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1. (WO2016141077) SYSTÈMES, APPAREILS ET PROCÉDÉS BIOINFORMATIQUES EXÉCUTÉS SUR UNE PLATE-FORME DE TRAITEMENT À CIRCUITS INTÉGRÉS
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication : WO/2016/141077 N° de la demande internationale : PCT/US2016/020480
Date de publication : 09.09.2016 Date de dépôt international : 02.03.2016
CIB :
G06F 19/00 (2011.01) ,G06F 19/10 (2011.01) ,G06F 19/22 (2011.01) ,G06N 3/00 (2006.01)
Déposants : EDICO GENOME, INC.[US/US]; 3344 North Torrey Pines Court Plaza Level La Jolla, CA 92037, US
Inventeurs : VAN ROOYEN, Pieter; US
RUEHLE, Michael; US
MCMILLEN, Robert, J.; US
HAHM, Mark; US
Mandataire : LATTA, Robert, T., S.; US
Données relatives à la priorité :
62/127,23202.03.2015US
Titre (EN) BIOINFORMATICS SYSTEMS, APPARATUSES, AND METHODS EXECUTED ON AN INTEGRATED CIRCUIT PROCESSING PLATFORM
(FR) SYSTÈMES, APPAREILS ET PROCÉDÉS BIOINFORMATIQUES EXÉCUTÉS SUR UNE PLATE-FORME DE TRAITEMENT À CIRCUITS INTÉGRÉS
Abrégé : front page image
(EN) A system, method and apparatus for executing a sequence analysis pipeline on genetic sequence data includes an integrated circuit formed of a set of hardwired digital logic circuits that are interconnected by physical electrical interconnects. The hardwired digital logic circuits are arranged as a set of processing engines, each processing engine being formed of a subset of the hardwired digital logic circuits to perform one or more steps in the sequence analysis pipeline on the reads of genomic data. In various instances, each subset of the hardwired digital logic circuits may be formed in a wired configuration to perform one or more steps a variant call operation.
(FR) L'invention concerne un système, un procédé et un appareil destinés à exécuter un pipeline d'analyse de séquence sur des données de séquence génétique et comprenant un circuit intégré formé d'un ensemble de circuits logiques numériques fixes qui sont interconnectés par des interconnexions électriques physiques. Les circuits logiques numériques fixes sont agencés comme un ensemble de moteurs de traitement, chaque moteur de traitement étant formé d'un sous-ensemble des circuits logiques numériques fixes pour réaliser une ou plusieurs étapes du pipeline d'analyse de séquence sur les lectures de données génomiques. Dans divers cas, chaque sous-ensemble des circuits logiques numériques fixes peut être formé dans une configuration câblée pour réaliser une ou plusieurs étapes d'une variante d'opération d'appel.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)