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1. (WO2001075162) JEUX ORDONNES DE MICROECHANTILLONS PERMETTANT DE CRIBLER DES GENES REGULATEURS
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication :    WO/2001/075162    N° de la demande internationale :    PCT/US2001/010096
Date de publication : 11.10.2001 Date de dépôt international : 29.03.2001
Demande présentée en vertu du Chapitre 2 :    26.10.2001    
CIB :
C12Q 1/68 (2006.01)
Déposants : UNIVERSITY OF LOUISVILLE RESEARCH FOUNDATION, INC. [US/US]; University of Louisville, Jouett Hall, Room 200, Louisville, KY 40292 (US)
Inventeurs : WANG, Eugenia; (US)
Mandataire : PABST, Patrea, L.; Holland & Knight LLP, One Atlantic Center, Suite 2000, 1201 West Peachtree Street, N.E., Atlanta, GA 30309-3450 (US)
Données relatives à la priorité :
60/193,888 31.03.2000 US
Titre (EN) MICROARRAYS TO SCREEN REGULATORY GENES
(FR) JEUX ORDONNES DE MICROECHANTILLONS PERMETTANT DE CRIBLER DES GENES REGULATEURS
Abrégé : front page image
(EN)Microarray technology allows the multiple parallel processing of information generated from matrices of huge numbers of loci on a solid substrate, which is useful in the gathering of gene signatures defining specific biological states. An approach has been developed to facilitate this process wherein genes of the same regulatory modality are selected. The transcriptional regulation of these genes is related to the same control element. Primers specific for the regulatory genes are selected, based on minimum cross-reactivity with other genes, using known gene data banks. PCR products of selected regions of known genes either binding to this sequence or whose expression is dependent on this binding, as well as genes interacting with the regulatable genes and control genes, referred to as 'amplicons' or 'gene cDNA fragments' of between about 450 and 1000 nucleotide bases in length, are obtained from a total RNA pool. These amplicons are arrayed on a nylon membrane or other appropriate microchip substrate, which is then used as a regulatory gene-specific mincroarray that is hybridized with sample. Sample will typically be the mRNA obtained from cells associated with a particular state (examples include age or exposure to conditions such as outspace, low gravity), disease (such as cancer or an infection), or disorder (such as a genetic defect or trauma). The transcriptionally regulated profile of regulatory generelated genes specific to a given cultured cell sample is then determined using a software based analysis of the amount of hybridization which is detected. This information is useful in determining drug targets, markers associated with the disease state (either the presence or absence, or the extent of the disease), or the response of the disease state to drugs or other treatments.
(FR)La technologie de jeux ordonnés de microéchantillons permet un traitement parallèle multiple d'informations générées à partir de matrices comprenant un très grand nombre de loci sur un substrat solide, lequel traitement est utile pour réunir des signatures génétiques définissant des états biologiques spécifiques. Afin de faciliter ce traitement, on a développé une approche qui consiste à sélectionner des gènes de la même modalité régulatrice. La régulation transcriptionnelle de ces gènes est liée au même élément de régulation. Sur la base d'une réactivité croisée avec d'autres gènes, on sélectionne des amorces spécifiques des gènes régulateurs au moyen de banques de données génétiques. A partir d'un ensemble d'ARN total, on obtient des produits PCR de régions choisies de gènes connus qui se lient à cette séquence ou dont l'expression dépend de cette liaison, ainsi que des gènes interagissant avec les gènes régulables et les gènes de régulation, désignés sous le nom de 'amplicons' ou 'de fragments d'ADNc génétique' comprenant entre environ 450 et 1000 bases nucléotidiques en longueur. On ordonne ces amplicons sur une membrane de nylon ou tout autre substrat approprié de microcircuit intégré, lequel substrat est ensuite utilisé en tant que jeu ordonné de microéchantillons spécifique de gènes régulateurs, lequel jeu ordonné est hybridé avec un échantillon. Généralement, cet échantillon est l'ARNm obtenu à partir de cellules associées à un état particulier (par exemple, l'âge ou l'exposition à des conditions telles que l'espace extra-atmosphérique, une faible gravité), une maladie (par exemple, le cancer ou une infection) ou un trouble (par exemple, un défaut génétique ou un trauma). On détermine, par une analyse logicielle de la quantité d'hybridation détectée, le profil à régulation transcriptionnelle de gènes liés aux gènes régulateurs spécifiques d'un échantillon de cellule cultivée. Ces informations permettent de déterminer des médicaments cibles, des marqueurs associés à l'état pathologique (soit la présence, soit l'absence, soit l'étendue de la maladie) ou associés à la réponse de l'état pathologique à des médicaments ou à d'autres traitements.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BY, BZ, CA, CH, CN, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EE, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NO, NZ, PL, PT, RO, RU, SD, SE, SG, SI, SK, SL, TJ, TM, TR, TT, TZ, UA, UG, UZ, VN, YU, ZA, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (GH, GM, KE, LS, MW, MZ, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AT, BE, CH, CY, DE, DK, ES, FI, FR, GB, GR, IE, IT, LU, MC, NL, PT, SE, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)