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1. (WO2008102825) 遺伝子発現パターンから遺伝子を分類する方法
国際事務局に記録されている最新の書誌情報   

国際公開番号: WO/2008/102825 国際出願番号: PCT/JP2008/052900
国際公開日: 28.08.2008 国際出願日: 20.02.2008
IPC:
G06F 19/24 (2011.01) ,C12N 15/09 (2006.01) ,C12Q 1/68 (2006.01) ,G06F 19/12 (2011.01)
出願人: NAKAYAMA, Yoichi[JP/JP]; JP (UsOnly)
ARTICELL SYSTEMS CORPORATION[JP/JP]; Fourth Floor, Kanagawa Science Park West Building 2-1, Sakado 3-chome, Takatsu-ku, Kawasaki-shi, Kanagawa 2130012, JP (AllExceptUS)
発明者: NAKAYAMA, Yoichi; JP
代理人: YAMAMOTO, Shusaku; Fifteenth Floor, Crystal Tower 2-27, Shiromi 1-chome Chuo-ku, Osaka-shi, Osaka 5406015, JP
優先権情報:
2007-04008920.02.2007JP
発明の名称: (EN) METHOD OF CLASSIFYING GENES BASED ON GENE EXPRESSION PATTERN
(FR) PROCÉDÉ DE CLASSIFICATION DE GÈNES SUR LA BASE D'UN MOTIF D'EXPRESSION DE GÈNE
(JA) 遺伝子発現パターンから遺伝子を分類する方法
要約: front page image
(EN) It is intended to provide a method whereby genes are rationally classified by analyzing information and data thereof. This object can be achieved by applying cluster analysis to the calculation of the degradation rates and apparent synthesis rates of gene transcription products and the subsequent calculation of the net synthesis rates of the gene transcription products from the apparent synthesis rates and degradation rates thereof. Namely, a method of classifying a plurality of genes which comprises: A) the step of calculating the degradation rates and apparent synthesis rates of transcription products of the genes and then calculating the net synthesis rates of the gene transcription products from the apparent synthesis rates and degradation rates thereof; B) the step of clustering the wave pattern of the net synthesis rates; and C) the step of, based on the results of the clustering, referring genes belonging to the same cluster as genes having at least one characteristic in common.
(FR) L'invention vise à proposer un procédé par lequel des gènes sont classés de façon rationnelle par l'analyse d'informations et de données de ceux-ci. Cet objectif peut être atteint par l'application d'une analyse par agrégats au calcul des vitesses de dégradation et des vitesses de synthèse apparentes de produits de transcription de gènes et au calcul ultérieur des vitesses de synthèse nettes des produits de transcription de gènes à partir des vitesses de synthèse apparentes et des vitesses de dégradation de ceux-ci. Spécifiquement, l'invention concerne un procédé de classification d'une pluralité de gènes qui comprend : A) l'étape de calcul des vitesses de dégradation et des vitesses de synthèse apparentes de produits de transcription des gènes, puis de calcul des vitesses de synthèse nettes des produits de transcription de gènes à partir des vitesses de synthèse apparentes et des vitesses de dégradation de ceux-ci; B) l'étape d'agrégation du motif d'ondes des vitesses de synthèse nettes; et C) l'étape, sur la base des résultats de l'agrégation, de référencement des gènes appartenant au même agrégat en tant que gènes ayant au moins une caractéristique en commun.
(JA) 本発明は、遺伝子の情報・データを解析し、合理的に分類する方法を提供することを課題とする。本発明の課題は、遺伝子の転写産物の分解速度および見かけ上の合成速度を算出し、該見かけ上の合成速度と該分解速度とから、該遺伝子の転写産物の正味の合成速度を算出するに、クラスター解析を応用することによって解決された。複数の遺伝子を分類する方法であって、A)該遺伝子の転写産物の分解速度および見かけ上の合成速度を算出し、該見かけ上の合成速度と該分解速度とから、該遺伝子の転写産物の正味の合成速度を算出する工程;B)該正味の合成速度の波形をクラスター化する工程;およびC)該クラスター化から、同じクラスターに属する遺伝子同士を、少なくとも1つの同じ性質を有する遺伝子である、と分類する工程、を包含する、方法が提供される。
指定国: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RS, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, SV, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
アフリカ広域知的所有権機関(ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
ユーラシア特許庁(EAPO) (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
欧州特許庁(EPO) (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MT, NL, NO, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
アフリカ知的所有権機関(OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
国際公開言語: 日本語 (JA)
国際出願言語: 日本語 (JA)