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1. (WO2018235938) 核酸をシークエンシングする方法および解析する方法
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国際公開番号: WO/2018/235938 国際出願番号: PCT/JP2018/023778
国際公開日: 27.12.2018 国際出願日: 22.06.2018
IPC:
C12Q 1/6869 (2018.01) ,C12Q 1/6844 (2018.01)
[IPC code unknown for C12Q 1/6869][IPC code unknown for C12Q 1/6844]
出願人:
国立研究開発法人理化学研究所 RIKEN [JP/JP]; 埼玉県和光市広沢2番1号 2-1, Hirosawa, Wako-shi, Saitama 3510198, JP
発明者:
城口 克之 SHIROGUCHI Katsuyuki; JP
代理人:
大野 聖二 OHNO Seiji; JP
森田 裕 MORITA Yutaka; JP
優先権情報:
62/523,85723.06.2017US
発明の名称: (EN) METHODS FOR SEQUENCING AND ANALYZING NUCLEIC ACIDS
(FR) PROCÉDÉ POUR SÉQUENÇAGE ET PROCÉDÉ POUR ANALYSE D'ACIDES NUCLÉIQUES
(JA) 核酸をシークエンシングする方法および解析する方法
要約:
(EN) The present invention provides methods for correcting errors which occur in the digital assay of nucleic acids using molecular bar codes. More specifically, provided are: a method for identifying mispairing of molecular bar codes and index sequences in accordance with the detection frequency; a method for identifying molecular bar codes having base substitutions which have been categorized into the same cluster; and a method for identifying molecular bar codes having insertions or deletions using molecular bar codes including fixed bases and random bases.
(FR) L'invention fournit un procédé de correction d’erreurs générées dans un procédé de quantification digital d'acides nucléiques mettant en œuvre un code à barres moléculaire. Concrètement, l'invention fournit : un procédé spécifiant un mauvais appariement du code à barres moléculaire avec une séquence d'index selon une fréquence de détection; un procédé spécifiant des codes à barres moléculaires présentant des substitutions de bases divisées en groupes identiques; et un procédé spécifiant des codes à barres moléculaires présentant une insertion ou une déficience mettant en œuvre des codes à barres moléculaires contenant des bases fixes et des bases aléatoires.
(JA) 本発明は、分子バーコードを用いた核酸のデジタル定量法において生じるエラーの訂正方法を提供する。具体的には、検出頻度に応じてインデックス配列と分子バーコードのミスペアリングを特定する方法、同一クラスターに分類された塩基置換を有する分子バーコードを特定する方法、および固定塩基とランダム塩基とを含む分子バーコードを用いて挿入または欠失を有する分子バーコードを特定する方法が提供される。
指定国: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
アフリカ広域知的所有権機関(ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
ユーラシア特許庁(EAPO) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
欧州特許庁(EPO) (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
アフリカ知的所有権機関(OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
国際公開言語: 日本語 (JA)
国際出願言語: 日本語 (JA)