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1. WO1999001744 - CARTOGRAPHIE OPTIQUE GENOMIQUE A L'AIDE DE CARTES DE RESTRICTION ORDONNEES

Numéro de publication WO/1999/001744
Date de publication 14.01.1999
N° de la demande internationale PCT/US1998/013706
Date du dépôt international 01.07.1998
Demande présentée en vertu du Chapitre 2 02.02.1999
CIB
C12Q 1/68 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
QPROCÉDÉS DE MESURE OU DE TEST FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES, DES ACIDES NUCLÉIQUES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
68faisant intervenir des acides nucléiques
CPC
C12Q 1/683
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6813Hybridisation assays
6827for detection of mutation or polymorphism
683involving restriction enzymes, e.g. restriction fragment length polymorphism [RFLP]
G16B 30/00
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
30ICT specially adapted for sequence analysis involving nucleotides or amino acids
G16B 40/00
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
40ICT specially adapted for biostatistics; ICT specially adapted for bioinformatics-related machine learning or data mining, e.g. knowledge discovery or pattern finding
Déposants
  • NEW YORK UNIVERSITY [US]/[US]
Inventeurs
  • SCHWARTZ, David, C.
  • MISHRA, Bhubaneswar
  • ANANTHARAMAN, Thomas, S.
Mandataires
  • CORUZZI, Laura, A.
Données relatives à la priorité
08/887,97102.07.1997US
Langue de publication anglais (EN)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) GENOMICS VIA OPTICAL MAPPING WITH ORDERED RESTRICTION MAPS
(FR) CARTOGRAPHIE OPTIQUE GENOMIQUE A L'AIDE DE CARTES DE RESTRICTION ORDONNEES
Abrégé
(EN)
A method of producing high-resolution, high-accuracy ordered restriction maps based on data created from the images of populations of individual DNA molecules (clones) digested by restriction enzymes. Detailed modeling and a statistical algorithm, along with an interactive algorithm based on dynamic programming and a heuristic method employing branch-and-bound procedures, are used to find the most likely true restriction map, based on experimental data.
(FR)
La présente invention concerne un procédé permettant de produire des cartes de restriction ordonnées à haute résolution et de grande efficacité sur la base de données créées à partir des images des populations de molécules d'ADN individuelles (clones) digérées par les enzymes de restriction. On utilise un modelage détaillé et un algorithme statistique, ainsi qu'un algorithme interactif fondé sur une programmation dynamique et un procédé heuristique faisant appel à des procédures de séparation et évaluation pour trouver la carte de restriction la plus probable à partir de données expérimentales.
Également publié en tant que
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international