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1. WO2016159111 - 胎児の遺伝子状態を判定する方法

公開番号 WO/2016/159111
公開日 06.10.2016
国際出願番号 PCT/JP2016/060444
国際出願日 30.03.2016
IPC
C12Q 1/68 2006.01
C化学;冶金
12生化学;ビール;酒精;ぶどう酒;酢;微生物学;酵素学;突然変異または遺伝子工学
Q酵素,核酸または微生物を含む測定または試験方法;そのための組成物または試験紙;その組成物を調製する方法;微生物学的または酵素学的方法における状態応答制御
1酵素,核酸または微生物を含む測定または試験方法;そのための組成物;そのような組成物の製造方法
68核酸を含むもの
C12N 15/09 2006.01
C化学;冶金
12生化学;ビール;酒精;ぶどう酒;酢;微生物学;酵素学;突然変異または遺伝子工学
N微生物または酵素;その組成物;微生物の増殖,保存,維持;突然変異または遺伝子工学;培地
15突然変異または遺伝子工学;遺伝子工学に関するDNAまたはRNA,ベクター,例.プラスミド,またはその分離,製造または精製;そのための宿主の使用
09組換えDNA技術
CPC
C12N 15/09
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
15Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
09Recombinant DNA-technology
C12N 15/1089
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
15Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
09Recombinant DNA-technology
10Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
1034Isolating an individual clone by screening libraries
1089Design, preparation, screening or analysis of libraries using computer algorithms
C12Q 1/6811
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6811Selection methods for production or design of target specific oligonucleotides or binding molecules
C12Q 1/6876
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
C12Q 1/6883
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
6883for diseases caused by alterations of genetic material
C12Q 2600/156
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
2600Oligonucleotides characterized by their use
156Polymorphic or mutational markers
出願人
  • 富士フイルム株式会社 FUJIFILM CORPORATION [JP]/[JP]
発明者
  • 大内 彩 OUCHI Aya
  • 辻本 尭之 TSUJIMOTO Takayuki
  • 長瀬 雅也 NAGASE Masaya
  • 石井 靖幸 ISHII Yasuyuki
代理人
  • 渡辺 望稔 WATANABE Mochitoshi
優先権情報
2015-07431831.03.2015JP
公開言語 (言語コード) 日本語 (JA)
出願言語 (言語コード) 日本語 (JA)
指定国 (国コード)
発明の名称
(EN) METHOD FOR DETERMINING GENE STATE OF FETUS
(FR) PROCÉDÉ PERMETTANT DE DÉTERMINER L'ÉTAT DES GÈNES CHEZ UN FŒTUS
(JA) 胎児の遺伝子状態を判定する方法
要約
(EN)
Provided is a method for determining the gene state of a fetus, said method comprising: a target region selection step for selecting a target region for determining the gene state from among regions on human genome; a step for isolating a single cell from a maternal blood sample; a step for extracting genomic DNA from the single cell; a step for PCR amplifying the target region using the genomic DNA extracted from the single cell as a template and employing a primer set that is designed so as to PCR amplify the target region; and a DNA sequencing step for decoding the DNA base sequence of the PCR amplification product of the target region. In this method, the aforesaid primer set designed so as to PCR amplify the target region has been designed by a method for designing a primer set to be subjected to a polymerase chain reaction, said method comprising a first stage screening step based on local alignment scores and a second stage screening step based on global alignment scores.
(FR)
L'invention concerne un procédé permettant de déterminer l'état des gènes chez un fœtus, ledit procédé comprenant : une étape de sélection de région cible pour sélectionner une région cible afin de déterminer l'état des gènes parmi des régions sur un génome humain; une étape d'isolation d'une cellule unique à partir d'un échantillon de sang maternel; une étape d'extraction d'ADN génomique à partir de la cellule unique; une étape d'amplification par PCR de la région cible au moyen de l'ADN génomique extrait de la cellule unique en tant que modèle et en utilisant un ensemble d'amorces conçu de manière à amplifier par PCR la région cible; et une étape de séquençage d'ADN pour décoder la séquence ADN de base du produit d'amplification par PCR de la région cible. Dans ce procédé, ledit ensemble d'amorces conçu de manière à amplifier par PCR la région cible a été conçu à l'aide d'un procédé de conception d'un ensemble d'amorces à soumettre à une réaction en chaîne par polymérase, ledit procédé comprenant une étape d'analyse de premier niveau sur la base de scores d'alignement local et une étape d'analyse de second niveau sur la base des scores d'alignement global.
(JA)
 ヒトゲノム上の領域から遺伝子状態を判定するための目的領域を選択する目的領域選択工程と、母体血試料から単一細胞を単離する工程と、単一細胞からゲノムDNAを抽出する工程と、単一細胞から抽出したゲノムDNAを鋳型として、目的領域をPCR増幅するように設計されたプライマーセットを用いて、目的領域をPCR増幅する工程と、目的領域のPCR増幅産物のDNA塩基配列を解読するDNAシークエンシング工程と、とを備え、目的領域をPCR増幅するように設計されたプライマーセットは、ローカルアラインメントスコアに基づく第1段階選抜工程と、グローバルアラインメントスコアに基づく第2段階選抜工程とを有するポリメラーゼ連鎖反応に供するプライマーセットの設計方法によって設計される、胎児の遺伝子状態を判定する方法が提供される。
国際事務局に記録されている最新の書誌情報