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Paramétrages

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1. WO2012009721 - PAIRES ORTHOGONALES D'ACIDES NUCLÉIQUES PAR AFFINITÉ

Numéro de publication WO/2012/009721
Date de publication 19.01.2012
N° de la demande internationale PCT/US2011/044375
Date du dépôt international 18.07.2011
CIB
G06F 19/20 2011.01
GPHYSIQUE
06CALCUL; COMPTAGE
FTRAITEMENT ÉLECTRIQUE DE DONNÉES NUMÉRIQUES
19Équipement ou méthodes de traitement de données ou de calcul numérique, spécialement adaptés à des applications spécifiques
10Bio-informatique, c. à d. procédés ou systèmes pour le traitement de données génétiques ou se rapportant aux protéines en biologie moléculaire informatique
20pour l'hybridation ou l'expression génique, p.ex. microréseaux, séquençage par hybridation, normalisation, profilage, modèles de correction de bruit, estimation du ratio d'expression, conception ou optimisation de sonde
G01N 33/50 2006.01
GPHYSIQUE
01MÉTROLOGIE; TESTS
NRECHERCHE OU ANALYSE DES MATÉRIAUX PAR DÉTERMINATION DE LEURS PROPRIÉTÉS CHIMIQUES OU PHYSIQUES
33Recherche ou analyse des matériaux par des méthodes spécifiques non couvertes par les groupes G01N1/-G01N31/146
48Matériau biologique, p.ex. sang, urine; Hémocytomètres
50Analyse chimique de matériau biologique, p.ex. de sang ou d'urine; Test par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligands; Test immunologique
CPC
G16B 25/00
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
25ICT specially adapted for hybridisation; ICT specially adapted for gene or protein expression
Déposants
  • ELITECH HOLDING B.V. [NL/NL]; Van Rensselaerweg 4 NL-6956 AV Spankeren, NL (AllExceptUS)
  • SCARR, Noah [US/US]; US (UsOnly)
  • LUKHTANOV, Eugeny, A. [US/US]; US (UsOnly)
Inventeurs
  • SCARR, Noah; US
  • LUKHTANOV, Eugeny, A.; US
Mandataires
  • BORRELLI, Sara, K.; Jackson Walker L.L.P. 901 Main Street, Suite 6000 Dallas, TX 75202, US
Données relatives à la priorité
61/365,21916.07.2010US
Langue de publication anglais (EN)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) ORTHOGONAL NUCLEIC ACID AFFINITY PAIRS
(FR) PAIRES ORTHOGONALES D'ACIDES NUCLÉIQUES PAR AFFINITÉ
Abrégé
(EN)
The invention provides methods to identify pRNA- and pDNA oligomer affinity pairs. Affinity pairs comprised of nucleic acid oligomers which demonstrate no cross-reactivity ("orthogonal") are designed using software and empirically verified by thermodynamic study and lateral flow testing. The design software uses a semi-random algorithm to build such sequences of nucleic acid oligomers based on user-input parameters for affinity strength and orthogonal stringency. These pairs can be applied for use in multi-analyte solid support and lateral flow diagnostic tests.
(FR)
La présente invention concerne des procédés d'identification de paires d'oligomères pARN et pADN par affinité. Les paires par affinité composées d'oligomères d'acides nucléiques ne présentant aucune réactivité croisée (« orthogonale ») sont conçues en utilisant un logiciel et vérifiées de manière empirique par une étude thermodynamique et un test d'écoulement latéral. Le logiciel de conception utilise un algorithme semi-aléatoire pour construire de telles séquences d'oligomères d'acides nucléiques en se basant sur les paramètres entrés par l'utilisateur pour l'intensité de l'affinité et la stringence orthogonale. Ces paires peuvent être appliquées à une utilisation dans un support solide multi-analyte et des tests de diagnostic de l'écoulement latéral.
Également publié en tant que
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