO2019043481) ALGORITHME DELTA SENSIBLE AU CONTEXTE POUR DES FICHIERS GÉNOMIQUES
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N° de publication : WO/2019/043481 N° de la demande internationale : PCT/IB2018/056009
Date de publication : 07.03.2019 Date de dépôt international : 09.08.2018
CIB :
G06F 19/18 (2011.01) ,G06F 17/30 (2006.01)
G PHYSIQUE
06
CALCUL; COMPTAGE
F
TRAITEMENT ÉLECTRIQUE DE DONNÉES NUMÉRIQUES
19
Équipement ou méthodes de traitement de données ou de calcul numérique, spécialement adaptés à des applications spécifiques
10
Bio-informatique, c. à d. procédés ou systèmes pour le traitement de données génétiques ou se rapportant aux protéines en biologie moléculaire informatique
18
pour la génomique ou la protéomique fonctionnelle, p.ex. associations génotype-phénotype, déséquilibre de liaison, mutagénèse, génotypage ou annotation génomique, interactions protéines-protéines ou interactions protéines-acides nucléiques
G PHYSIQUE
06
CALCUL; COMPTAGE
F
TRAITEMENT ÉLECTRIQUE DE DONNÉES NUMÉRIQUES
17
Equipement ou méthodes de traitement de données ou de calcul numérique, spécialement adaptés à des fonctions spécifiques
30
Recherche documentaire; Structures de bases de données à cet effet
Déposants :
INTERNATIONAL BUSINESS MACHINES CORPORATION [US/US]; New Orchard Road Armonk, New York 10504, US
IBM UNITED KINGDOM LIMITED [GB/GB]; PO Box 41, North Harbour Portsmouth Hampshire PO6 3AU, GB (MG)
IBM (CHINA) INVESTMENT COMPANY LIMITED [CN/CN]; 25/F, Pangu Plaza No.27, Central North 4th Ring Road, Chaoyang District, Beijing 100101, CN (MG)
Inventeurs :
MAHARANA, Adyasha; US
CONSTANTINESCU, Mihail, Corneliu; US
Mandataire :
FOURNIER, Kevin; GB
Données relatives à la priorité :
15/693,01931.08.2017US
Titre (EN) CONTEXT AWARE DELTA ALGORITHM FOR GENOMIC FILES
(FR) ALGORITHME DELTA SENSIBLE AU CONTEXTE POUR DES FICHIERS GÉNOMIQUES
Abrégé :
(EN) A method, computer system, and a computer program product for compressing at least one delta file for a plurality of genomic data files is provided.The present invention may include receiving the plurality of genomic data files as input. The present invention may also include determining a plurality of rows by traversing the received plurality of genomic data files. The present invention may then include comparing the plurality of rows associated with the traversed plurality of genomic data files. The present invention may further include generating a plurality of resulting delta files based on the compared plurality of rows. The present invention may also include compressing the generated plurality of resulting delta files by utilizing a general purpose file compressor.
(FR) La présente invention concerne un procédé, un système informatique et un produit-programme d'ordinateur pour compresser au moins un fichier delta pour une pluralité de fichiers de données génomiques. La présente invention peut comprendre la réception de la pluralité des fichiers de données génomiques en tant qu'entrée.La présente invention peut également comprendre la détermination d'une pluralité de rangées en parcourant la pluralité reçue des fichiers de données génomiques. La présente invention peut comprendre ensuite la comparaison de la pluralité des rangées associée à la pluralité parcourue des fichiers de données génomiques. La présente invention peut en outre comprendre la génération d'une pluralité de fichiers delta résultants sur la base de la pluralité comparée des rangées. La présente invention peut également comprendre la compression de la pluralité générée des fichiers delta résultants à l'aide d'un compresseur de fichier à usage général.
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États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)