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1. (WO2018101375) ヒトゲノムDNA検出方法
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国際公開番号: WO/2018/101375 国際出願番号: PCT/JP2017/042943
国際公開日: 07.06.2018 国際出願日: 30.11.2017
IPC:
C12Q 1/68 (2018.01) ,C12N 15/09 (2006.01)
C 化学;冶金
12
生化学;ビール;酒精;ぶどう酒;酢;微生物学;酵素学;突然変異または遺伝子工学
Q
酵素または微生物を含む測定または試験方法そのための組成物または試験紙;その組成物を調製する方法;微生物学的または酵素学的方法における状態応答制御
1
酵素または微生物を含む測定または試験方法;そのための組成物;そのような組成物の製造方法
68
核酸を含むもの
C 化学;冶金
12
生化学;ビール;酒精;ぶどう酒;酢;微生物学;酵素学;突然変異または遺伝子工学
N
微生物または酵素;その組成物;微生物の増殖,保存,維持;突然変異または遺伝子工学;培地
15
突然変異または遺伝子工学;遺伝子工学に関するDNAまたはRNA,ベクター,例.プラスミド,またはその分離,製造または精製;そのための宿主の使用
09
組換えDNA技術
出願人:
国立大学法人秋田大学 AKITA UNIVERSITY [JP/JP]; 秋田県秋田市手形学園町1番1号 1-1, Tegata Gakuen-Machi, Akita-shi, Akita 0108502, JP
発明者:
明石 英雄 AKASHI, Hideo; JP
船越 広大 FUNAKOSHI, Kodai; JP
代理人:
廣田 雅紀 HIROTA, Masanori; JP
優先権情報:
2016-23311930.11.2016JP
発明の名称: (EN) METHOD FOR DETECTING HUMAN GENOMIC DNA
(FR) PROCÉDÉ DE DÉTECTION D'ADN GÉNOMIQUE HUMAIN
(JA) ヒトゲノムDNA検出方法
要約:
(EN) Provided is a method for detecting and/or assaying human genomic DNA in a test sample at high sensitivity. One "human Alu model sequence" representing the consensus sequence of 46 human Alu subfamilies is identified, and PCR primer-probe candidates for Alu detection are selected using this human Alu model sequence. Next, a primer-probe set that is an oligonucleotide sequence which hybridizes specifically with the human Alu sequence and that comprises an oligonucleotide sequence capable of minimizing dimer formation is selected using proprietary criteria. The human genomic DNA in the test sample can be detected and/or assayed at high sensitivity by conducting quantitative real-time PCR using the PCR primer-probe for Alu detection obtained in this manner.
(FR) L'invention concerne un procédé de détection et/ou de dosage d'ADN génomique humain dans un échantillon d'essai à une sensibilité élevée. Une " séquence modèle d'Alu humaine " représentant la séquence consensus de 46 sous-familles d'Alu humaines est identifiée, et des amorces-sondes de PCR candidates pour la détection d'Alu sont sélectionnées à l'aide de cette séquence modèle d'Alu humaine. Ensuite, un ensemble amorce-sonde qui est une séquence oligonucléotidique qui s'hybride spécifiquement avec la séquence d'Alu humaine et qui comprend une séquence oligonucléotidique apte à minimiser la formation de dimère est sélectionné à l'aide de critères propriétaires. L'ADN génomique humain dans l'échantillon d'essai peut être détecté et/ou analysé à une sensibilité élevée par la réalisation d'une PCR quantitative en temps réel à l'aide de l'amorce-sonde de PCR pour la détection d'Alu ainsi obtenue.
(JA) 被験試料中のヒトゲノムDNAを高感度に検出及び/又は定量する方法を提供すること。 46のヒトAluサブファミリーのコンセンサス配列を代表する一つの「ヒトAluモデル配列」を同定し、このヒトAluモデル配列を用いてAlu検出用PCRプライマー・プローブ候補を選択する。次に、ヒトAlu配列に特異的にハイブリダイズするオリゴヌクレオチド配列であって、且つ、ダイマーの形成を最小限に抑え得るオリゴヌクレオチド配列からなるプライマー・プローブセットを、独自のクライテリアを用いて選択する。このようにして得られたAlu検出用PCRプライマー・プローブを用いて定量リアルタイムPCRを行うことにより、被験試料中のヒトゲノムDNAを高感度に検出及び/又は定量することができる。
指定国: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
アフリカ広域知的所有権機関(ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
ユーラシア特許庁(EAPO) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
欧州特許庁(EPO) (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
アフリカ知的所有権機関(OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
国際公開言語: 日本語 (JA)
国際出願言語: 日本語 (JA)