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Paramétrages

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1. WO2005001736 - METHODE D'ANALYSE DE FLUX METABOLIQUE INTRACELLULAIRE AU MOYEN D'UN SUBSTRAT MARQUE PAR UN ISOTOPE

Numéro de publication WO/2005/001736
Date de publication 06.01.2005
N° de la demande internationale PCT/JP2004/009602
Date du dépôt international 30.06.2004
CIB
G06F 19/12 2011.01
GPHYSIQUE
06CALCUL; COMPTAGE
FTRAITEMENT ÉLECTRIQUE DE DONNÉES NUMÉRIQUES
19Équipement ou méthodes de traitement de données ou de calcul numérique, spécialement adaptés à des applications spécifiques
10Bio-informatique, c. à d. procédés ou systèmes pour le traitement de données génétiques ou se rapportant aux protéines en biologie moléculaire informatique
12pour la modélisation ou la simulation en biologie des systèmes, p.ex. modèles probabilistes ou dynamiques, réseaux régulateurs de gènes, réseaux d'interaction protéique ou réseaux métaboliques
CPC
G16B 5/00
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
5ICT specially adapted for modelling or simulations in systems biology, e.g. gene-regulatory networks, protein interaction networks or metabolic networks
Déposants
  • AJINOMOTO CO., INC. [JP/JP]; 15-1, Kyobashi 1-chome Chuo-ku, Tokyo 1048315, JP (AllExceptUS)
  • IWATANI, Shintaro [JP/JP]; JP (UsOnly)
  • VAN, DIEN, Stephen [US/JP]; JP (UsOnly)
  • USUDA, Yoshihiro [JP/JP]; JP (UsOnly)
  • MATSUI, Kazuhiko [JP/JP]; JP (UsOnly)
Inventeurs
  • IWATANI, Shintaro; JP
  • VAN, DIEN, Stephen; JP
  • USUDA, Yoshihiro; JP
  • MATSUI, Kazuhiko; JP
Mandataires
  • KAWAGUCHI, Yoshiyuki ; Acropolis 21 Building 6th Floor 4-10, Higashi Nihonbashi 3-chome, Chuo-ku Tokyo 1030004, JP
Données relatives à la priorité
2003-18751630.06.2003JP
Langue de publication anglais (EN)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) INTRACELLULAR METABOLIC FLUX ANALYSIS METHOD USING SUBSTRATE LABELED WITH ISOTOPE
(FR) METHODE D'ANALYSE DE FLUX METABOLIQUE INTRACELLULAIRE AU MOYEN D'UN SUBSTRAT MARQUE PAR UN ISOTOPE
Abrégé
(EN)
A method for analyzing an intracellular metabolic flux comprising determining the intracellular metabolic flux from analytical values of cells cultured in a medium containing an isotope-labeled substrate as a carbon source on the basis of an intracellular metabolic flux model constructed for the intracellular metabolic flux to be analyzed, wherein (a) influence of an exchange reaction between an intracellular metabolite and a cell component produced by integration of the intracellular metabolite is considered, (b) uptake of a compound in a medium into cells, which compound is identical to an intracellular metabolite and unlabeled with an isotope, is considered, or (c) carbon dioxide produced in a production reaction.
(FR)
L'invention concerne une méthode d'analyse d'un flux métabolique intracellulaire consistant à déterminer ledit flux métabolique intracellulaire à partir de valeurs analytiques de cellules cultivées dans un milieu contenant un substrat marqué par un isotope comme source de carbone sur la base d'un modèle de flux métabolique intracellulaire construit pour le flux métabolique intracellulaire à analyser. Selon l'invention, (a) l'influence d'une réaction d'échange entre un métabolite intracellulaire et un composant cellulaire produit par intégration de ce métabolite intracellulaire est prise en considération, (b) l'absorption d'un composé dans un milieu par des cellules, ce composé étant identique à un métabolite intracellulaire et non marqué par un isotope, est prise en considération ou (c) le dioxyde de carbone utilisé dans une réaction de fixation correspond au dioxyde de carbone produit dans une réaction de production.
Également publié en tant que
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