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1. (WO2015076355) 標的分子に結合するポリペプチドの決定方法及び決定システム
国際事務局に記録されている最新の書誌情報   

Translation翻訳: 原文 > 日本語
国際公開番号:    WO/2015/076355    国際出願番号:    PCT/JP2014/080853
国際公開日: 28.05.2015 国際出願日: 21.11.2014
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01), C12M 1/00 (2006.01), G01N 33/53 (2006.01)
出願人: MOLCURE, INC. [JP/JP]; Akihabara KMD Building 3F, 1-12-11, Taito, Taito-ku, Tokyo 1100016 (JP)
発明者: OGAWA, Ryu; (JP)
代理人: INABA, Yoshiyuki; (JP)
優先権情報:
2013-242304 22.11.2013 JP
発明の名称: (EN) METHOD FOR DETERMINING AND SYSTEM FOR DETERMINING POLYPEPTIDE BONDING TO TARGET MOLECULE
(FR) PROCÉDÉ DE DÉTERMINATION ET SYSTÈME DE DÉTERMINATION D'UNE LIAISON POLYPEPTIDIQUE À UNE MOLÉCULE CIBLE
(JA) 標的分子に結合するポリペプチドの決定方法及び決定システム
要約: front page image
(EN)The problem addressed by the present invention is to provide a method for finding, from libraries produced by display methods that can draw correspondence with polypeptides and nucleic acids coding the same, a target molecule bonding polypeptide, which cannot be found by conventional methods in which Escherichia coli bacteria are infected with phages obtained by repeatedly carrying out panning and cloning is carried out, and for designing a polypeptide that bonds to the target molecule on the basis of an amino acid sequence for that polypeptide or amino acid sequence information. The present invention provides a sequencing method for polypeptides that bonds to the target molecule that includes: a step for carrying out panning using the target molecule with a library produced by a display method; a step for analyzing the sequences of polypeptide groups of the library before the panning step and all polypeptide groups of the library after the panning step with a next-generation sequencer; a scoring step for evaluating and scoring amplification factors for each polypeptide from panning on the basis of results from the sequencing step; and a step for selecting a polypeptide with a high score.
(FR)Le problème abordé par la présente invention est de fournir un procédé permettant de découvrir, à partir de bibliothèques produites par des procédés de présentation qui peuvent faire une correspondance entre des polypeptides et les acides nucléiques codant pour ceux-ci, un polypeptide se liant à une molécule cible, qui ne peut pas être découvert par des procédés classiques, dans lequel des bactéries Escherichia coli sont infectées par des phages obtenus en mettant en œuvre de manière répétée une adhérence sur plastique et un clonage, et de concevoir un polypeptide qui se lie à la molécule cible sur la base d'une séquence d'acides aminés pour les informations de ce polypeptide ou de cette séquence d'acides aminés. La présente invention concerne un procédé de séquençage pour des polypeptides qui se lient à la molécule cible comprenant : une étape permettant de mettre en œuvre une adhérence sur plastique en faisant appel à la molécule cible avec une bibliothèque produite par un procédé de présentation ; une étape permettant d'analyser les séquences de groupes de polypeptides de la bibliothèque avant l'étape d'adhérence sur plastique et l'ensemble des groupes de polypeptides de la bibliothèque après l'étape d'adhérence sur plastique avec un séquenceur nouvelle génération ; une étape de notation permettant d'évaluer et de noter les facteurs d'amplification pour chacun des polypeptides provenant de l'adhérence sur plastique sur la base des résultats de l'étape de séquençage ; et une étape permettant de sélectionner un polypeptide ayant un score élevé.
(JA) 本発明は、ポリペプチドとこれをコードする核酸との対応付けが可能なディスプレイ法で作製したライブラリから、従来のパニングを繰り返して得られたファージを大腸菌に感染させてクローニングする方法では見出せないような標的分子結合ポリペプチドを見出し、そのポリペプチドのアミノ酸配列又は核酸配列情報に基づいて標的分子に結合するポリペプチドをデザインする方法を提供することを課題とする。 本発明は、標的分子を用いて、ディスプレイ法で作製したライブラリでパニングを行う工程と、パニング工程前のライブラリのポリペプチド群と、前記パニング工程後のライブラリのポリペプチド群のすべてについて配列を次世代シーケンサで解析する工程と、シーケンシング工程の結果に基づいて、パニングによる各ポリペプチドの増幅率を評価してスコア化するスコア化工程と、スコアの高いポリペプチドを選択する工程と、を含む標的分子に結合するポリペプチドの配列決定方法を提供する。
指定国: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
アフリカ広域知的所有権機関(ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
ユーラシア特許庁(EAPO) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
欧州特許庁(EPO) (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
アフリカ知的所有権機関(OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
国際公開言語: Japanese (JA)
国際出願言語: Japanese (JA)