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1. (WO2006013925) 同位体比によるペプチドを構成するアミノ酸配列の検定
国際事務局に記録されている最新の書誌情報   

Translation翻訳: 原文 > 日本語
国際公開番号:    WO/2006/013925    国際出願番号:    PCT/JP2005/014303
国際公開日: 09.02.2006 国際出願日: 04.08.2005
IPC:
G01N 27/62 (2006.01), G01N 33/68 (2006.01)
出願人: EISAI R & D MANAGEMENT CO., LTD. [JP/JP]; 6-10, Koishikawa 4-chome, Bunkyo-ku, Tokyo, 1128088 (JP) (米国を除く全ての指定国).
ISHIHAMA, Yasushi [JP/JP]; (JP) (米国のみ).
KAWAI, Takatoshi [JP/JP]; (JP) (米国のみ)
発明者: ISHIHAMA, Yasushi; (JP).
KAWAI, Takatoshi; (JP)
代理人: INABA, Yoshiyuki; TMI ASSOCIATES 23rd Floor Roppongi Hills Mori Tower 6-10-1, Roppongi Minato-ku, Tokyo 1066123 (JP)
優先権情報:
2004-228324 04.08.2004 JP
発明の名称: (EN) EXAMINATION OF AMINO ACID SEQUENCE CONSTITUTING PEPTIDE DEPENDING ON ISOTOPIC RATIO
(FR) EXAMEN D'UNE SEQUENCE D'ACIDE AMINE CONSTITUTIVE D'UN PEPTIDE DEPENDANT DU RAPPORT ISOTOPIQUE
(JA) 同位体比によるペプチドを構成するアミノ酸配列の検定
要約: front page image
(EN)In determining and identifying an amino acid sequence of a peptide by using MS, it is intended to obtain additional data from MS for evaluating the adequacy of an amino acid sequence in a candidate list output from an identifying engine. Namely, a method of examining a deduced amino acid sequence for examining an amino acid sequence which has been deduced by searching for peptide data base based on peptide mass data and/or peptide modification data obtained by mass spectroscopy of the peptide, comprising: (1) the step of calculating the theoretical isotopic ratio of the peptide based on the deduced amino acid sequence and/or peptide modification data; (2) the step of measuring the isotopic ratio of the peptide based on the mass data of the peptide; and (3) the step of comparing the theoretical value with the measured value and evaluating the adequacy of the deduced amino acid sequence based on the difference between the theoretical value with the measured value.
(FR)L'invention concerne une méthode permettant de déterminer et d'identifier une séquence d'acide aminé d'un peptide par spectroscopie de masse dans le but d'obtenir des données supplémentaires par la spectroscopie de masse afin d'évaluer la conformité d'une séquence d'acide aminé dans une liste de candidats issue d'un moteur d'identification. D'une manière plus spécifique, l'invention concerne une méthode permettant d'examiner une séquence d'acide aminé qui a été déduite en recherchant une base de données de peptides en fonction de données de masse du peptide et/ou de données de modification du peptide obtenues par spectroscopie de masse du peptide, cette méthode consistant : (1) à calculer le rapport isotopique théorique du peptide en fonction de la séquence d'acide aminé déduite et/ou des données de modification du peptide ; (2) à mesurer le rapport isotopique du peptide en fonction des données de masse du peptide ; et (3) à comparer la valeur théorique avec la valeur mesurée et à évaluer la conformité de la séquence d'acide aminé déduite en fonction de la différence entre la valeur théorique et la valeur mesurée.
(JA) 本発明の課題は、MSを用いてペプチドのアミノ酸配列を決定し同定する際に、同定エンジンから出力される候補リスト中のアミノ酸配列の妥当性を評価するための付加的な情報をMSから得ることである。本発明は、ペプチドの質量分析により得られたペプチドの質量情報及び/又はペプチドの修飾情報を基に、ペプチドに関するデータベースを検索することにより推定されたアミノ酸配列を検定する方法であって、(1)前記推定したアミノ酸配列及び/又はペプチドの修飾情報から、ペプチドの同位体比の理論値を算出する工程と、(2)前記ペプチドの質量情報から、ペプチドの同位体比の測定値を測定する工程と、(3)前記理論値と前記測定値とを比較し、前記理論値と前記測定値との差異から、推定されたアミノ酸配列の妥当性を評価する工程と、を含む、推定されたアミノ酸配列の検定方法を提供する。    
指定国: AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, YU, ZA, ZM, ZW.
アフリカ広域知的所有権機関(ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
ユーラシア特許庁(EAPO) (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
欧州特許庁(EPO) (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, NL, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
アフリカ知的所有権機関(OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
国際公開言語: Japanese (JA)
国際出願言語: Japanese (JA)