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1. WO2012005595 - STRATÉGIES DE SÉQUENÇAGE DE LA RÉGION GÉNOMIQUE D'INTÉRÊT V3-D

Numéro de publication WO/2012/005595
Date de publication 12.01.2012
N° de la demande internationale PCT/NL2011/050504
Date du dépôt international 08.07.2011
CIB
C12Q 1/68 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
QPROCÉDÉS DE MESURE OU DE TEST FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES, DES ACIDES NUCLÉIQUES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
68faisant intervenir des acides nucléiques
CPC
C12N 15/11
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
15Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
09Recombinant DNA-technology
11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof
C12Q 1/6855
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6844Nucleic acid amplification reactions
6853using modified primers or templates
6855Ligating adaptors
C12Q 1/6869
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6869Methods for sequencing
C12Q 2521/301
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
2521Reaction characterised by the enzymatic activity
30Phosphoric diester hydrolysing, i.e. nuclease
301Endonuclease
C12Q 2521/501
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
2521Reaction characterised by the enzymatic activity
50Other enzymatic activities
501Ligase
C12Q 2523/101
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
2523Reactions characterised by treatment of reaction samples
10Characterised by chemical treatment
101Crosslinking agents, e.g. psoralen
Déposants
  • CERGENTIS B.V. [NL/NL]; 8, Uppsalalaan NL-3584 CT Utrecht, NL (AllExceptUS)
  • KONINKLIJKE ACADEMIE VAN WETENSCHAPPEN [NL/NL]; 29, Kloveniersburgwal NL-1011 JV Amsterdam, NL (AllExceptUS)
  • VAN MIN, Max, Jan [NL/NL]; NL (UsOnly)
  • DE LAAT, Wouter, Leonard [NL/NL]; NL (UsOnly)
Inventeurs
  • VAN MIN, Max, Jan; NL
  • DE LAAT, Wouter, Leonard; NL
Mandataires
  • DE LANG, R.J.; Exter Polak & Charlouis B.V. P.O. Box 3241 NL-2280 GE Rijswijk, NL
Données relatives à la priorité
61/362,77809.07.2010US
Langue de publication anglais (EN)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) 3-D GENOMIC REGION OF INTEREST SEQUENCING STRATEGIES
(FR) STRATÉGIES DE SÉQUENÇAGE DE LA RÉGION GÉNOMIQUE D'INTÉRÊT V3-D
Abrégé
(EN)
The invention relates to methods for determining the sequence of a genomic region of interest comprising a target nucleotide sequence comprising, fragmenting a crosslinked DNA, ligating the fragmented cross linked DNA, reversing the crosslinking and determining at least part of the sequences of ligated DNA fragments which comprise a target nucleotide sequence.
(FR)
Cette invention concerne des procédés permettant de déterminer la séquence d'une région génomique d'intérêt comprenant une séquence de nucléotides cible, lesdits procédés comprenant la fragmentation d'un ADN réticulé, la ligature de l'ADN réticulé fragmenté, l'inversion de la réticulation et la détermination d'au moins une partie des séquences des fragments d'ADN ligaturés qui comprennent une séquence de nucléotides cible.
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