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1. (WO2018204367) PROFILAGE DE MÉTHYLATION D'ADN À L'AIDE D'UN RÉSEAU DE BIOCAPTEURS MAGNÉTORÉSISTIFS

Pub. No.:    WO/2018/204367    International Application No.:    PCT/US2018/030457
Publication Date: Fri Nov 09 00:59:59 CET 2018 International Filing Date: Wed May 02 01:59:59 CEST 2018
IPC: C12Q 1/68
G01N 33/53
G01N 33/543
Applicants: THE BOARD OF TRUSTEES OF THE LELAND STANFORD JUNIOR UNIVERSITY
DANMARKS TEKNISKE UNIVERSITET
Inventors: LEE, Jung-Rok
WANG, Shan, X.
HANSEN, Mikkel, F.
DUFVA, Martin
RIZZI, Giovanni
Title: PROFILAGE DE MÉTHYLATION D'ADN À L'AIDE D'UN RÉSEAU DE BIOCAPTEURS MAGNÉTORÉSISTIFS
Abstract:
L'invention concerne un procédé de détection de méthylation fournissant une description quantitative de la densité de méthylation dans des brins d'ADN. Une conversion au bisulfite [100] des brins d'ADN contenant des sites méthylés et non méthylés crée des brins d'ADN convertis présentant des paires de bases mésappariées. Les brins d'ADN convertis sont amplifiés par PCR [102] et des brins d'ADN cibles monobrins sont marqués magnétiquement [104] et hybridés [106] avec des brins d'ADN complémentaires immobilisés sur un réseau de capteurs magnétorésistifs (MR). Pendant l'hybridation, un signal de liaison peut être enregistré. Une condition de stringence telle que la température ou la concentration en sel est augmentée [108] pour provoquer la dénaturation des brins d'ADN cibles monobrins marqués magnétiquement à partir des brins d'ADN complémentaires immobilisés sur un réseau de capteurs magnétorésistifs (MR). Pendant l'augmentation de la condition de stringence, un signal de dénaturation résultant des brins d'ADN cibles monobrins marqués magnétiquement dénaturés est enregistré [110] en temps réel et utilisé pour déterminer des conditions de stringence [112] de brins d'ADN méthylés et non méthylés. Les brins d'ADN peuvent également contenir des gènes de type sauvage et des gènes mutés, de telle sorte que des sites de mutation peuvent être déterminés simultanément avec des sites de méthylation.