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1. (WO2008018240) PROCÉDÉ POUR HAPLOTYPE HOMOZYGOTE
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication :    WO/2008/018240    N° de la demande internationale :    PCT/JP2007/062368
Date de publication : 14.02.2008 Date de dépôt international : 13.06.2007
CIB :
C12N 15/09 (2006.01), C12M 1/00 (2006.01), C12Q 1/68 (2006.01)
Déposants : TOMY DIGITAL BIOLOGY CO., LTD. [JP/JP]; 3-14-17, Tagara, Nerima-ku Tokyo 1790073 (JP) (Tous Sauf US).
Saitama Medical University [JP/JP]; 38, Morohongo, Moroyama-machi Iruma-gun, Saitama 3500495 (JP) (Tous Sauf US).
HAGIWARA, Koichi [JP/JP]; (JP) (US Seulement)
Inventeurs : HAGIWARA, Koichi; (JP)
Mandataire : KUDO, Ichiro; Yurakucho Denki Bldg. South Tower 7-1, Yurakucho 1-chome Chiyoda-ku, Tokyo 1000006 (JP)
Données relatives à la priorité :
2006-214300 07.08.2006 JP
Titre (EN) HOMOZYGOTE HAPLOTYPE METHOD
(FR) PROCÉDÉ POUR HAPLOTYPE HOMOZYGOTE
(JA) ホモ接合ハプロタイプ法
Abrégé : front page image
(EN)To provide a method of efficiently searching for a disease sensitivity gene and an apparatus therefor. It is intended to provide: a method of determining a homoeologous region which comprises the polymorphism marker selection step of selecting a polymorphism marker usable as the subject of the homozygote determination, the homozygote determination step of determining whether or not bases constituting a specimen DNA which is a diploid or higher are homozygous, the homozygote haplotype data acquisition step of selecting exclusively polymorphism markers determined as homozygous and acquiring homozygote haplotype data of each specimen, the homozygous region data acquisition step of comparing the above-described homozygote haplotype data of two or more specimens and acquiring common homozygous region data, and the homoeologous region determination step of determining a common homozygous region satisfying definite homoeology requirements as a homoeologous region between the corresponding specimens for each common homozygous region data; and an apparatus and a gene screening method with the use of this method.
(FR)La présente invention concerne un procédé permettant de rechercher avec efficacité un gène de sensibilité à une maladie, et un appareil à cet effet. L'invention concerne plus particulièrement un procédé de recherche d'une région homéologue. Ce procédé comporte plusieurs opérations. Une première opération consiste à sélectionner un marqueur du polymorphisme pouvant s'utiliser comme sujet de la recherche d'homozygote. L'opération de recherche d'homozygote consiste ensuite à déterminer si, oui ou non, des bases constitutives d'un spécimen d'ADN au moins diploïdes sont homozygotes. Vient ensuite une opération d'acquisition de données sur le haplotype homozygote consistant à sélectionner exclusivement les marqueurs du polymorphisme vérifiés comme étant homozygotes et à acquérir les données des haplotypes homozygotes de chaque spécimen. Une opération d'acquisition des données sur les régions homozygotes consiste ensuite à comparer entre elles ces données sur les halpotypes homozygotes pour plusieurs spécimens et à acquérir les données communes sur les régions homozygotes. Enfin, une opération de détermination de régions homéologues consiste à rechercher une région homozygote commune répondant à des critères d'homéologie bien définis tels que l'existence d'une région homéologue entre les spécimens correspondants pour chaque donnée commune des régions homozygotes. L'invention concerne également un appareil et un procédé de recherche systématique de gènes utilisant ce procédé.
(JA)【課題】効率的な疾患感受性遺伝子の探索方法及びその装置を提供する。【解決手段】ホモ接合判定対象となる多型マーカーを選択する多型マーカー選択ステップと、二倍体以上である検体DNAの多型マーカーを構成している塩基が、ホモ接合であるかを判定するホモ接合判定ステップと、ホモ接合と判定された多型マーカーのみを選択して各検体に対してホモ接合型ハプロタイプ情報を得るホモ接合型ハプロタイプ情報取得ステップと、二以上の検体の前記ホモ接合型ハプロタイプ情報を比較し、共通ホモ接合領域情報を取得する共通ホモ接合領域情報取得ステップと、各共通ホモ接合領域情報ごとに所定の同祖判定条件を満たした場合に、その共通ホモ接合領域が各検体間で同祖領域であると判定する同祖領域判定ステップと、を有する同祖領域判定方法、該方法を用いた装置及び遺伝子スクリーニング方法を提供する。
États désignés : AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RS, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, SV, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MT, NL, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : japonais (JA)
Langue de dépôt : japonais (JA)