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1. WO2012000095 - MÉTHODES D'ANALYSE DE KINOME

Numéro de publication WO/2012/000095
Date de publication 05.01.2012
N° de la demande internationale PCT/CA2011/000764
Date du dépôt international 30.06.2011
CIB
C04B 30/02 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
04CIMENTS; BÉTON; PIERRE ARTIFICIELLE; CÉRAMIQUES; RÉFRACTAIRES
BCHAUX; MAGNÉSIE; SCORIES; CIMENTS; LEURS COMPOSITIONS, p.ex. MORTIERS, BÉTON OU MATÉRIAUX DE CONSTRUCTION SIMILAIRES; PIERRE ARTIFICIELLE; CÉRAMIQUES; RÉFRACTAIRES; TRAITEMENT DE LA PIERRE NATURELLE
30Compositions pour pierre artificielle, ne contenant pas de liants
02contenant des matières fibreuses
G01N 33/68 2006.01
GPHYSIQUE
01MÉTROLOGIE; TESTS
NRECHERCHE OU ANALYSE DES MATÉRIAUX PAR DÉTERMINATION DE LEURS PROPRIÉTÉS CHIMIQUES OU PHYSIQUES
33Recherche ou analyse des matériaux par des méthodes spécifiques non couvertes par les groupes G01N1/-G01N31/146
48Matériau biologique, p.ex. sang, urine; Hémocytomètres
50Analyse chimique de matériau biologique, p.ex. de sang ou d'urine; Test par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligands; Test immunologique
68faisant intervenir des protéines, peptides ou amino-acides
G06F 19/10 2011.01
GPHYSIQUE
06CALCUL; COMPTAGE
FTRAITEMENT ÉLECTRIQUE DE DONNÉES NUMÉRIQUES
19Équipement ou méthodes de traitement de données ou de calcul numérique, spécialement adaptés à des applications spécifiques
10Bio-informatique, c. à d. procédés ou systèmes pour le traitement de données génétiques ou se rapportant aux protéines en biologie moléculaire informatique
CPC
G16B 25/00
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
25ICT specially adapted for hybridisation; ICT specially adapted for gene or protein expression
G16B 40/00
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
40ICT specially adapted for biostatistics; ICT specially adapted for bioinformatics-related machine learning or data mining, e.g. knowledge discovery or pattern finding
G16B 5/00
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
5ICT specially adapted for modelling or simulations in systems biology, e.g. gene-regulatory networks, protein interaction networks or metabolic networks
G16B 99/00
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
99Subject matter not provided for in other groups of this subclass
Déposants
  • KUSALIK, Tony [CA/CA]; CA
  • LI, Yue [CN/CA]; CA
  • NAPPER, Scott [CA/CA]; CA
  • GRIEBEL, Philip [CA/CA]; CA
  • ARSENAULT, Ryan [CA/CA]; CA
Inventeurs
  • KUSALIK, Tony; CA
  • LI, Yue; CA
  • NAPPER, Scott; CA
  • GRIEBEL, Philip; CA
  • ARSENAULT, Ryan; CA
Mandataires
  • BERESKIN & PARR LLP/S.E.N.C.R.L., S.R.L.; 40 King Street West 40th Floor Toronto, Ontario M5H 3Y2, CA
Données relatives à la priorité
61/360,17730.06.2010US
61/434,15619.01.2011US
Langue de publication anglais (EN)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) METHODS OF KINOME ANALYSIS
(FR) MÉTHODES D'ANALYSE DE KINOME
Abrégé
(EN)
Method for analyzing phosphorylation data of a plurality of peptides are provided, the method comprising obtaining one or more datasets, each dataset comprising a phosphorylation signal intensity for each replicate of the plurality of peptides for a sample; transforming the phosphorylation signal intensity of each replicate of the plurality of peptides using a variance stabilizing transformation to provide a variance stabilized signal intensity for each replicate of the plurality of peptides; and identifying one or more peptides of the plurality of peptides that is/are consistently phosphorylated or consistently unphosphorylated.
(FR)
L'invention concerne une méthode d'analyse des données de phosphorylation d'une pluralité de peptides, la méthode comprenant l'obtention d'un ou de plusieurs ensembles de données, chaque ensemble de données présentant une intensité de signal de phosphorylation pour chaque réplication de la pluralité de peptides pour un échantillon; la transformation de l'intensité du signal de phosphorylation de chaque réplication de la pluralité de peptides à l'aide d'une transformation de stabilisation de variance afin de fournir une intensité de signal à variance stabilisée pour chaque réplication de la pluralité de peptides; et l'identification d'un ou plusieurs peptides de la pluralité de peptides qui est/sont systématiquement phosphorylés ou systématiquement non phosphorylés.
Également publié en tant que
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international