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1. (WO2016190654) OLIGONUCLÉOTIDE À DOUBLE FONCTION, COMPRENANT UNE SÉQUENCE NUCLÉOTIDIQUE COMPLÉMENTAIRE, UNE SÉQUENCE NUCLÉOTIDIQUE MÉSAPPARIÉE, UN RAPPORTEUR ET UN EXTINCTEUR ET PROCÉDÉS POUR L'AMPLIFICATION D'ACIDES NUCLÉIQUES ET LA MESURE L'UTILISANT
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N° de publication : WO/2016/190654 N° de la demande internationale : PCT/KR2016/005517
Date de publication : 01.12.2016 Date de dépôt international : 25.05.2016
CIB :
C12Q 1/68 (2006.01)
C CHIMIE; MÉTALLURGIE
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BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
Q
PROCÉDÉS DE MESURE, DE RECHERCHE OU D'ANALYSE FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1
Procédés de mesure, de recherche ou d'analyse faisant intervenir des enzymes ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
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faisant intervenir des acides nucléiques
Déposants :
에스디 바이오센서 주식회사 SD BIOSENSOR, INC. [KR/KR]; 경기도 수원시 영통구 덕영대로 1556번길 16 디지털엠파이어씨동 4,5층 (영통동) (Yeongtong-dong) C-4&5Floor, Digitalempirebuilding 16,Deogyeong-daero 1556beon-gil, Yeongtong-gu Suwon-si Gyeonggi-do 16690, KR
Inventeurs :
원유덕 WON, Yoo Deok; KR
박해준 PARK, Hae Joon; KR
성효진 SEONG, Hyo Jin; KR
이선영 LEE, Sun Young; KR
Mandataire :
특허법인 피너클 PINNACLE IP&LAW FIRM; 서울시 강남구 테헤란로 238 15층 15F 238, Teheran-ro Gangnam-gu Seoul 06221, KR
Données relatives à la priorité :
10-2015-007497228.05.2015KR
Titre (EN) DOUBLE-FUNCTIONAL OLIGONUCLEOTIDE COMPRISING COMPLEMENTARY NUCLEOTIDE SEQUENCE, MIS-MATCHED NUCLEOTIDE SEQUENCE, REPORTER, AND QUENCHER, AND METHODS FOR NUCLEIC ACID AMPLIFICATION AND MEASUREMENT USING SAME
(FR) OLIGONUCLÉOTIDE À DOUBLE FONCTION, COMPRENANT UNE SÉQUENCE NUCLÉOTIDIQUE COMPLÉMENTAIRE, UNE SÉQUENCE NUCLÉOTIDIQUE MÉSAPPARIÉE, UN RAPPORTEUR ET UN EXTINCTEUR ET PROCÉDÉS POUR L'AMPLIFICATION D'ACIDES NUCLÉIQUES ET LA MESURE L'UTILISANT
(KO) 상보적 염기서열과 미스-매치된 염기서열 그리고 REPORTER와 QUENCHER를 포함하는 이중 기능성 올리고뉴클레오타이드 및 이를 이용한 핵산 증폭 및 측정 방법
Abrégé :
(EN) The present invention relates to a complementary double-stranded oligo, wherein, for the amplification of a particular gene sequence, an inosine linker is linked to the 5'-terminus of a primer for the corresponding sequence, a sequence complementary to the primer is linked to the inosine linker, and at least one mis-matched nucleotide is included in the complementary sequence to form a bubble structure; wherein, depending on the treatment temperature, at a predetermined temperature or lower, a single stranded oligo is turned into a double-stranded form to exist in an inactivation form, and at a predetermined temperature or higher, the oligo is activated into a single-stranded oligo; and wherein, a fluorescent substance (reporter dye) and a quenching material (quencher molecule) are attached to the oligo, so that the oligo can be applied as a primer or a probe, and thus only two oligos can realize the gene amplification and fluorescent signal real-time measurement with high specificity, and to a measuring method after a fluorescent arrangement step using the oligomer is added. The present invention has advantages in view of an oligo and a design method therefor, wherein an oligo capable of simultaneously performing amplification and detection with an amplification size of 500 bp to 1000 bp for a particular gene is used to allow a reporter dye and a quencher molecule to be attached to only two target gene amplification sites, thereby confirming whether real-time amplification occurs.
(FR) La présente invention concerne un oligo double brin complémentaire, où, pour l'amplification d'une séquence génique particulière, une lieur inosine est lié à l'extrémité 5' d'une amorce pour la séquence correspondante, une séquence complémentaire à l'amorce est liée au lieur inosine et au moins un nucléotide mésapparié est inclus dans la séquence complémentaire pour former une structure à bulles ; où, en fonction de la température du traitement, à une température prédéterminée ou inférieure, un oligo monobrin est transformé en une forme à double brin de manière à exister dans une forme d'inactivation, et à une température prédéterminée ou supérieure, l'oligo est activé en un oligo simple brin ; et où une substance fluorescente (colorant rapporteur) et un matériau d'extinction (molécule d'extincteur) sont fixés à l'oligo, de sorte que l'oligo peut être appliqué comme amorce ou comme sonde et, par conséquent, seulement deux oligos peuvent réaliser l'amplification génique et la mesure du signal fluorescent en temps réel avec une spécificité élevée ; et un procédé de mesure après l'addition d'une étape d'agencement de fluorescence utilisant l'oligomère. La présente invention présente des avantages en vue d'un oligo et d'un procédé de conception correspondant, un oligo, pouvant effectuer simultanément une amplification et une détection, avec une dimension d'amplification de 500 pb à 1000 pb pour un gène particulier, étant utilisé pour permettre la fixation d'un colorant rapporteur et d'une molécule extinctrice à seulement deux sites d'amplification de gène cible, ce qui permet de confirmer si l'amplification en temps réel se produit.
(KO) 본 발명은 특정 유전자 서열 증폭을 위해 해당서열에 대한 프라이머의 5' 말단에 이노신(inosine) 링커(linker)를 연결하고 프라이머와 상보적인 서열을 연결하고 이 부위에 하나 이상의 미스-매칭(mis-matching) 뉴클레오타이드를 포함하여 버블 구조를 이루는 상보적인 이중가닥 올리고로 처리 온도에 따라 단일가닥 올리고가 일정온도 이하에서 이중가닥 형태로 불활성화 형태로 존재하고 일정온도 이상에서 단일가닥 올리고로 활성화하는 올리고로 형광물질(리포터 염료)과 소광물질(퀀처 분자)을 부착시켜 primer 또는 probe로써도 적용 가능하여 두 개의 올리고만으로도 특이도가 높은 유전자 증폭 및 형광 시그널 실시간 측정이 가능한 올리고이며 이를 이용한 형광 배열 단계를 추가하여 이후 측정하는 방법에 관한 것이다. 본 발명은 특정 유전자의 증폭 크기를 50bp부터 1000bp까지 증폭 및 검출이 동시에 수행될 수 있는 올리고를 이용하여 두 부위의 target 유전자 증폭 부위만으로 리포터 염료와 퀀저 분자가 부착되어 실시간 증폭 여부를 확인 가능한 올리고 및 설계 방법에 장점이 있다.
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Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
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Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Langue de publication : coréen (KO)
Langue de dépôt : coréen (KO)