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1. WO2020241829 - 情報処理装置、情報処理方法及び情報処理プログラム

公開番号 WO/2020/241829
公開日 03.12.2020
国際出願番号 PCT/JP2020/021351
国際出願日 29.05.2020
IPC
G16B 30/00 2019.1
G物理学
16特定の用途分野に特に適合した情報通信技術[2018.01]
Bバイオインフォマティクス,すなわち計算分子生物学において遺伝子または蛋白質関連データの処理を行うことに特に適合した情報通信技術[2019.01]
30核酸またはアミノ酸の配列分析に特に適合したICT
CPC
G16B 30/00
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
30ICT specially adapted for sequence analysis involving nucleotides or amino acids
出願人
  • 日本電気株式会社 NEC CORPORATION [JP]/[JP]
発明者
  • 麻生川 稔 ASOGAWA, Minoru
代理人
  • 加藤 朝道 KATO, Asamichi
優先権情報
2019-10271631.05.2019JP
公開言語 (言語コード) 日本語 (ja)
出願言語 (言語コード) 日本語 (JA)
指定国 (国コード)
発明の名称
(EN) INFORMATION PROCESSING DEVICE, INFORMATION PROCESSING METHOD, AND INFORMATION PROCESSING PROGRAM
(FR) DISPOSITIF DE TRAITEMENT D'INFORMATIONS, PROCÉDÉ DE TRAITEMENT D'INFORMATIONS ET PROGRAMME DE TRAITEMENT D'INFORMATIONS
(JA) 情報処理装置、情報処理方法及び情報処理プログラム
要約
(EN) The present invention improves the reliability of DNA profiling. An error sequence generated due to artifacts in PCR and a generation probability thereof are obtained by a preparatory experiment, and the error sequence and the generation probability are stored in a storage unit. A sequence analysis result of the DNA profiling is obtained. Regarding each of read sequences enumerated in the analysis result, reference is made to the storage unit by regarding said read sequence as a true sequence, a corresponding error sequence is obtained as a predictive error sequence, and a value obtained by multiplication of the number of reading times of the read sequence by a generation probability of the corresponding error sequence is obtained as a predictive number of reading times. Further, when search is performed on the read sequences enumerated in the analysis result for a read sequence that matches with the predictive error sequence and the number of reading times of the searched read sequence matches with the predictive number of reading times, it is determined that the searched read sequence is an error sequence.
(FR) La présente invention améliore la fiabilité du profilage d'ADN. Une séquence d'erreurs générée en raison d'artéfacts dans la réaction en chaîne de la polymérase (PCR) et une probabilité de génération de celle-ci sont obtenues par une expérience préparatoire, et la séquence d'erreurs et la probabilité de génération sont stockées dans une unité de stockage. Un résultat d'analyse de séquence du profilage d'ADN est obtenu. Concernant chacune des séquences lues énumérées dans le résultat d'analyse, une référence est faite à l'unité de stockage en considérant ladite séquence lue comme séquence vraie, une séquence d'erreurs correspondante est obtenue en tant que séquence d'erreurs prédictive, et une valeur obtenue par multiplication du nombre de lectures de la séquence lue par une probabilité de génération de la séquence d'erreurs correspondante est obtenue en tant que nombre prédictif de lectures. En outre, lorsqu'une recherche est effectuée sur les séquences lues énumérées dans le résultat d'analyse pour une séquence lue qui correspond à la séquence d'erreurs prédictive et que le nombre de lectures de la séquence lue recherchée correspond au nombre prédictif de lectures, il est déterminé que la séquence lue recherchée est une séquence d'erreurs.
(JA) DNA鑑定の信頼性を向上する。PCRにおけるアーチファクトによって生じるエラー配列と、その発生確率を予備実験によって求め、記憶部に格納しておく。DNA鑑定におけるシーケンス解析結果を取得する。解析結果に列挙された読取配列の各々について、読取配列を真なる配列とみなして記憶部を参照し、対応するエラー配列を予測エラー配列として取得するとともに、対応するエラー配列の発生確率を読取配列のリード回数に対して乗算して得た値を予測リード回数として取得する。そして、解析結果に列挙された読取配列の中から予測エラー配列と一致する読取配列を検索し、検索された読取配列のリード回数が予測リード回数と適合する場合に、検索された読取配列がエラー配列であると判定する。
関連特許文献
US17614059出願が移行したが国内段階でまだ公開されていないか、WIPO にデータを提供していない国への移行が通知されたか、あるいは出願の形式に問題があり、またはその他の理由で利用可能な状態でないため、PATENTSCOPE で表示できません。
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