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Paramétrages

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1. WO2003006951 - SYSTEME ET PROCEDE SERVANT A DETERMINER DES DIFFERENCES PROTEOMIQUES

Numéro de publication WO/2003/006951
Date de publication 23.01.2003
N° de la demande internationale PCT/US2002/022320
Date du dépôt international 12.07.2002
Demande présentée en vertu du Chapitre 2 05.02.2003
CIB
G01N 30/02 2006.01
GPHYSIQUE
01MÉTROLOGIE; TESTS
NRECHERCHE OU ANALYSE DES MATÉRIAUX PAR DÉTERMINATION DE LEURS PROPRIÉTÉS CHIMIQUES OU PHYSIQUES
30Recherche ou analyse de matériaux par séparation en constituants utilisant l'adsorption, l'absorption ou des phénomènes similaires ou utilisant l'échange d'ions, p.ex. la chromatographie
02Chromatographie sur colonne
G01N 30/72 2006.01
GPHYSIQUE
01MÉTROLOGIE; TESTS
NRECHERCHE OU ANALYSE DES MATÉRIAUX PAR DÉTERMINATION DE LEURS PROPRIÉTÉS CHIMIQUES OU PHYSIQUES
30Recherche ou analyse de matériaux par séparation en constituants utilisant l'adsorption, l'absorption ou des phénomènes similaires ou utilisant l'échange d'ions, p.ex. la chromatographie
02Chromatographie sur colonne
62Détecteurs spécialement adaptés à cet effet
72Spectromètres de masse
G01N 33/58 2006.01
GPHYSIQUE
01MÉTROLOGIE; TESTS
NRECHERCHE OU ANALYSE DES MATÉRIAUX PAR DÉTERMINATION DE LEURS PROPRIÉTÉS CHIMIQUES OU PHYSIQUES
33Recherche ou analyse des matériaux par des méthodes spécifiques non couvertes par les groupes G01N1/-G01N31/146
48Matériau biologique, p.ex. sang, urine; Hémocytomètres
50Analyse chimique de matériau biologique, p.ex. de sang ou d'urine; Test par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligands; Test immunologique
58faisant intervenir des substances marquées
G01N 33/68 2006.01
GPHYSIQUE
01MÉTROLOGIE; TESTS
NRECHERCHE OU ANALYSE DES MATÉRIAUX PAR DÉTERMINATION DE LEURS PROPRIÉTÉS CHIMIQUES OU PHYSIQUES
33Recherche ou analyse des matériaux par des méthodes spécifiques non couvertes par les groupes G01N1/-G01N31/146
48Matériau biologique, p.ex. sang, urine; Hémocytomètres
50Analyse chimique de matériau biologique, p.ex. de sang ou d'urine; Test par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligands; Test immunologique
68faisant intervenir des protéines, peptides ou amino-acides
CPC
G01N 2030/027
GPHYSICS
01MEASURING; TESTING
NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
30Investigating or analysing materials by separation into components using adsorption, absorption or similar phenomena or using ion-exchange, e.g. chromatography
02Column chromatography
022characterised by the kind of separation mechanism
027Liquid chromatography
G01N 2458/15
GPHYSICS
01MEASURING; TESTING
NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
2458Labels used in chemical analysis of biological material
15Non-radioactive isotope labels, e.g. for detection by mass spectrometry
G01N 30/7266
GPHYSICS
01MEASURING; TESTING
NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
30Investigating or analysing materials by separation into components using adsorption, absorption or similar phenomena or using ion-exchange, e.g. chromatography
02Column chromatography
62Detectors specially adapted therefor
72Mass spectrometers
7233interfaced to liquid or superfluid chromatograph
724Nebulising, aerosol formation or ionisation
7266by electric field, e.g. electrospray
G01N 33/58
GPHYSICS
01MEASURING; TESTING
NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
33Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
48Biological material, e.g. blood, urine
50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
58involving labelled substances
G01N 33/6818
GPHYSICS
01MEASURING; TESTING
NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
33Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
48Biological material, e.g. blood, urine
50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
68involving proteins, peptides or amino acids
6803General methods of protein analysis not limited to specific proteins or families of proteins
6818Sequencing of polypeptides
G01N 33/6851
GPHYSICS
01MEASURING; TESTING
NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
33Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
48Biological material, e.g. blood, urine
50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
68involving proteins, peptides or amino acids
6803General methods of protein analysis not limited to specific proteins or families of proteins
6848Methods of protein analysis involving mass spectrometry
6851Methods of protein analysis involving laser desorption ionisation mass spectrometry
Déposants
  • SYNGENTA PARTICIPATIONS AG [CH/CH]; Schwarzwaldallee 215 CH-CH-4058 Basel, CH (AllExceptUS)
  • WASHBURN, Michael [US/US]; US (UsOnly)
  • DECIU, Cosmin [RO/US]; US (UsOnly)
  • ULASZEK, Ryan [US/US]; US (UsOnly)
Inventeurs
  • WASHBURN, Michael; US
  • DECIU, Cosmin; US
  • ULASZEK, Ryan; US
Mandataires
  • TAYLOR, Arles, A. jr.; Jenkins & Wilson, P.A. Suite 1400 University Tower 3100 Tower Boulevard Durham, NC 27707, US
Données relatives à la priorité
60/305,16913.07.2001US
60/359,52421.02.2002US
Langue de publication anglais (EN)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) SYSTEM AND METHOD OF DETERMINING PROTEOMIC DIFFERENCES
(FR) SYSTEME ET PROCEDE SERVANT A DETERMINER DES DIFFERENCES PROTEOMIQUES
Abrégé
(EN)
The present invention relates to a system and methods for identifying differential peptide expression in one or more peptide populations. Each population 109 is labeled with a discernable label and provides a mechanism to resolve mixed peptide populations 130 using mass spectroscopy-based techniques. Spectra 146 produced by the peptide sample are used to interrogate a spectral database in which peptide sequences of known spectra are stored. In addition to providing sequence information, the methods presented herein may be used to determine qualitative and quantitative measurements of peptide expression. These measurements may further be used to determine proteomic differences and novel peptide expression.
(FR)
L'invention concerne un système et des procédés servant à identifier une expression peptidique différentielle dans une ou plusieurs populations de peptides. On marque chaque population (109) au moyen d'un marqueur pouvant être distingué et constituant un mécanisme permettant de résoudre le mélange de populations de peptides (130) au moyen de techniques basées sur la spectroscopie de masse. On utilise les spectres (146) produits par le spécimen de peptide pour interroger une base de données spectrale dans laquelle sont mémorisées des séquences de peptide possédant des spectres connus. En plus des informations fournies par ces procédés concernant les séquences, on peut les utiliser afin de déterminer des mesures qualitatives et quantitatives de l'expression peptidique. On peut également utiliser ces mesures afin de déterminer des différences protéomiques et une nouvelle expression peptidique.
Également publié en tant que
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