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1. WO2015020218 - DNA結合タンパク質ドメインの改変による高活性TALEタンパク質

公開番号 WO/2015/020218
公開日 12.02.2015
国際出願番号 PCT/JP2014/071116
国際出願日 08.08.2014
IPC
C12N 15/09 2006.01
C化学;冶金
12生化学;ビール;酒精;ぶどう酒;酢;微生物学;酵素学;突然変異または遺伝子工学
N微生物または酵素;その組成物;微生物の増殖,保存,維持;突然変異または遺伝子工学;培地
15突然変異または遺伝子工学;遺伝子工学に関するDNAまたはRNA,ベクター,例.プラスミド,またはその分離,製造または精製;そのための宿主の使用
09組換えDNA技術
A01H 5/00 2006.01
A生活必需品
01農業;林業;畜産;狩猟;捕獲;漁業
H新規植物またはそれらを得るための処理;組織培養技術による植物の増殖
5被子植物,すなわち,顕花植物で,植物部位により特徴付けられるもの;植物分類学以外のものにより特徴付けられる被子植物
A01K 67/027 2006.01
A生活必需品
01農業;林業;畜産;狩猟;捕獲;漁業
K畜産;鳥,魚,昆虫の飼育;漁業;他に分類されない動物の飼育または繁殖;新規な動物
67他に分類されない動物の飼育または繁殖;新規な動物
027新規な脊椎動物
C07K 14/195 2006.01
C化学;冶金
07有機化学
Kペプチド
1421個以上のアミノ酸を含有するペプチド;ガストリン;ソマトスタチン;メラノトロピン;その誘導体
195細菌から
C07K 14/47 2006.01
C化学;冶金
07有機化学
Kペプチド
1421個以上のアミノ酸を含有するペプチド;ガストリン;ソマトスタチン;メラノトロピン;その誘導体
435動物から;ヒトから
46脊椎動物から
47哺乳動物から
C07K 19/00 2006.01
C化学;冶金
07有機化学
Kペプチド
19ハイブリッドペプチド
CPC
C07K 14/195
CCHEMISTRY; METALLURGY
07ORGANIC CHEMISTRY
KPEPTIDES
14Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
195from bacteria
C07K 2319/80
CCHEMISTRY; METALLURGY
07ORGANIC CHEMISTRY
KPEPTIDES
2319Fusion polypeptide
80containing a DNA binding domain, e.g. Lacl or Tet-repressor
C12N 9/1241
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
9Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof
10Transferases (2.)
12transferring phosphorus containing groups, e.g. kinases (2.7)
1241Nucleotidyltransferases (2.7.7)
C12N 9/22
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
9Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof
14Hydrolases (3)
16acting on ester bonds (3.1)
22Ribonucleases ; RNAses, DNAses
C12Q 1/44
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
34involving hydrolase
44involving esterase
G01N 2500/04
GPHYSICS
01MEASURING; TESTING
NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
2500Screening for compounds of potential therapeutic value
04Screening involving studying the effect of compounds C directly on molecule A (e.g. C are potential ligands for a receptor A, or potential substrates for an enzyme A)
出願人
  • 国立研究開発法人理化学研究所 RIKEN [JP/JP]; 埼玉県和光市広沢2番1号 2-1, Hirosawa, Wako-shi, Saitama 3510198, JP
発明者
  • 岡田 康志 OKADA, Yasushi; JP
  • 池田 一穂 IKEDA, Kazuho; JP
代理人
  • 高島 一 TAKASHIMA, Hajime; JP
優先権情報
2013-16714409.08.2013JP
公開言語 (言語コード) 日本語 (JA)
出願言語 (言語コード) 日本語 (JA)
指定国 (国コード)
発明の名称
(EN) HIGHLY-ACTIVE TALE PROTEIN BY ALTERING DNA-BOUND PROTEIN DOMAIN
(FR) PROTÉINE TALE À HAUTE ACTIVITÉ PAR ALTÉRATION DU DOMAINE PROTÉINE LIÉE À L'ADN
(JA) DNA結合タンパク質ドメインの改変による高活性TALEタンパク質
要約
(EN)
The present invention provides: a protein containing an altered-type TALE section which exerts excellent binding activity with respect to a given target DNA base sequence with which sufficient DNA binding activity could not have been conventionally achieved; a nucleic acid coding for the aforementioned protein; an expression vector containing said nucleic acid; uses for the aforementioned protein, nucleic acid, and expression vector; and a method for screening the aforementioned protein. Specifically, the present invention provides an isolated altered-type protein exerting binding activity with respect to a target DNA, the altered-type protein containing a Transcription Activator-Like (TAL) Effector section derived from a Xanthomonas bacterium and having a repeating structure of multiple modules, wherein each of the modules has a target base recognition region for recognizing one base constituting the base sequence of the target DNA, and at least one of the modules has an amino acid sequence which was altered so that at least one amino acid residue, which is selected from a group comprising the 2nd to 6th and the 30th to 34th amino acids in an amino acid sequence represented by sequence number 1, has an artificial mutation.
(FR)
La présente invention porte sur une protéine contenant une section TALE de type altéré, qui exerce une excellente activité de liaison par rapport à une séquence de bases d'ADN cible donnée, avec laquelle on n'aurait pu traditionnellement réaliser une activité suffisante de liaison à l'ADN ; un acide nucléique codant pour la protéine mentionnée ci-dessus ; un vecteur d'expression contenant ledit acide nucléique ; des utilisations de la protéine, de l'acide nucléique et du vecteur d'expression mentionnés ci-dessus ; et un procédé de criblage de la protéine mentionnée ci-dessus. Plus précisément, la présente invention concerne une protéine de type altéré, isolée, exerçant une activité de liaison par rapport à un ADN cible, la protéine de type altéré contenant une section effecteur de type activateur de transcription (TAL) dérivant d'une bactérie Xanthomonas et ayant une structure répétitive de modules multiples, chacun des modules ayant une région de reconnaissance des bases cibles pour reconnaître une base constituant la séquence de bases de l'ADN cible, et au moins l'un des modules ayant une séquence d'acides aminés qui a été altérée de telle sorte qu'au moins un résidu d'acide aminé, qui est choisi dans un groupe comprenant les acides aminés allant du 2er au 6ème et du 30ème au 34ème dans une séquence d'acides aminés représentée par la séquence numéro 1, ait une mutation artificielle.
(JA)
 本発明は、従来十分なDNA結合活性を得られなかった任意の標的DNA塩基配列に対して、優れた結合活性が得られる改変型のTALE部分を含むタンパク質、該タンパク質をコードする核酸、該核酸を含む発現ベクター、およびそれらの用途、ならびに該タンパク質のスクリーニング方法等を提供する。 より具体的には、本発明は、標的DNAに対する結合活性を有する単離された改変型タンパク質であって、該改変型タンパク質は、複数のモジュールの繰返し構造を有するXanthomonas属細菌由来Transcription Activator-Like (TAL) Effector部分を含み、該複数のモジュールの各々は、該標的DNAの塩基配列を構成するそれぞれ1塩基を認識する標的塩基認識領域を有し、かつ、該複数のモジュールのうちの少なくとも1つは、配列番号1で表されるアミノ酸配列において、2~6番目および30~34番目からなる群から選択される少なくとも1つのアミノ酸残基が人為的な変異を有するように改変されたアミノ酸配列を有する、前記改変型タンパク質、等を提供する。
国際事務局に記録されている最新の書誌情報