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1. WO2004070029 - PROCEDE POUR CODER UNE SEQUENCE D'ADN ET PROCEDE POUR COMPRIMER UNE SEQUENCE D'ADN

Numéro de publication WO/2004/070029
Date de publication 19.08.2004
N° de la demande internationale PCT/KR2003/001093
Date du dépôt international 04.06.2003
CIB
C12N 15/00 2006.1
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
NMICRO-ORGANISMES OU ENZYMES; COMPOSITIONS LES CONTENANT; CULTURE OU CONSERVATION DE MICRO-ORGANISMES; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE; MILIEUX DE CULTURE
15Techniques de mutation ou génie génétique; ADN ou ARN concernant le génie génétique, vecteurs, p.ex. plasmides, ou leur isolement, leur préparation ou leur purification; Utilisation d'hôtes pour ceux-ci
CPC
E04G 1/15
EFIXED CONSTRUCTIONS
04BUILDING
GSCAFFOLDING; FORMS; SHUTTERING; BUILDING IMPLEMENTS OR AIDS, OR THEIR USE; HANDLING BUILDING MATERIALS ON THE SITE; REPAIRING, BREAKING-UP OR OTHER WORK ON EXISTING BUILDINGS
1Scaffolds primarily resting on the ground
15essentially comprising special means for supporting or forming platforms
E04G 1/32
EFIXED CONSTRUCTIONS
04BUILDING
GSCAFFOLDING; FORMS; SHUTTERING; BUILDING IMPLEMENTS OR AIDS, OR THEIR USE; HANDLING BUILDING MATERIALS ON THE SITE; REPAIRING, BREAKING-UP OR OTHER WORK ON EXISTING BUILDINGS
1Scaffolds primarily resting on the ground
28designed to provide support only at a low height
32Other free-standing supports, e.g. using trestles
E04G 2001/155
EFIXED CONSTRUCTIONS
04BUILDING
GSCAFFOLDING; FORMS; SHUTTERING; BUILDING IMPLEMENTS OR AIDS, OR THEIR USE; HANDLING BUILDING MATERIALS ON THE SITE; REPAIRING, BREAKING-UP OR OTHER WORK ON EXISTING BUILDINGS
1Scaffolds primarily resting on the ground
15essentially comprising special means for supporting or forming platforms
155Platforms with an access hatch for getting through from one level to another
E04G 2001/305
EFIXED CONSTRUCTIONS
04BUILDING
GSCAFFOLDING; FORMS; SHUTTERING; BUILDING IMPLEMENTS OR AIDS, OR THEIR USE; HANDLING BUILDING MATERIALS ON THE SITE; REPAIRING, BREAKING-UP OR OTHER WORK ON EXISTING BUILDINGS
1Scaffolds primarily resting on the ground
28designed to provide support only at a low height
30Ladder scaffolds
302with ladders supporting the platform
305The ladders being vertical and perpendicular to the platform
G16B 30/00
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
30ICT specially adapted for sequence analysis involving nucleotides or amino acids
H03M 7/3084
HELECTRICITY
03BASIC ELECTRONIC CIRCUITRY
MCODING; DECODING; CODE CONVERSION IN GENERAL
7Conversion of a code where information is represented by a given sequence or number of digits to a code where the same ; , similar or subset of; information is represented by a different sequence or number of digits
30Compression
3084using adaptive string matching, e.g. the Lempel-Ziv method
Déposants
  • AJOU UNIVERSITY INDUSTRY COOPERATION FOUNDATION [KR]/[KR] (AllExceptUS)
  • KIM, Hyoung Do [KR]/[KR] (UsOnly)
  • YOO, Seung Wha [KR]/[KR] (UsOnly)
  • CHOI, Kyoung Hee [KR]/[KR] (UsOnly)
Inventeurs
  • KIM, Hyoung Do
  • YOO, Seung Wha
  • CHOI, Kyoung Hee
Mandataires
  • JIN, Cheon Woong
Données relatives à la priorité
10-2003-000792007.02.2003KR
Langue de publication Anglais (en)
Langue de dépôt coréen (KO)
États désignés
Titre
(EN) METHOD TO ENCODE A DNA SEQUENCE AND TO COMPRESS A DNA SEQUENCE
(FR) PROCEDE POUR CODER UNE SEQUENCE D'ADN ET PROCEDE POUR COMPRIMER UNE SEQUENCE D'ADN
Abrégé
(EN) The present invention relates to a method for encoding a DNA sequence and a method for compressing a DNA sequence. The method for encoding a DNA sequence according to the present invention comprises the steps of: encoding bases of the DNA sequence comprising adenine (A), guanine (G), cytosine (C) and thymine (T), into 2 bits; forming one byte with a predetermined number of the encoded bases; and forming a DNA sequence in the byte unit. Also, the method for compressing a DNA sequence according to the present ivnention further comprises a step of compressing the encoded DNA sequence using a data compression method. According to the present invention, it is possible to effectively encode a DNA sequence and improve compression rate and compression speed of DNA sequence information.
(FR) La présente invention concerne un procédé pour coder une séquence d'ADN et un procédé pour comprimer une séquence d'ADN. Le procédé pour coder une séquence d'ADN comprend les étapes suivantes: codage en deux bits des bases de la séquence d'ADN, à savoir l'adénine (A), la guanine (G) la cytosine (C) et la thymine (T); formation d'un multiplet avec un nombre prédéterminé des bases codées; et formation d'une séquence d'ADN dans le multiplet. Le procédé de compression de séquence d'ADN selon la présente invention comprend en plus une étape de compression de la séquence d'ADN codée, faisant appel à un procédé de compression des données. Selon la présente invention, il est possible de coder efficacement une séquence d'ADN et d'améliorer le taux et la vitesse de compression d'informations relatives à une séquence d'ADN.
Documents de brevet associés
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