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1. (WO2013035779) 細胞間の相互作用の解析方法
国際事務局に記録されている最新の書誌情報   

Translation翻訳: 原文 > 日本語
国際公開番号:    WO/2013/035779    国際出願番号:    PCT/JP2012/072723
国際公開日: 14.03.2013 国際出願日: 06.09.2012
IPC:
C12Q 1/02 (2006.01), A61K 31/34 (2006.01), A61K 31/506 (2006.01), A61K 31/519 (2006.01), A61K 45/00 (2006.01), A61P 1/18 (2006.01), A61P 35/00 (2006.01), C12M 1/00 (2006.01), C12Q 1/68 (2006.01), G01N 33/15 (2006.01), G01N 33/50 (2006.01), G01N 33/566 (2006.01), C07D 413/14 (2006.01), C07D 471/04 (2006.01), C07D 493/04 (2006.01)
出願人: The University of Tokyo [JP/JP]; 3-1, Hongo 7-chome, Bunkyo-ku, Tokyo 1138654 (JP) (米国を除く全ての指定国).
ISHIKAWA, Shumpei [JP/JP]; (JP) (米国のみ).
KOMURA, Daisuke [JP/JP]; (JP) (米国のみ)
発明者: ISHIKAWA, Shumpei; (JP).
KOMURA, Daisuke; (JP)
代理人: INABA, Yoshiyuki; TMI ASSOCIATES, 23rd Floor, Roppongi Hills Mori Tower, 6-10-1, Roppongi, Minato-ku, Tokyo 1066123 (JP)
優先権情報:
61/531,443 06.09.2011 US
2011-218266 30.09.2011 JP
発明の名称: (EN) METHOD OF ANALYSIS OF INTERCELL INTERACTIONS
(FR) PROCÉDÉ D'ANALYSE D'INTERACTIONS INTERCELLULAIRES
(JA) 細胞間の相互作用の解析方法
要約: front page image
(EN)The purpose of this invention is to provide an analysis method which, in a system in which cells derived from different individuals coexist, comprehensively and quantitatively evaluates intercell protein interactions and identifies significant interactions and strongly interdependent signals. This method of analysis of interactions of proteins between cells derived from two or more individuals involves: a step for obtaining, and grouping by individual, the expression profiles of the genes in the micro-environment in which the cells derived from two or more individuals coexist; a step for selecting combinations of two proteins that may interact intercellularly; and a step in which, out of these protein combinations, if, in one individual of the two or more individuals, the expression level of the gene encoding one of the proteins is higher than in other individuals, and if, in an other individual other than said one individual, the expression level of the gene encoding the other of the proteins is higher than in other individuals, then the interaction resulting from said protein combination is estimated, on the basis of the expression profiles, to be a more significant interaction between said cells which are derived from the two or more individuals.
(FR)L'objectif de cette invention est de fournir un procédé d'analyse qui, dans un système dans lequel des cellules issues de différents individus coexistent, évalue complètement et quantitativement des interactions protéiques intercellulaires et identifie des interactions significatives et des signaux fortement interdépendants. Ce procédé d'analyse d'interactions de protéines entre des cellules issues d'au moins deux individus consiste en: une étape d'obtention et de regroupement par individu des profils d'expression des gènes dans le microenvironnement dans lequel les cellules issues d'au moins deux individus coexistent ; une étape de sélection de combinaisons de deux protéines qui peuvent interagir de façon intercellulaire ; et une étape dans laquelle, parmi ces combinaisons de protéines, si, dans un individu des au moins deux individus, le niveau d'expression du gène codant pour une des protéines est supérieur à celui d'autres individus, et si, dans un autre individu autre que ledit individu, le niveau d'expression du gène codant pour l'autre des protéines est supérieur à celui dans d'autres individus, alors l'interaction résultante de ladite combinaison de protéine est estimée, sur la base des profils d'expression, comme étant une interaction plus significative entre lesdites cellules qui sont issues des au moins deux individus.
(JA) 本発明は、異なる個体に由来する細胞が共存する系で、細胞間のタンパク質相互作用を網羅的かつ定量的に評価し、重要な相互作用や相互依存性の強いシグナルを同定する解析方法を提供することを目的とする。 本発明は、2以上の個体に由来する細胞が共存している微小環境における遺伝子の発現プロファイルを、個体ごとに分類して得る工程と、細胞間で相互作用しうる2つのタンパク質の組合せを選択する工程と、前記発現プロファイルに基づいて、前記タンパク質の組合せの中で、前記2以上の個体の1の個体において、前記タンパク質の一方をコードする遺伝子の発現量がその他の個体より高く、かつ、前記1の個体とは別の個体において、前記タンパク質の他方をコードする遺伝子の発現量がその他の個体より高くなっている場合に、該タンパク質の組合せによる相互作用が、前記2以上の個体に由来する細胞間においてより重要な相互作用であると推測する工程と、を含む、2以上の個体に由来する細胞間におけるタンパク質の相互作用の解析方法を提供する。
指定国: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
アフリカ広域知的所有権機関(ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
ユーラシア特許庁(EAPO) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
欧州特許庁(EPO) (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
アフリカ知的所有権機関(OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
国際公開言語: Japanese (JA)
国際出願言語: Japanese (JA)