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1. (WO2005073747) NMRシグナル帰属方法

Translation翻訳: 原文 > 日本語
国際公開番号:    WO/2005/073747    国際出願番号:    PCT/JP2005/001872
国際公開日: 11.08.2005 国際出願日: 02.02.2005
G01N 24/08 (2006.01), G01R 33/465 (2006.01)
出願人: MITSUBISHI CHEMICAL CORPORATION [JP/JP]; 33-8, Shiba 5-chome Minato-ku Tokyo 108-0014 (JP) (米国を除く全ての指定国).
KOHNO, Toshiyuki [JP/JP]; (JP) (米国のみ)
発明者: KOHNO, Toshiyuki; (JP)
代理人: SIKs & Co.; 8th Floor, Kyobashi-Nisshoku Bldg. 8-7, Kyobashi 1-chome Chuo-ku, Tokyo 104-0031 (JP)
2004-025592 02.02.2004 JP
(JA) NMRシグナル帰属方法
要約: front page image
(EN)It is intended to provide a method of highly efficiently and quickly assigning signals obtained by 1H-15N HSQC, etc. which is usable as a substitute for the existing signal assignment method wherein a protein concentration several to ten times higher than the minimum protein concentration required in the high-sensitive 1H-15N HSQC measurement method is needed; a method of highly efficiently and quickly specifying the three-dimensional structure of a target protein by using the above method; or a method of specifying the binding site of a target protein to a ligand. Namely, a plural number (20 or 39 at the largest) of proteins are synthesized by systematically combining a 15N/13C double-labeled amino acid, a 15N-labeled amino acid, etc. with an unlabeled amino acid for each amino acid constituting a target protein. Then these proteins are subjected to NMR measurement in such a manner as enabling the identification of correlated signals of two amino acid residues adjacent to each other and the thus obtained signals are compared.
(FR)La but de la présente invention est de fournir un procédé pour attribuer de manière très efficace et rapide des signaux obtenus par 1H-15N HSQC, etc., qui peut être utilisé comme substitut à la méthode d’attribution existante dans laquelle est nécessaire une concentration en protéines plusieurs fois et jusqu’à 10 fois supérieure à la concentration minimum en protéines requise dans le procédé de mesure hautement sensible de 1H-15N HSQC ; procédé permettant de spécifier de manière très efficace et rapide la structure en trois dimensions d’une protéine cible en utilisant le procédé susmentionné ; ou procédé permettant de spécifier le site de liaison d’une protéine cible à un ligand. A savoir qu’un nombre pluriel (20 ou 39 au plus) de protéines est synthétisé en combinant systématiquement un acide aminé doublement marqué au 15N/13C, un acide aminé marqué au 15N, etc. avec un acide aminé non marqué pour chaque acide aminé constituant une protéine cible. Ces protéines sont ensuite soumises à des mesures à RMN de telle manière à permettre l'identification des signaux corrélés de deux résidus d'acide aminé adjacents l'un à l'autre et les signaux ainsi obtenus sont comparés.
(JA) 本発明の目的は、感度の良いH−15N HSQC測定方法で観測可能な蛋白質最低濃度の、数倍から10倍以上の蛋白質濃度が必要であった従来のシグナル帰属方法に代わり、H−15N HSQC等で得られたシグナルを高効率かつ迅速に帰属する方法の提供、該方法を用いた高効率または迅速な標的蛋白質の立体構造特定方法あるいは目的蛋白質とリガンドとの結合部位を特定する方法を提供することである。本発明においては、目的タンパク質を、構成するアミノ酸ごとに15N/13C二重標識化アミノ酸と15N標識化アミノ酸等、および標識化されていないアミノ酸を系統的に組み合わせて基質に用いて複数の蛋白質を合成し、(最大20種類あるいは39種類)これを隣接する2つのアミノ酸残基の相関シグナルを同定し得る測定方法でNMR測定を行って、得られたシグナルを比較する。
指定国: AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NA, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, YU, ZA, ZM, ZW.
アフリカ広域知的所有権機関(ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
ユーラシア特許庁(EAPO) (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
欧州特許庁(EPO) (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, MC, NL, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
アフリカ知的所有権機関(OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
国際公開言語: Japanese (JA)
国際出願言語: Japanese (JA)