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1. (WO2006030822) PROCEDE ET PROGRAMME DE TRAITEMENT DES DONNEES D'EXPRESSION GENETIQUE
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication :    WO/2006/030822    N° de la demande internationale :    PCT/JP2005/016927
Date de publication : 23.03.2006 Date de dépôt international : 14.09.2005
CIB :
G01N 33/48 (2006.01), G06F 19/20 (2011.01)
Déposants : TOUDAI TLO, Ltd. [JP/JP]; 3-1, Hongo 7-chome, Bunkyo-ku, Tokyo 1130033 (JP) (Tous Sauf US).
KONISHI, Tomokazu [JP/JP]; (JP) (US Seulement)
Inventeurs : KONISHI, Tomokazu; (JP)
Mandataire : YOSHIDA, Satoshi; 2-24-4, Kamiooka-higashi Konan-ku, Yokohama-shi Kanagawa 2330001 (JP)
Données relatives à la priorité :
2004-266875 14.09.2004 JP
Titre (EN) GENE EXPRESSION DATA PROCESSING METHOD AND PROCESSING PROGRAM
(FR) PROCEDE ET PROGRAMME DE TRAITEMENT DES DONNEES D'EXPRESSION GENETIQUE
(JA) 遺伝子発現データの処理方法、および、処理プログラム
Abrégé : front page image
(EN)The variation of the data collected from a DNA chip is adequately detected and the variation is corrected if possible. In a gene expression data processing method of collecting analyzable data by processing array data acquired according to the expression level of the genes on a DNA chip, the DNA chip is divided into small regions. Data values constituting the array data are standardized (step 300). The average value of the standardized data values or the standard deviation of the median is calculated (step 310). It is checked if there is any variation of the data collected from the DNA chip on the basis of an increase of the standard deviation (step 310).
(FR)La variation des données collectées à partir d'une puce à ADN est détectée de façon appropriée et cette variation est corrigée dans la mesure du possible. Dans le cadre d'un procédé de traitement des données d'expression génétique consistant à recueillir des données analysables par traitement des données de biopuces acquises en fonction du niveau d'expression des gènes sur une puce à ADN, la puce à ADN est divisée en petites régions. Les valeurs des données des biopuces sont normalisées (étape 300). La moyenne des valeurs des données standardisées ou l'écart-type par rapport à la médiane est calculé(e) (étape 310). La présence d'une quelconque variation des données collectées à partir de la puce à ADN est vérifiée sur la base de l'augmentation de l'écart-type (étape 310).
(JA) 適切にDNAチップのデータのムラを検出し、また、可能であればそのムラを補正する。DNAチップ上の遺伝子の発現量に基づき得られたアレイデータを処理して、解析可能なデータを取得する遺伝子発現データの処理方法において、DNAチップが複数の小領域に分割される。アレイデータを構成するデータ値は標準化され(ステップ300)、小領域ごとに、標準化されたデータ値の平均値或いは中央値の標準偏差が算出される(ステップ310)。次いで、標準偏差の増大に基づいて、DNAチップのデータにおけるムラの存在の有無が検出される(ステップ310)。
États désignés : AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, YU, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, NL, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : japonais (JA)
Langue de dépôt : japonais (JA)