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1. WO2012009952 - PROCÉDÉ DE CONTRÔLE DE QUALITÉ ET APPAREIL POUR LE SÉQUENÇAGE D'ARN D'EXPRESSION GÉNIQUE

Numéro de publication WO/2012/009952
Date de publication 26.01.2012
N° de la demande internationale PCT/CN2011/001158
Date du dépôt international 13.07.2011
CIB
C12Q 1/68 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
QPROCÉDÉS DE MESURE OU DE TEST FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES, DES ACIDES NUCLÉIQUES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
68faisant intervenir des acides nucléiques
CPC
G16B 25/00
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
25ICT specially adapted for hybridisation; ICT specially adapted for gene or protein expression
Déposants
  • 深圳华大基因科技有限公司 BGI SHENZHEN CO., LIMITED [CN/CN]; 中国广东省深圳市盐田区北山路146号北山工业区综合楼 Main Building, Beishan Industrial Zone No.146 Beishan Road, Yantian District Shenzhen, Guangdong 518083, CN (AllExceptUS)
  • 彭智宇 PENG, Zhiyu [CN/CN]; CN (UsOnly)
  • 韩祖晶 HAN, Zujing [CN/CN]; CN (UsOnly)
  • 李英睿 LI, Yingrui [CN/CN]; CN (UsOnly)
  • 王俊 WANG, Jun [CN/CN]; CN (UsOnly)
Inventeurs
  • 彭智宇 PENG, Zhiyu; CN
  • 韩祖晶 HAN, Zujing; CN
  • 李英睿 LI, Yingrui; CN
  • 王俊 WANG, Jun; CN
Mandataires
  • 北京北翔知识产权代理有限公司 PEKSUNG INTELLECTUAL PROPERTY LTD.; 中国北京市海淀区学院路35号世宁大厦908室 908 Shining Tower 35 Xueyuan Road Haidian District Beijing 100191, CN
Données relatives à la priorité
201010236176.922.07.2010CN
Langue de publication chinois (ZH)
Langue de dépôt chinois (ZH)
États désignés
Titre
(EN) QUALITY CONTROL METHOD AND APPARATUS FOR RNA SEQUENCING OF GENE EXPRESSION
(FR) PROCÉDÉ DE CONTRÔLE DE QUALITÉ ET APPAREIL POUR LE SÉQUENÇAGE D'ARN D'EXPRESSION GÉNIQUE
(ZH) 关于基因表达的RNA测序质控方法及装置
Abrégé
(EN)
Disclosed is a quality control method and apparatus for RNA sequencing of gene expression, which method comprises: performing respectively DGE and RNA-Seq analyses on sequencing fragments obtained by the sequencing technology; performing respectively correlative analyses on the results from the DGE analysis and that from the transcriptome analysis with the results from the qPCR; judging the quantitative differences in the gene expression between the DGE analysis and the transcriptome analysis according to the results of the correlative analysis, then selecting a sequencing analysis mode from among the DGE analysis and the transcriptome analysis, selecting one million lines of tag data (1M reads) from the analysis results obtained by the selected sequencing analysis mode, and performing a sequencing stability analysis of the gene expression.
(FR)
La présente invention concerne un procédé de contrôle de qualité et un appareil pour le séquençage d'ARN d'expression génique, ledit procédé comprenant : la conduite respectivement d'analyses DGE et ARN-Seq sur des fragments de séquençage obtenus par la technologie de séquençage ; la conduite respectivement d'analyses de corrélation sur les résultats de l'analyse DGE et ceux de l'analyse de transcriptome avec les résultats de qPCR ; l'estimation des différences quantitatives d'expression génique entre l'analyse DGE et l'analyse de transcriptome en fonction des résultats de l'analyse de corrélation, puis la sélection d'un mode d'analyse de séquençage de l'analyse DGE et d'analyse de transcriptome, la sélection d'un million de données d'étiquette (1 M lectures) à partir des résultats d'analyse obtenus par le mode d'analyse de séquençage sélectionné, et la conduite d'une analyse de stabilité de séquençage de l'expression génique.
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international