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1. WO2000026230 - VARIANTS PROTEIQUES FAIBLEMENT ALLERGENES

Numéro de publication WO/2000/026230
Date de publication 11.05.2000
N° de la demande internationale PCT/DK1999/000541
Date du dépôt international 12.10.1999
Demande présentée en vertu du Chapitre 2 11.05.2000
CIB
A61K 38/00 2006.01
ANÉCESSITÉS COURANTES DE LA VIE
61SCIENCES MÉDICALE OU VÉTÉRINAIRE; HYGIÈNE
KPRÉPARATIONS À USAGE MÉDICAL, DENTAIRE OU POUR LA TOILETTE
38Préparations médicinales contenant des peptides
A61K 38/11 2006.01
ANÉCESSITÉS COURANTES DE LA VIE
61SCIENCES MÉDICALE OU VÉTÉRINAIRE; HYGIÈNE
KPRÉPARATIONS À USAGE MÉDICAL, DENTAIRE OU POUR LA TOILETTE
38Préparations médicinales contenant des peptides
04Peptides ayant jusqu'à 20 amino-acides dans une séquence entièrement déterminée; Leurs dérivés
10Peptides ayant de 12 à 20 amino-acides
11Oxytocines; Vasopressines; Peptides apparentés
C12N 9/02 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
NMICRO-ORGANISMES OU ENZYMES; COMPOSITIONS LES CONTENANT; CULTURE OU CONSERVATION DE MICRO-ORGANISMES; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE; MILIEUX DE CULTURE
9Enzymes, p.ex. ligases (6.); Proenzymes; Compositions les contenant; Procédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
02Oxydoréductases (1.), p.ex. luciférase
C12N 9/26 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
NMICRO-ORGANISMES OU ENZYMES; COMPOSITIONS LES CONTENANT; CULTURE OU CONSERVATION DE MICRO-ORGANISMES; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE; MILIEUX DE CULTURE
9Enzymes, p.ex. ligases (6.); Proenzymes; Compositions les contenant; Procédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
14Hydrolases (3.)
24agissant sur les composés glycosyliques (3.2)
26agissant sur les liaisons alpha-glucosidiques-1, 4, p.ex. hyaluronidase, invertase, amylase
C12N 9/50 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
NMICRO-ORGANISMES OU ENZYMES; COMPOSITIONS LES CONTENANT; CULTURE OU CONSERVATION DE MICRO-ORGANISMES; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE; MILIEUX DE CULTURE
9Enzymes, p.ex. ligases (6.); Proenzymes; Compositions les contenant; Procédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
14Hydrolases (3.)
48agissant sur les liaisons peptidiques, p.ex. thromboplastine, aminopeptidase de la leucine (3.4)
50Protéinases
C12N 9/54 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
NMICRO-ORGANISMES OU ENZYMES; COMPOSITIONS LES CONTENANT; CULTURE OU CONSERVATION DE MICRO-ORGANISMES; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE; MILIEUX DE CULTURE
9Enzymes, p.ex. ligases (6.); Proenzymes; Compositions les contenant; Procédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
14Hydrolases (3.)
48agissant sur les liaisons peptidiques, p.ex. thromboplastine, aminopeptidase de la leucine (3.4)
50Protéinases
52provenant de bactéries
54les bactéries étant du genre Bacillus
CPC
A61K 38/00
AHUMAN NECESSITIES
61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL, OR TOILET PURPOSES
38Medicinal preparations containing peptides
C12N 15/1037
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
15Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
09Recombinant DNA-technology
10Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
1034Isolating an individual clone by screening libraries
1037Screening libraries presented on the surface of microorganisms, e.g. phage display, E. coli display
C12N 9/0061
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
9Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof
0004Oxidoreductases (1.)
0055acting on diphenols and related substances as donors (1.10)
0057with oxygen as acceptor (1.10.3)
0061Laccase (1.10.3.2)
C12N 9/2408
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
9Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof
14Hydrolases (3)
24acting on glycosyl compounds (3.2)
2402hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
2405Glucanases
2408acting on alpha -1,4-glucosidic bonds
C12N 9/2411
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
9Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof
14Hydrolases (3)
24acting on glycosyl compounds (3.2)
2402hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
2405Glucanases
2408acting on alpha -1,4-glucosidic bonds
2411Amylases
C12N 9/50
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
9Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof
14Hydrolases (3)
48acting on peptide bonds (3.4)
50Proteinases ; , e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
Déposants
  • NOVOZYMES A/S [DK]/[DK]
Inventeurs
  • ROGGEN, Erwin, Ludo
  • OLSEN, Arne, Agerlin
  • ERNST, Steffen
Données relatives à la priorité
PA 1998 0164525.11.1998DK
PA 1998 140230.10.1998DK
PA 1999 0141704.10.1999DK
Langue de publication anglais (EN)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) LOW ALLERGENIC PROTEIN VARIANTS
(FR) VARIANTS PROTEIQUES FAIBLEMENT ALLERGENES
Abrégé
(EN)
The present invention relates to a method of selecting a protein variant having reduced immunogenicity as compared to the parent protein comprising the steps of screening a random peptide display package library with antibodies raised against any protein of interest, sequencing the amino acid sequence of the antibody binding peptides, or the DNA sequence encoding the antibody binding peptides, identifying epitope patterns of a protein by sequence alignment of the reactive peptide sequence, localisation of epitope patterns on the primary 3-dimensional structure of the parent protein, defining an epitope area including amino acids situated within 5 Å from the epitope amino acids, and affecting antibody binding to the epitope, changing the localised epitope patterns, or amino acids defining the epitope area of the parent protein by genetical engineering mutations of a DNA sequence encoding the parent protein without impairing functionality of the protein using the emerging epitope database for eliminating amino acid substitutions creating new or duplicating existing epitope patterns, introducing the mutated DNA sequence into a suitable host, culturing said host and expressing the protein variant, and evaluating the immunogenicity of the protein variant using the parent protein as reference. The invention further relates to the protein variant and use thereof, as well as to a method for producing said protein variant.
(FR)
L'invention concerne un procédé de sélection d'un variant protéique dont l'antigénicité est réduite en comparaison avec la protéine apparentée. Ce procédé consiste à cribler une banque peptidique à affichage aléatoire présentant des anticorps luttant contre toute protéine d'intérêt, à séquencer la séquence d'acides aminés des peptides se liant aux anticorps ou la séquence d'ADN codant pour les peptides se liant aux anticorps, à identifier les modèles de site antigénique d'une protéine par l'alignement de la séquence peptidique réactive et par la localisation de modèles de sites antigéniques sur la première structure tridimensionnelle de la protéine apparentée, à définir un site antigénique comprenant les acides aminés se trouvant à 5 Å des acides aminés du site antigénique et à affecter les anticorps se liant au site antigénique, puis à modifier les modèles de sites antigéniques ou les acides aminés définissant le site antigénique de la protéine apparentée par les mutations de génie génétique d'une séquence d'ADN codant pour la protéine apparentée sans entraver la fonctionnalité de la protéine utilisant la base de données de sites antigéniques émergents servant à éliminer les substitutions d'acides aminés créant ou reproduisant des modèles de sites antigéniques existants, à introduire la séquence d'ADN mutée dans un hôte convenable, à cultiver cet hôte et à exprimer le variant protéique puis finalement à évaluer l'antigénicité du variant protéique à l'aide d'un repère tel que la protéine apparentée. L'invention concerne également le variant protéique et son utilisation ainsi que son procédé de production.
Également publié en tant que
ININ/PCT/2001/582/CHE
NZ511291
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