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1. WO2002059371 - EMPLACEMENT ET FONCTION DE PROTEINES DE LIAISON A L'ADN A L'ECHELLE DU GENOME

Numéro de publication WO/2002/059371
Date de publication 01.08.2002
N° de la demande internationale PCT/US2001/050396
Date du dépôt international 21.12.2001
Demande présentée en vertu du Chapitre 2 11.07.2002
CIB
C12Q 1/68 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
QPROCÉDÉS DE MESURE OU DE TEST FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES, DES ACIDES NUCLÉIQUES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
68faisant intervenir des acides nucléiques
CPC
C12Q 1/6809
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6809Methods for determination or identification of nucleic acids involving differential detection
G01N 33/68
GPHYSICS
01MEASURING; TESTING
NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
33Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
48Biological material, e.g. blood, urine
50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
68involving proteins, peptides or amino acids
Déposants
  • WHITEHEAD INSTITUTE FOR BIOMEDICAL RESEARCH [US]/[US] (AllExceptUS)
  • WYRICK, John [US]/[US] (UsOnly)
  • YOUNG, Richard, A. [US]/[US] (UsOnly)
  • REN, Bing [CN]/[US] (UsOnly)
  • ROBERT, François [CA]/[US] (UsOnly)
  • SIMON, Itamar [IL]/[US] (UsOnly)
Inventeurs
  • WYRICK, John
  • YOUNG, Richard, A.
  • REN, Bing
  • ROBERT, François
  • SIMON, Itamar
Mandataires
  • COLLINS, Anne, J.
Données relatives à la priorité
60/257,45521.12.2000US
60/323,62020.09.2001US
Langue de publication anglais (EN)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) GENOME-WIDE LOCATION AND FUNCTION OF DNA BINDING PROTEINS
(FR) EMPLACEMENT ET FONCTION DE PROTEINES DE LIAISON A L'ADN A L'ECHELLE DU GENOME
Abrégé
(EN)
The present invention relates to a method of identifying a region (one or more) of a genome of a cell to which a protein of interest binds. In the methods described herein, DNA binding protein of a cell is linked (e.g., covalently crosslinked) to genomic DNA of a cell. The genomic DNA to which the DNA binding protein is linked is removed and combined or contacted with DNA comprising a sequence complementary to genomic DNA of the cell under conditions in which hybridization between the identified genomic DNA and the sequence complementary to genomic DNA occurs. Region(s) of hybridization are region(s) of the genome of the cell to which the protein of binds. A method of identifying a set of genes where cell cycle regulator binding correlates with gene expression and of identifying genomic targets of cell cycle transcription activators in living cells is also encompassed.
(FR)
La présente invention porte sur un procédé d'identification d'une région (ou de plusieurs régions) d'un génome d'une cellule à laquelle (auxquelles) est liée une protéine. Selon les procédés décrits, la protéine de liaison à l'ADN d'une cellule est liée (c'est-à-dire réticulée de manière covalente) à l'ADN génomique d'une cellule. L'ADN génomique auquel la protéine de liaison est liée est retiré et combiné, ou mis en contact avec un ADN comprenant une séquence complémentaire à l'ADN génomique de la cellule dans des conditions où se produit l'hybridation entre l'ADN génomique identifié et la séquence complémentaire à l'ADN génomique. La ou les régions d'hybridation constituent la ou les régions du génome de la cellule où se lie la protéine. L'invention concerne également un procédé d'identification d'un ensemble de gènes où la liaison régulatrice de cycle cellulaire est en corrélation avec l'expression génique, ainsi qu'un procédé d'identification de cibles génomiques d'activateurs transcriptionnels de cycle cellulaire de cellules vivantes.
Également publié en tant que
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