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1. WO2011112090 - PROCÉDÉ D'IDENTIFICATION D'ACIDES NUCLÉIQUES CODANT POUR UNE PROTÉINE REP VARIANTE

Numéro de publication WO/2011/112090
Date de publication 15.09.2011
N° de la demande internationale PCT/NL2011/050171
Date du dépôt international 11.03.2011
CIB
C12N 7/02 2006.1
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
NMICRO-ORGANISMES OU ENZYMES; COMPOSITIONS LES CONTENANT; CULTURE OU CONSERVATION DE MICRO-ORGANISMES; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE; MILIEUX DE CULTURE
7Virus, p.ex. bactériophages; Compositions les contenant; Leur préparation ou purification
02Isolement ou purification
C12N 15/10 2006.1
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
NMICRO-ORGANISMES OU ENZYMES; COMPOSITIONS LES CONTENANT; CULTURE OU CONSERVATION DE MICRO-ORGANISMES; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE; MILIEUX DE CULTURE
15Techniques de mutation ou génie génétique; ADN ou ARN concernant le génie génétique, vecteurs, p.ex. plasmides, ou leur isolement, leur préparation ou leur purification; Utilisation d'hôtes pour ceux-ci
09Technologie d'ADN recombinant
10Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
C12N 15/864 2006.1
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
NMICRO-ORGANISMES OU ENZYMES; COMPOSITIONS LES CONTENANT; CULTURE OU CONSERVATION DE MICRO-ORGANISMES; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE; MILIEUX DE CULTURE
15Techniques de mutation ou génie génétique; ADN ou ARN concernant le génie génétique, vecteurs, p.ex. plasmides, ou leur isolement, leur préparation ou leur purification; Utilisation d'hôtes pour ceux-ci
09Technologie d'ADN recombinant
63Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteurs; Vecteurs; Utilisation d'hôtes pour ceux-ci; Régulation de l'expression
79Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes
85pour cellules animales
86Vecteurs viraux
864Vecteurs parvoviraux
C12N 15/866 2006.1
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
NMICRO-ORGANISMES OU ENZYMES; COMPOSITIONS LES CONTENANT; CULTURE OU CONSERVATION DE MICRO-ORGANISMES; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE; MILIEUX DE CULTURE
15Techniques de mutation ou génie génétique; ADN ou ARN concernant le génie génétique, vecteurs, p.ex. plasmides, ou leur isolement, leur préparation ou leur purification; Utilisation d'hôtes pour ceux-ci
09Technologie d'ADN recombinant
63Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteurs; Vecteurs; Utilisation d'hôtes pour ceux-ci; Régulation de l'expression
79Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes
85pour cellules animales
86Vecteurs viraux
866Vecteurs baculoviraux
CPC
C07K 14/005
CCHEMISTRY; METALLURGY
07ORGANIC CHEMISTRY
KPEPTIDES
14Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
005from viruses
C12N 15/86
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
15Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
09Recombinant DNA-technology
63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
85for animal cells
86Viral vectors
C12N 2750/14122
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
2750ssDNA Viruses
00011ssDNA Viruses
14011Parvoviridae
14111Dependovirus, e.g. adenoassociated viruses
14122New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
C12N 2750/14344
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
2750ssDNA Viruses
00011ssDNA Viruses
14011Parvoviridae
14311Parvovirus, e.g. minute virus of mice
14341Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
14344Chimeric viral vector comprising heterologous viral elements for production of another viral vector
C12N 2799/026
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
2799Uses of viruses
02as vector
021for the expression of a heterologous nucleic acid
026where the vector is derived from a baculovirus
Déposants
  • UNIQURE IP B.V. [NL]/[NL] (AllExceptUS)
  • NOORDMAN, Yvet [NL]/[NL] (UsOnly)
  • BAKKER, Andrew Christian [NL]/[NL] (UsOnly)
Inventeurs
  • NOORDMAN, Yvet
  • BAKKER, Andrew Christian
Mandataires
  • VAN WESTENBRUGGE, Andre
Données relatives à la priorité
61/313,03311.03.2010US
Langue de publication Anglais (en)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) METHOD FOR IDENTIFYING VARIANT REP PROTEIN ENCODING NUCLEIC ACIDS
(FR) PROCÉDÉ D'IDENTIFICATION D'ACIDES NUCLÉIQUES CODANT POUR UNE PROTÉINE REP VARIANTE
Abrégé
(EN) The present invention relates to a method for the selection of a Parvoviral nucleotide sequence encoding a mutant Rep polypeptide having one or more improved properties, which method comprises: a. providing a plurality of Parvoviral nucleotide constructs, each construct comprising: a Parvoviral nucleotide sequence encoding a mutant Rep polypeptide operably linked to a regulatory sequence; and at least one Parvoviral Inverted Terminal Repeat (ITR) flanking said mutant Rep encoding sequence and regulatory sequence; b. transferring the plurality of nucleotide constructs into host cells which are capable of expressing Paroviral Cap polypeptides; c. exposing the host cells to conditions which allow for expression of Parvoviral Cap polypeptides and the expression of a Parvoviral mutant Rep polypeptide so that the Parvoviral nucleotide constructs may be packaged into said Cap polypeptides giving rise to Parvoviral virions; d. isolating Parvoviral virions from the host cell culture and/or supernatant; and e. isolating a mutant parvoviral Rep encoding nucleotide sequence from one of said virions,thereby to select a Parvoviral nucleotide sequence encoding a mutant Rep polypeptide having one or more improved properties.
(FR) La présente invention concerne un procédé de sélection d'une séquence nucléotidique de parvovirus codant pour un polypeptide Rep mutant présentant une ou plusieurs propriétés améliorées, ledit procédé consistant: a. à prendre une pluralité de constructions nucléotidiques de parvovirus, chaque construction comprenant: une séquence nucléotidique de parvovirus codant pour un polypeptide Rep mutant lié de manière fonctionnelle à une séquence régulatrice; et au moins une répétition terminale inversée (ITR) de parvovirus flanquant ladite séquence de codage Rep mutante et ladite séquence régulatrice; b. à transférer la pluralité de constructions nucléotidiques dans des cellules hôtes qui peuvent exprimer des polypeptides Cap de parvovirus; c. à exposer les cellules hôtes à des conditions qui permettent l'expression de polypeptides Cap de parvovirus et l'expression d'un polypeptide Rep mutant de parvovirus de sorte que les constructions nucléotidiques de parvovirus peuvent être encapsulées dans lesdits polypeptides Cap, ce qui donne naissance à des virions de parvovirus; d. à isoler des virions de parvovirus à partir de la culture de cellules hôtes et/ou de surnageant; et e. à isoler une séquence nucléotidique de codage Rep de parvovirus mutant à partir d'un desdits virions, pour ainsi sélectionner une séquence nucléotidique de parvovirus codant pour un polypeptide Rep mutant présentant une ou plusieurs propriétés améliorées.
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