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1. (WO2018037231) PROCÉDÉS D'IDENTIFICATION D'INSTABILITÉ DE MICRO-SATELLITE
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N° de publication : WO/2018/037231 N° de la demande internationale : PCT/GB2017/052488
Date de publication : 01.03.2018 Date de dépôt international : 23.08.2017
CIB :
C12Q 1/68
C CHIMIE; MÉTALLURGIE
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BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
Q
PROCÉDÉS DE MESURE, DE RECHERCHE OU D'ANALYSE FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
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Procédés de mesure, de recherche ou d'analyse faisant intervenir des enzymes ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
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faisant intervenir des acides nucléiques
Déposants :
THE UNIVERSITY OF NEWCASTLE UPON TYNE [GB/GB]; King's Gate Newcastle Upon Tyne Tyne and Wear NE1 7RU, GB
Inventeurs :
BURN, John; GB
ALHILAL, Mohammed Ghanim Mehdi; IQ
SANTIBANEZ-KOREF, Franscisco Mauro; GB
REDFORD, Lisa; NO
JACKSON, Michael Stewart; GB
Mandataire :
HGF LTD; Document Handling (HGF) York 1 City Walk Leeds Yorkshire LS11 9DX, GB
Données relatives à la priorité :
1614474.324.08.2016GB
Titre (EN) METHODS OF IDENTIFYING MICROSATELLITE INSTABILITY
(FR) PROCÉDÉS D'IDENTIFICATION D'INSTABILITÉ DE MICRO-SATELLITE
Abrégé :
(EN) The present invention relates to methods and kits for identifying microsatellite instability (MSI) in a sample. In particular it relates to identifying microsatellite instability in a tumor sample, which may be from a subject suspected of having colorectal cancer or Lynch syndrome. The methods and kits can be used to identify mismatch repair defects. More particularly the invention relates to a panel of markers for a sequencing based MSI test, that can differentiate between MSI-H and MSS CRCs. The invention also allows for determination of biological significance, differentiating between PCR and sequencing errors and MSI induced indels/mutations.
(FR) La présente invention a pour objet des procédés et des nécessaires qui permettent d'identifier l'instabilité de micro-satellite (MSI) dans un échantillon. En particulier, l'invention concerne l'identification de l'instabilité de micro-satellite dans un échantillon de tumeur, qui peut provenir d'un sujet soupçonné de présenter un cancer colorectal ou un syndrome de Lynch. Les procédés et les nécessaires peuvent être utilisés pour identifier des défauts de réparation de mésappariements. Plus particulièrement, l'invention concerne une liste de marqueurs pour un test MSI fondé sur un séquençage, qui permet de différencier la MSI-H des MSS CRC. L'invention permet également de déterminer l'importance biologique, la différenciation entre des erreurs de PCR et de séquençage et des indels/mutations induites par des MSI.
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États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)