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Paramétrages

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1. WO2005003308 - PROCEDE DE COMPARAISON D'ENSEMBLES DE DONNEES BIOLOGIQUES

Numéro de publication WO/2005/003308
Date de publication 13.01.2005
N° de la demande internationale PCT/US2004/019932
Date du dépôt international 22.06.2004
CIB
G01N 33/48 2006.01
GPHYSIQUE
01MÉTROLOGIE; TESTS
NRECHERCHE OU ANALYSE DES MATÉRIAUX PAR DÉTERMINATION DE LEURS PROPRIÉTÉS CHIMIQUES OU PHYSIQUES
33Recherche ou analyse des matériaux par des méthodes spécifiques non couvertes par les groupes G01N1/-G01N31/146
48Matériau biologique, p.ex. sang, urine; Hémocytomètres
CPC
G16B 20/00
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
20ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
G16B 30/00
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
30ICT specially adapted for sequence analysis involving nucleotides or amino acids
G16B 40/00
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
40ICT specially adapted for biostatistics; ICT specially adapted for bioinformatics-related machine learning or data mining, e.g. knowledge discovery or pattern finding
G16B 50/00
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
50ICT programming tools or database systems specially adapted for bioinformatics
Déposants
  • SMITHKLINE BEECHAM CORPORATION [US/US]; One Franklin Plaza Philadelphia, PA 19101, US (AllExceptUS)
  • AGARWAL, Pankaj [IN/US]; US (UsOnly)
  • HURLE, Mark, Robert [US/US]; US (UsOnly)
  • KABNICK, Karen, Stephanie [US/US]; US (UsOnly)
  • LIU, Liwen [CN/US]; US (UsOnly)
  • MAGID-SLAV, Michal [IL/US]; US (UsOnly)
  • MCALLISTER, Paul, Robert [US/US]; US (UsOnly)
  • SEARLS, David, Burdette [US/US]; US (UsOnly)
  • TATSUOKA, Kay, Satoshi [US/US]; US (UsOnly)
  • ZAYKIN, Dmitri, V [RU/US]; US (UsOnly)
  • REISDORF, William, Charles, Jr. [US/US]; US (UsOnly)
  • GHOSH, Sujoy [IN/US]; US (UsOnly)
  • KUMAR, Vinod, D. [US/US]; US (UsOnly)
Inventeurs
  • AGARWAL, Pankaj; US
  • HURLE, Mark, Robert; US
  • KABNICK, Karen, Stephanie; US
  • LIU, Liwen; US
  • MAGID-SLAV, Michal; US
  • MCALLISTER, Paul, Robert; US
  • SEARLS, David, Burdette; US
  • TATSUOKA, Kay, Satoshi; US
  • ZAYKIN, Dmitri, V; US
  • REISDORF, William, Charles, Jr.; US
  • GHOSH, Sujoy; US
  • KUMAR, Vinod, D.; US
Mandataires
  • LEVY, David, J. ; GlaxoSmithKline Five Moore Drive PO Box 13398 Research Triangle Park, NC 27709, US
Données relatives à la priorité
60/482,42025.06.2003US
Langue de publication anglais (EN)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) BIOLOGICAL DATA SET COMPARISON METHOD
(FR) PROCEDE DE COMPARAISON D'ENSEMBLES DE DONNEES BIOLOGIQUES
Abrégé
(EN)
A method of identifying a relationship between a set of one or more candidate biomolecules and a set of one or more reference biomolecules, the method including inputting to a computer a query set describing the one or more candidate biomolecules; comparing the query set with a target database describing the one or more reference biomolecules wherein the one or more reference biomolecules grouped into one or more buckets and wherein the one or more reference biomolecules of each bucket share a common property; counting a number of matches between each query set and each buckets of the target database; and statistically analyzing the number of matches to each bucket wherein the presence of a statistically significant match identifies a relationship between a the query set and a bucket of the target database.
(FR)
L'invention concerne un procédé d'identification d'une relation entre un ensemble comprenant une ou plusieurs biomolécules candidates et un ensemble comprenant une ou plusieurs biomolécules de référence. Le procédé comporte les étapes consistant à : introduire dans un ordinateur un ensemble de demandes décrivant une ou plusieurs biomolécules candidates ; comparer l'ensemble de demandes à une base de données voulue décrivant une ou plusieurs biomolécules de référence, celle(s)-ci étant groupées en une ou plusieurs catégories, la ou les biomolécules de référence de chaque catégorie ayant une propriété commune ; compter le nombre de correspondances entre chaque ensemble de demandes et chaque catégorie de la base de données voulue ; et analyser statistiquement le nombre de correspondances de chaque catégorie, la présence d'une correspondance statistiquement importante permettant d'identifier une relation entre l'ensemble de demandes et la catégorie de la base de données voulue.
Également publié en tant que
US2007168135
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