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1. (WO2011153336) PROCÉDÉS ET COMPOSITIONS PERMETTANT DE PRÉDIRE DES PHÉNOTYPES NON OBSERVÉS
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication : WO/2011/153336 N° de la demande internationale : PCT/US2011/038909
Date de publication : 08.12.2011 Date de dépôt international : 02.06.2011
CIB :
G06F 19/14 (2011.01) ,G06F 17/10 (2006.01)
Déposants : GUO, Zhigang[CN/US]; US (UsOnly)
KISHORE, Venkata, Krishna[IN/US]; US (UsOnly)
SYNGENTA PARTICIPATIONS AG[CH/CH]; Schwarzwaldallee 215 CH-4058 Basel, CH (AllExceptUS)
Inventeurs : GUO, Zhigang; US
KISHORE, Venkata, Krishna; US
Mandataire : PERKINS, Christopher, P.; Jenkins, Wilson, Taylor & Hunt, P.A. Suite 1200, University Tower 3100 Tower Boulevard Durham, NC 27707, US
Données relatives à la priorité :
12/793,55003.06.2010US
Titre (EN) METHODS AND COMPOSITIONS FOR PREDICTING UNOBSERVED PHENOTYPES (PUP)
(FR) PROCÉDÉS ET COMPOSITIONS PERMETTANT DE PRÉDIRE DES PHÉNOTYPES NON OBSERVÉS
Abrégé : front page image
(EN) Methods for predicting unobserved phenotypes are provided. In some embodiments, the methods include (a) determining marker effects for a plurality of markers in a genotyped and phenotyped reference population with respect to a phenotype, wherein the reference population includes an F2 generation, an F3 generation, or a subsequent generation; (b) genotyping one or more plants of a predicted population with respect to the plurality of markers, wherein each of the one or more plants of the predicted population is a descendant of two parents and each parent has at least 80% genetic identity to at least one of the two parental plants employed to generate the reference population; (c) summing the marker effects determined in step (a) for each of the one or more plants of the predicted population based on the genotyping of step (b); and (d) predicting a phenotype of the one or more plants of the predicted population based on the sum of the marker effects from step (c). Also provided are methods for generating a plant with a phenotype of interest, and methods for estimating genetic similarity between populations.
(FR) La présente invention concerne des procédés permettant de prédire des phénotypes non observés. Dans certains modes de réalisation, lesdits procédés comprennent les étapes consistant (a) à déterminer les effets d'une pluralité de marqueurs sur le phénotype dans une population génotypée et phénotypée de référence, ladite population de référence comprenant une génération F2, une génération F3 ou une génération ultérieure; (b) à génotyper une ou plusieurs plantes d'une population prédite par rapport à la pluralité de marqueurs, chacune desdites plantes de la population prédite descendant de deux parents et chacun des parents présentant au moins 80 % d'identité génétique avec au moins l'une des deux plantes parentes utilisées pour générer la population de référence; (c) à additionner les effets des marqueurs déterminés à l'étape (a) pour chacune desdites plantes de la population prédite sur la base du génotypage de l'étape (b); et (d) à prédire un phénotype pour une ou plusieurs plantes de la population prédite sur la base de l'addition des effets des marqueurs de l'étape (c). L'invention concerne également des procédés de génération d'une plante présentant un phénotype intéressant, ainsi que des procédés permettant d'estimer la similitude génétique entre des populations.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PE, PG, PH, PL, PT, RO, RS, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)