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1. (WO2012096016) NUCLEIC ACID INFORMATION PROCESSING DEVICE AND PROCESSING METHOD THEREOF
국제사무국에 기록된 최신 서지정보   

공개번호:    WO/2012/096016    국제출원번호:    PCT/JP2011/064685
공개일: 19.07.2012 국제출원일: 27.06.2011
IPC:
G06F 19/20 (2011.01), G01N 33/53 (2006.01), G06F 17/30 (2006.01)
출원인: JAPAN SOFTWARE MANAGEMENT CO., LTD. [JP/JP]; Bay Front Yokohama, 5-32, Kinko-cho, Kanagawa-ku, Yokohama-shi, Kanagawa 2210056 (JP) (For All Designated States Except US).
BIOINFORMATICS INSTITUTE FOR GLOBAL GOOD INC. [JP/JP]; 8F Ando Bldg., 6-9 Kitashinagawa 3-chome, Shinagawa-ku, Tokyo 1400001 (JP) (For All Designated States Except US).
NASU, Hisanori [JP/JP]; (JP) (For US Only).
TSUJIMOTO, Atsumi [JP/JP]; (JP) (For US Only).
YAMAKAWA, Takehiro [JP/JP]; (JP) (For US Only).
ONO, Hiroaki [JP/JP]; (JP) (For US Only)
발명자: NASU, Hisanori; (JP).
TSUJIMOTO, Atsumi; (JP).
YAMAKAWA, Takehiro; (JP).
ONO, Hiroaki; (JP)
대리인: SHOYO INTELLECTUAL PROPERTY FIRM; 6F Tobu Yokohama 2ND Bldg. 15-1 Kitasaiwai 2-Chome Nishi-ku, Yokohama-shi Kanagawa 2200004 (JP)
우선권 정보:
2011-003106 11.01.2011 JP
발명의 명칭: (EN) NUCLEIC ACID INFORMATION PROCESSING DEVICE AND PROCESSING METHOD THEREOF
(FR) DISPOSITIF DE TRAITEMENT D'INFORMATIONS D'ACIDE NUCLÉIQUE ET SON PROCÉDÉ DE TRAITEMENT ASSOCIÉ
(JA) 核酸情報処理装置およびその処理方法
요약서: front page image
(EN)The objective of the present invention is to easily obtain hybridization results using a probe set that has no use expiration date and that corresponds to a DNA microarray. The present invention is a nucleic acid information processing device characterized by being provided with: a recording unit that records first base sequence information, which contains information of a plurality of base sequences, and second base sequence information, which contains information of a plurality of base sequences; a threshold reception means that receives information identifying a degree of similarity threshold; a hybridization means that identifies the degree of similarity as well as the starting position and ending position of the similar portion with regard to one-to-one combinations of a base sequence contained in the first base sequence information as a target and a base sequence contained in the second base sequence information as a probe; and a similar base sequence counting means that, for every probe, counts and records in the recording unit the number of targets for which the identified level of similarity is at least the threshold.
(FR)L'objectif de la présente invention est d'obtenir facilement des résultats d'hybridation à l'aide d'un ensemble de sondes qui n'a pas de date d'expiration d'utilisation et qui correspond à une micropuce à ADN. La présente invention concerne un dispositif de traitement d'informations d'acide nucléique caractérisé en ce qu'il comprend : une unité d'enregistrement qui enregistre des premières informations de séquence de base, qui contiennent des informations d'une pluralité de séquences de base, et des secondes informations de séquence de base qui contiennent des informations d'une pluralité de séquences de base ; un moyen de réception de données de seuil qui reçoit des informations identifiant un degré de seuil de similarité ; un moyen d'hybridation qui identifie le degré de similarité ainsi que la position initiale et la position terminale de la partie similaire en ce qui concerne des combinaisons une-à-une d'une séquence de base contenue dans les premières informations de séquence de base en tant que cible et d'une séquence de base contenue dans les secondes informations de séquence de base en tant que sonde ; et un moyen de comptage de séquences de base similaires qui, pour chaque sonde, compte et enregistre dans l'unité d'enregistrement le nombre de cibles pour lesquelles le niveau de similarité identifié est au moins la valeur seuil.
(JA) DNAマイクロアレイに相当する使用有効期限のないプローブセットを用いて容易にハイブリダイゼーション結果を得ることを目的とする。 核酸情報処理装置であって、複数の塩基配列の情報を含む第一の塩基配列情報と、複数の塩基配列の情報を含む第二の塩基配列情報と、を記憶する記憶部と、類似度の閾値を特定する情報を受け付ける閾値受付手段と、第一の塩基配列情報に含まれる塩基配列をターゲットとし、第二の塩基配列情報に含まれる塩基配列をプローブとする一対一の組み合わせについて、類似度および類似部分の開始位置および終了位置を特定するハイブリダイゼーション手段と、特定した類似度が閾値以上となるターゲットの数を、プローブごとに計数し、記憶部に記憶する類似塩基配列計数手段と、を備えることを特徴とする。
지정국: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PE, PG, PH, PL, PT, RO, RS, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
공개언어: Japanese (JA)
출원언어: Japanese (JA)