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1. (WO2015146852) 基準ゲノムデータを生成する方法、装置及びプログラム、差分ゲノムデータを生成する方法、装置及びプログラム、データを復元する方法、装置及びプログラム
国際事務局に記録されている最新の書誌情報

国際公開番号: WO/2015/146852 国際出願番号: PCT/JP2015/058577
国際公開日: 01.10.2015 国際出願日: 20.03.2015
IPC:
G06F 19/22 (2011.01) ,C12Q 1/68 (2006.01)
G 物理学
06
計算;計数
F
電気的デジタルデータ処理
19
特定の用途に特に適合したデジタル計算またはデータ処理の装置または方法
10
バイオインフォマティクス,すなわち計算分子生物学において遺伝子または蛋白質関連データの処理を行うための方法またはシステム
22
核酸またはアミノ酸の配列比較に関するもの,例.ホモロジー検索,モチーフまたはSNP発見,配列アラインメント
C 化学;冶金
12
生化学;ビール;酒精;ぶどう酒;酢;微生物学;酵素学;突然変異または遺伝子工学
Q
酵素または微生物を含む測定または試験方法そのための組成物または試験紙;その組成物を調製する方法;微生物学的または酵素学的方法における状態応答制御
1
酵素または微生物を含む測定または試験方法;そのための組成物;そのような組成物の製造方法
68
核酸を含むもの
出願人:
株式会社 東芝 KABUSHIKI KAISHA TOSHIBA [JP/JP]; 東京都港区芝浦一丁目1番1号 1-1, Shibaura 1-chome, Minato-ku, Tokyo 1058001, JP
発明者:
宮下 茂 MIYASHITA Shigeru; JP
佐藤 肇 SATOH Hajime; JP
岩田 誠司 IWATA Seiji; JP
高山 卓三 TAKAYAMA Takuzo; JP
代理人:
勝沼 宏仁 KATSUNUMA Hirohito; JP
優先権情報:
2014-06053724.03.2014JP
発明の名称: (EN) METHOD, DEVICE AND PROGRAM FOR GENERATING REFERENCE GENOME DATA, METHOD, DEVICE AND PROGRAM FOR GENERATING DIFFERENTIAL GENOME DATA, AND METHOD, DEVICE AND PROGRAM FOR RESTORING DATA
(FR) PROCÉDÉ, DISPOSITIF ET PROGRAMME POUR GÉNÉRER DES DONNÉES DE GÉNOME DE RÉFÉRENCE, PROCÉDÉ, DISPOSITIF ET PROGRAMME POUR GÉNÉRER DES DONNÉES DE GÉNOME DIFFÉRENTIELLES, ET PROCÉDÉ, DISPOSITIF ET PROGRAMME POUR RESTAURER DES DONNÉES
(JA) 基準ゲノムデータを生成する方法、装置及びプログラム、差分ゲノムデータを生成する方法、装置及びプログラム、データを復元する方法、装置及びプログラム
要約:
(EN) The invention addresses the problem of improving the compression efficiency of genome data. A method of generating reference genome data according to this mode of embodiment comprises a determination step in which base information in at least one position in a base sequence is determined according to the frequency of appearance of the base information in said position in a plurality of base sequence data from mutually different subjects. Further, the method of generating reference genome data comprises a generation step in which reference genome data, in which said position is associated with the base information determined in the determination step, are generated.
(FR) La présente invention traite le problème d'amélioration de l'efficacité de compression de données de génome. Un procédé de génération de données de génome de référence selon ce mode de réalisation comprend une étape de détermination dans laquelle des informations de base dans au moins une position dans une séquence de base sont déterminées en fonction de la fréquence d'apparition des informations de base dans ladite position dans une pluralité de données de séquence de base provenant de sujets mutuellement différents. En outre, le procédé de génération de données de génome de référence comprend une étape de génération dans laquelle des données de génome de référence, dans lesquelles ladite position est associée aux informations de base déterminées dans l'étape de détermination, sont générées.
(JA) ゲノムデータの圧縮効率を向上させることを課題とする。 本実施形態に係る基準ゲノムデータ生成方法によれば、互いに被験者が異なる複数の塩基配列データにおいて、塩基配列の少なくとも一つの位置における塩基情報の出現頻度に応じて、前記位置における塩基情報を決定する決定工程を有する。更に、基準ゲノムデータ生成方法は、前記決定工程で決定された塩基情報と前記位置とを対応づけた基準ゲノムデータを生成する生成工程を有する。
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指定国: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
アフリカ広域知的所有権機関(ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
ユーラシア特許庁(EAPO) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
欧州特許庁(EPO) (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
アフリカ知的所有権機関(OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
国際公開言語: 日本語 (JA)
国際出願言語: 日本語 (JA)
また、:
EP3125143JPWO2015146852