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1. WO2005001128 - MATERIAUX ET PROCEDES DE PRODUCTION DE BIBLIOTHEQUES D'ADN, DETECTION ET IDENTIFICATION DE MICRO-ORGANISMES

Numéro de publication WO/2005/001128
Date de publication 06.01.2005
N° de la demande internationale PCT/US2004/011208
Date du dépôt international 12.04.2004
CIB
C12Q 1/68 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
QPROCÉDÉS DE MESURE OU DE TEST FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES, DES ACIDES NUCLÉIQUES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
68faisant intervenir des acides nucléiques
C12Q 1/70 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
QPROCÉDÉS DE MESURE OU DE TEST FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES, DES ACIDES NUCLÉIQUES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
70faisant intervenir des virus ou des bactériophages
CPC
C12Q 1/686
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6844Nucleic acid amplification reactions
686Polymerase chain reaction [PCR]
C12Q 1/701
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
70involving virus or bacteriophage
701Specific hybridization probes
Déposants
  • UNIVERSITY OF FLORIDA RESEARCH FOUNDATION, INC. [US/US]; 223 Grinter Hall Gainesville, FL 32611, US (AllExceptUS)
  • MOYER, Richard, W. [US/US]; US (UsOnly)
  • LUTTGE, Benjamin, G. [US/US]; US (UsOnly)
Inventeurs
  • MOYER, Richard, W.; US
  • LUTTGE, Benjamin, G.; US
Mandataires
  • LADWIG, Glenn, P. ; Saliwanchik, Lloyd & Saliwanchik A Professional Association PO Box 142950 Gainesville, FL 32614-2950, US
Données relatives à la priorité
60/462,20411.04.2003US
Langue de publication anglais (EN)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) MATERIALS AND METHODS FOR PRODUCING DNA LIBRARIES AND DETECTING AND IDENTIFYING MICROORGANISMS
(FR) MATERIAUX ET PROCEDES DE PRODUCTION DE BIBLIOTHEQUES D'ADN, DETECTION ET IDENTIFICATION DE MICRO-ORGANISMES
Abrégé
(EN)
The present invention concerns materials and methods for producing virtual genomic libraries of microorganisms, such as viruses. The genomic libraries produced are useful for rapidly mapping genetic traits, such as those conferring increased pathogenicity or resistance to antiviral or antibiotic drugs, and as diagnostic tools for distinguishing from among a family of bacteria or viruses, such as orthopoxviruses. In one aspect, the present invention pertains to methods for synthesizing entire viral genomes. In another aspect, the present invention pertains to a diagnostic method for identifying an unknown virus using a plurality of polymerase chain reaction (PCR) primers (primer sets). In yet another aspect, the present invention concerns a method for designing PCR primers and primer sets useful in carrying out the diagnostic method disclosed herein. In still another aspect, the present invention concerns PCR primers that have been produced using the primer design method disclosed herein. In another aspect, the present invention concerns diagnostic kits for determining the identity of one or more unknown microorganisms.
(FR)
La présente invention concerne des matériaux et des procédés de production de bibliothèques génomiques virtuelles de micro-organismes, tels que des virus. Les bibliothèques génomiques produites conviennent pour rapidement mettre en correspondance des traits génétiques, telles que ceux d'une pathogénicité accrue ou d'une meilleure résistance à des médicaments antiviraux ou antibiotiques et, comme outils diagnostics qui permettent d'établir une distinction dans une famille de bactéries ou de virus, tels que des orthopoxvirus. Dans un aspect, cette invention concerne des procédés de synthèse de génomes viraux entiers. Dans un autre aspect, cette invention concerne un procédé diagnostic qui permet d'identifier un virus inconnu au moyen d'une pluralité d'amorces de réaction en chaîne de la polymères (PCR) (ensembles d'amorces). Dans un autre aspect encore, cette invention concerne un procédé permettant de concevoir des amorces et des ensembles d'amorces de PCR qui conviennent pour effectuer le procédé diagnostic de cette invention. Dans un autre aspect encore, cette invention concerne des amorces de PCR qui ont été produites au moyen du procédé de conception d'amorces de cette invention. Dans un autre aspect enfin, cette invention concerne des kits diagnostic de détermination de l'identité d'un ou de plusieurs micro-organismes inconnus.
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