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1. WO2020261858 - デジタルPCRの測定方法および測定装置

公開番号 WO/2020/261858
公開日 30.12.2020
国際出願番号 PCT/JP2020/020998
国際出願日 27.05.2020
予備審査請求日 07.12.2020
IPC
C12M 1/00 2006.1
C化学;冶金
12生化学;ビール;酒精;ぶどう酒;酢;微生物学;酵素学;突然変異または遺伝子工学
M酵素学または微生物学のための装置
1酵素学または微生物学のための装置
C12M 1/34 2006.1
C化学;冶金
12生化学;ビール;酒精;ぶどう酒;酢;微生物学;酵素学;突然変異または遺伝子工学
M酵素学または微生物学のための装置
1酵素学または微生物学のための装置
34状態の測定または検出手段をもって測定または試験を行なうもの,例.コロニー計数器
G01N 21/64 2006.1
G物理学
01測定;試験
N材料の化学的または物理的性質の決定による材料の調査または分析
21光学的手段,すなわち,赤外線,可視光線または紫外線を使用することによる材料の調査または分析
62調査される材料が励起され,それにより光を発しまたは入射光の波長に変化を生ずるシステム
63光学的励起
64蛍光;燐光
C12Q 1/6816 2018.1
C化学;冶金
12生化学;ビール;酒精;ぶどう酒;酢;微生物学;酵素学;突然変異または遺伝子工学
Q酵素,核酸または微生物を含む測定または試験方法;そのための組成物または試験紙;その組成物を調製する方法;微生物学的または酵素学的方法における状態応答制御
1酵素,核酸または微生物を含む測定または試験方法;そのための組成物;そのような組成物の製造方法
68核酸を含むもの
6813ハイブリダイゼーションアッセイ
6816検出手段により特徴付けられるもの
C12Q 1/6844 2018.1
C化学;冶金
12生化学;ビール;酒精;ぶどう酒;酢;微生物学;酵素学;突然変異または遺伝子工学
Q酵素,核酸または微生物を含む測定または試験方法;そのための組成物または試験紙;その組成物を調製する方法;微生物学的または酵素学的方法における状態応答制御
1酵素,核酸または微生物を含む測定または試験方法;そのための組成物;そのような組成物の製造方法
68核酸を含むもの
6844核酸増幅反応
CPC
C12M 1/00
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
MAPPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY; APPARATUS FOR CULTURING MICROORGANISMS FOR PRODUCING BIOMASS, FOR GROWING CELLS OR FOR OBTAINING FERMENTATION OR METABOLIC PRODUCTS, i.e. BIOREACTORS OR FERMENTERS
1Apparatus for enzymology or microbiology
C12M 1/34
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
MAPPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY; APPARATUS FOR CULTURING MICROORGANISMS FOR PRODUCING BIOMASS, FOR GROWING CELLS OR FOR OBTAINING FERMENTATION OR METABOLIC PRODUCTS, i.e. BIOREACTORS OR FERMENTERS
1Apparatus for enzymology or microbiology
34Measuring or testing with condition measuring or sensing means, e.g. colony counters
C12Q 1/6816
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6813Hybridisation assays
6816characterised by the detection means
C12Q 1/6844
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6844Nucleic acid amplification reactions
G01N 21/64
GPHYSICS
01MEASURING; TESTING
NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
21Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
62Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light
63optically excited
64Fluorescence; Phosphorescence
出願人
  • 株式会社日立製作所 HITACHI, LTD. [JP]/[JP]
発明者
  • 田中 淳子 TANAKA, Junko
  • 中川 樹生 NAKAGAWA, Tatsuo
  • 島崎 譲 SHIMAZAKI, Yuzuru
  • 白鳥 亜希子 SHIRATORI, Akiko
代理人
  • 一色国際特許業務法人 ISSHIKI & CO.
優先権情報
2019-11898126.06.2019JP
公開言語 (言語コード) 日本語 (ja)
出願言語 (言語コード) 日本語 (JA)
指定国 (国コード)
発明の名称
(EN) MEASUREMENT METHOD AND MEASUREMENT DEVICE FOR DIGITAL PCR
(FR) PROCÉDÉ DE MESURE ET DISPOSITIF DE MESURE POUR PCR NUMÉRIQUE
(JA) デジタルPCRの測定方法および測定装置
要約
(EN) The present invention addresses the problem of providing a novel analysis method for digital PCR. In this analysis method for digital PCR, which is disclosed in the description of the present application, a DNA detection method is used which comprises a step for dividing, into a plurality of fractions, a DNA solution containing a fluorescence-labeled probe or a DNA intercalator and DNA to be detected; a step for performing a nucleic acid amplification reaction in the respective fractions; a step for measuring a florescence intensity associated with temperature change; a step for calculating a melting temperature from a melting curve of double-strand DNA as measured on the basis of a change in the fluorescence intensity associated with the temperature change; and a step for calculating a difference in temperature between two points having a slope having a predetermined value on the melting curve indicating changes in the fluorescence intensity.
(FR) Nouveau procédé d'analyse pour PCR numérique. Dans ce procédé d'analyse pour PCR numérique, étant décrit dans la description de la présente invention, un procédé de détection d'ADN est utilisé, ce dernier consistant à diviser, en une pluralité de fractions, une solution d'ADN contenant une sonde marquée par fluorescence ou un intercalant d'ADN et de l'ADN à détecter; à effectuer une réaction d'amplification d'acide nucléique dans les fractions respectives; à mesurer une intensité de fluorescence associée à un changement de température; à calculer une température de fusion à partir d'une courbe de fusion d'ADN double brin telle que mesurée sur la base d'un changement de l'intensité de fluorescence associée au changement de température; et à calculer une différence de température entre deux points ayant une pente ayant une valeur prédéterminée sur la courbe de fusion indiquant des changements de l'intensité de fluorescence.
(JA) 本発明の課題は、新たなデジタルPCRの解析方法を提供することである。本明細書に開示のデジタルPCRの解析方法において、蛍光標識プローブまたはDNAインターカレーターと検出対象のDNAを含有するDNA溶液を複数の区画に分割する工程と、前記区画の中で核酸増幅反応を行う工程と、温度変化に伴って蛍光強度を測定する工程と、前記温度変化に伴う前記蛍光強度の変化に基づいて計測されるDNA二重鎖の融解曲線から融解温度を算出する工程と、前記蛍光の強度の変化を示す融解曲線上で、所定値の傾きを有する2点の温度差を算出する工程と、を含む、DNA検出方法を用いる。
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