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1. WO2014028778 - PROCÉDÉS ET COMPOSITIONS POUR LA RÉDUCTION DE LA CONTAMINATION D'UNE BANQUE GÉNÉTIQUE

Numéro de publication WO/2014/028778
Date de publication 20.02.2014
N° de la demande internationale PCT/US2013/055205
Date du dépôt international 15.08.2013
CIB
C40B 40/06 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
40TECHNOLOGIE COMBINATOIRE
BCHIMIE COMBINATOIRE; BIBLIOTHÈQUES, p.ex. CHIMIOTHÈQUES, BIBLIOTHÈQUES VIRTUELLES (IN SILICO)
40Bibliothèques en soi, p.ex. matrices, mélanges
04Bibliothèques comprenant uniquement des composés organiques
06Bibliothèques comprenant des nucléotides ou des polynucléotides ou leurs dérivés
C40B 40/08 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
40TECHNOLOGIE COMBINATOIRE
BCHIMIE COMBINATOIRE; BIBLIOTHÈQUES, p.ex. CHIMIOTHÈQUES, BIBLIOTHÈQUES VIRTUELLES (IN SILICO)
40Bibliothèques en soi, p.ex. matrices, mélanges
04Bibliothèques comprenant uniquement des composés organiques
06Bibliothèques comprenant des nucléotides ou des polynucléotides ou leurs dérivés
08Bibliothèques comprenant de l'ARN ou de l'ADN codant des protéines, p.ex. bibliothèques de gènes
C40B 30/04 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
40TECHNOLOGIE COMBINATOIRE
BCHIMIE COMBINATOIRE; BIBLIOTHÈQUES, p.ex. CHIMIOTHÈQUES, BIBLIOTHÈQUES VIRTUELLES (IN SILICO)
30Procédés de criblage des bibliothèques
04en mesurant l'aptitude spécifique à se lier à une molécule cible, p.ex. liaison anticorps-antigène, liaison récepteur-ligand
C12P 19/34 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
PPROCÉDÉS DE FERMENTATION OU PROCÉDÉS UTILISANT DES ENZYMES POUR LA SYNTHÈSE D'UN COMPOSÉ CHIMIQUE DONNÉ OU D'UNE COMPOSITION DONNÉE, OU POUR LA SÉPARATION D'ISOMÈRES OPTIQUES À PARTIR D'UN MÉLANGE RACÉMIQUE
19Préparation de composés contenant des radicaux saccharide
26Préparation d'hydrates de carbone contenant de l'azote
28N-glucosides
30Nucléotides
34Polynucléotides, p.ex. acides nucléiques, oligoribonucléotides
C07H 21/04 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
07CHIMIE ORGANIQUE
HSUCRES; LEURS DÉRIVÉS; NUCLÉOSIDES; NUCLÉOTIDES; ACIDES NUCLÉIQUES
21Composés contenant au moins deux unités mononucléotide comportant chacune des groupes phosphate ou polyphosphate distincts liés aux radicaux saccharide des groupes nucléoside, p.ex. acides nucléiques
04avec le désoxyribosyle comme radical saccharide
CPC
C12N 15/1093
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
15Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
09Recombinant DNA-technology
10Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
1034Isolating an individual clone by screening libraries
1093General methods of preparing gene libraries, not provided for in other subgroups
C12Q 1/6855
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6844Nucleic acid amplification reactions
6853using modified primers or templates
6855Ligating adaptors
Déposants
  • NATERA, INC. [US]/[US]
Inventeurs
  • PROSEN, Dennis
  • BANER, Johan
  • HUNKAPILLER, Nathan
  • HILL, Matthew
  • ZIMMERMANN, Bernhard
Mandataires
  • SCHEID, Robert E.
Données relatives à la priorité
61/683,33115.08.2012US
61/790,22215.03.2013US
Langue de publication anglais (EN)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) METHODS AND COMPOSITIONS FOR REDUCING GENETIC LIBRARY CONTAMINATION
(FR) PROCÉDÉS ET COMPOSITIONS POUR LA RÉDUCTION DE LA CONTAMINATION D'UNE BANQUE GÉNÉTIQUE
Abrégé
(EN)
Embodiments include methods, compositions, and kits for creating genetic libraries useful for massively parallel genetic sequencing. Some embodiments are directed to methods of preventing the contamination of genetic libraries with material generated during the formation of other genetic libraries. In some embodiments, the methods employ adapters comprising universal priming sites. The methods can employ non-ligatable primers to generate non-ligatable amplification products so as to prevent unwanted ligation to adapters. In some embodiments, the non-ligatable primers contain uracil. Genetic material can be treated with uracil N glycosylase to prevent the unwanted ligation of uracil containing amplicons to adapters used for creating a second genetic library.
(FR)
Des modes de réalisation de l'invention concernent des procédés, des compositions et des trousses pour la création de banques génétiques utiles pour le séquençage génétique massivement parallèle. Certains modes de réalisation concernent des méthodes de prévention de la contamination de banques génétiques par une matière générée au cours de la formation d'autres banques génétiques. Dans certains modes de réalisation, les procédés utilisent des adaptateurs comprenant des sites d'amorçage universels. Les procédés peuvent utiliser des amorces non ligaturables pour générer des produits d'amplification non ligaturables afin de prévenir une ligature indésirable à des adaptateurs. Dans certains modes de réalisation, les amorces non ligaturables contiennent de l'uracile. La matière génétique peut être traitée par de l'uracile N-glycosylase pour prévenir la ligature indésirable d'amplicons contenant de l'uracile à des adaptateurs utilisés pour la création d'une seconde banque génétique.
Également publié en tant que
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