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1. (WO2016189065) MÉTHODE ET SYSTÈME D'ÉVALUATION DE LA QUALITÉ DE LA COLORATION POUR L'IMMUNOCYTOCHIMIE ET L'HYBRIDATION IN SITU
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication : WO/2016/189065 N° de la demande internationale : PCT/EP2016/061859
Date de publication : 01.12.2016 Date de dépôt international : 25.05.2016
CIB :
G06K 9/00 (2006.01) ,G01N 1/30 (2006.01)
G PHYSIQUE
06
CALCUL; COMPTAGE
K
RECONNAISSANCE DES DONNÉES; PRÉSENTATION DES DONNÉES; SUPPORTS D'ENREGISTREMENT; MANIPULATION DES SUPPORTS D'ENREGISTREMENT
9
Méthodes ou dispositions pour la lecture ou la reconnaissance de caractères imprimés ou écrits ou pour la reconnaissance de formes, p.ex. d'empreintes digitales
G PHYSIQUE
01
MÉTROLOGIE; ESSAIS
N
RECHERCHE OU ANALYSE DES MATÉRIAUX PAR DÉTERMINATION DE LEURS PROPRIÉTÉS CHIMIQUES OU PHYSIQUES
1
Echantillonnage; Préparation des éprouvettes pour la recherche
28
Préparation d'échantillons pour l'analyse
30
Teinture; Imprégnation
Déposants :
VENTANA MEDICAL SYSTEMS, INC. [US/US]; 1910 Innovation Park Drive Tucson, Arizona 85755, US
F. HOFFMANN-LA ROCHE AG [CH/CH]; Grenzacherstraße 124 4070 Basel, CH (CL)
Inventeurs :
GARSHA, Karl; US
OTTER, Michael; US
STEVENS, Benjamin; US
TAFT, Jefferson; US
VENTURA, Frank; US
Mandataire :
RICHARDT PATENTANWÄLTE PARTG MBB; Wilhelmstraße 7 65185 Wiesbaden, DE
Données relatives à la priorité :
62/166,15526.05.2015US
62/328,04127.04.2016US
Titre (EN) METHOD AND SYSTEM FOR ASSESSING STAIN QUALITY FOR IN-SITU HYBRIDIZATION AND IMMUNOHISTOCHEMISTRY
(FR) MÉTHODE ET SYSTÈME D'ÉVALUATION DE LA QUALITÉ DE LA COLORATION POUR L'IMMUNOCYTOCHIMIE ET L'HYBRIDATION IN SITU
Abrégé :
(EN) Immunohistochemistry (IHC) and in situ hybridization (ISH) have the aim of detecting, localizing and quantifying certain analytes for various diagnostic purposes. The quality of the stains which are analyzed may deviate for various reasons. Therefore, the present invention provides a method and system for assessing the stain quality and for establishing objective criteria for assessing the stain quality for application in the fields of in-situ hybridization and immunohistochemistry. In one possible embodiment, the invention comprises the steps of unmixing multi-spectral image data of a tissue specimen to obtain analyte intensity images, each analyte intensity image comprising signals from a single stain, computing metrics based on the analyte intensity images, wherein the metrics are uniformity, distribution and/or dispersion of pixel intensity values in the analyte intensity images and assessing a stain quality of a slide by comparing the computed metrics to pre-determined cutoff values regarding uniformity, distribution and/or dispersion of pixel intensity, wherein the stain quality of the slide is assessed as acceptable if the computed metrics meet or exceed the pre-determined cutoff values, and wherein the stain quality of the slide is assessed as unacceptable if the computed metrics do not meet the pre-determined cutoff values. In order to establish objective criteria for assessing stain quality, in one possible embodiment, the method and system includes the step of deriving cut-off values for uniformity, distribution and/or dispersion of pixel intensity by combining the computed metrics based on the analyte intensity images with pre-established data quantifying the stain quality.
(FR) L'immunocytochimie (IHC) et l'hybridation in situ (ISH) ont pour but de détecter, localiser et quantifier certains analytes à diverses fins de diagnostic. La qualité des colorants qui sont analysés peut varier pour diverses raisons. Par conséquent, la présente invention concerne une méthode et un système pour l'évaluation de la qualité de la coloration et l'établissement des critères objectifs pour l'évaluation de la qualité de la coloration, dans le cadre d'une application dans les domaines de l'immunocytochimie et de l'hybridation in situ. Dans un mode de réalisation possible, l'invention comprend les étapes consistant à séparer des données d'images multi-spectrales provenant d'un échantillon de tissu afin d'obtenir des images d'intensité d'analyte, chaque image d'intensité d'analyte comprenant des signaux provenant d'une coloration unique, calculer des paramètres sur la base des images d'intensité d'analyte, les paramètres étant l'uniformité, la répartition et/ou la dispersion des valeurs d'intensité de pixels dans les images d'intensité d'analyte, et évaluer la qualité de la coloration d'une lame en comparant les paramètres calculés à des valeurs seuils pré-définies concernant l'uniformité, la répartition et/ou la dispersion des valeurs d'intensité de pixels, la qualité de la coloration de la lame étant évaluée comme étant acceptable si les paramètres calculés satisfont ou dépassent les valeurs seuils pré-définies, et la qualité de la coloration de la lame étant évaluée comme inacceptable si les paramètres calculés ne satisfont pas aux valeurs seuils pré-définies. Afin d'établir des critères objectifs d'évaluation de la qualité de la coloration, dans un mode de réalisation possible, la méthode et le système comprennent une étape consistant à dériver des valeurs seuils pour l'uniformité, la répartition et/ou la dispersion de l'intensité des pixels en associant les paramètres calculés sur la base des images d'intensité d'analyte avec des données pré-définies quantifiant la qualité de la coloration.
front page image
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)