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1. WO2020245785 - PROCÉDÉ ET SYSTÈME D'IDENTIFICATION DE SITES CIBLES CANDIDATS POUR LUTTER CONTRE DES AGENTS PATHOGÈNES

Numéro de publication WO/2020/245785
Date de publication 10.12.2020
N° de la demande internationale PCT/IB2020/055312
Date du dépôt international 05.06.2020
CIB
A23L 33/135 2016.1
ANÉCESSITÉS COURANTES DE LA VIE
23ALIMENTS OU PRODUITS ALIMENTAIRES; LEUR TRAITEMENT, NON COUVERT PAR D'AUTRES CLASSES
LALIMENTS, PRODUITS ALIMENTAIRES OU BOISSONS NON ALCOOLISÉES NON COUVERTS PAR LES SOUS-CLASSES A21D112; LEUR PRÉPARATION OU TRAITEMENT, p.ex. CUISSON, MODIFICATION DES QUALITÉS NUTRITIVES, TRAITEMENT PHYSIQUE; CONSERVATION DES ALIMENTS OU PRODUITS ALIMENTAIRES EN GÉNÉRAL
33Modification de la qualité nutritive des aliments; Produits diététiques; Leur préparation ou leur traitement
10en utilisant des additifs
135Bactéries ou leurs dérivés, p.ex. probiotiques
A61K 9/00 2006.1
ANÉCESSITÉS COURANTES DE LA VIE
61SCIENCES MÉDICALE OU VÉTÉRINAIRE; HYGIÈNE
KPRÉPARATIONS À USAGE MÉDICAL, DENTAIRE OU POUR LA TOILETTE
9Préparations médicinales caractérisées par un aspect particulier
C07F 9/38 2006.1
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
07CHIMIE ORGANIQUE
FCOMPOSÉS ACYCLIQUES, CARBOCYCLIQUES OU HÉTÉROCYCLIQUES CONTENANT DES ÉLÉMENTS AUTRES QUE LE CARBONE, L'HYDROGÈNE, LES HALOGÈNES, L'OXYGÈNE, L'AZOTE, LE SOUFRE, LE SÉLÉNIUM OU LE TELLURE
9Composés contenant des éléments des groupes 5 ou 15 de la classification périodique
02Composés du phosphore
28à une ou plusieurs liaisons P-C
38Acides phosphoniques ; Acides thiophosphoniques
C12Q 1/689 2018.1
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
QPROCÉDÉS DE MESURE OU DE TEST FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES, DES ACIDES NUCLÉIQUES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
68faisant intervenir des acides nucléiques
6876Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p.ex. amorces ou sondes
6888pour la détection ou l’identification d’organismes
689pour les bactéries
CPC
C12N 15/10
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
15Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
09Recombinant DNA-technology
10Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
C12N 15/1089
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
15Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
09Recombinant DNA-technology
10Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
1034Isolating an individual clone by screening libraries
1089Design, preparation, screening or analysis of libraries using computer algorithms
C12Q 1/6809
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6809Methods for determination or identification of nucleic acids involving differential detection
C12Q 1/689
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
6888for detection or identification of organisms
689for bacteria
Déposants
  • TATA CONSULTANCY SERVICES LIMITED [IN]/[IN]
Inventeurs
  • MANDE, Sharmila Shekhar
  • ANAND, Swadha
  • SAMPATH, Preethi Alagarai
Mandataires
  • KHAITAN & CO
Données relatives à la priorité
20192102252406.06.2019IN
Langue de publication Anglais (en)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) METHOD AND SYSTEM FOR IDENTIFICATION OF CANDIDATE TARGET SITES FOR COMBATING PATHOGENS
(FR) PROCÉDÉ ET SYSTÈME D'IDENTIFICATION DE SITES CIBLES CANDIDATS POUR LUTTER CONTRE DES AGENTS PATHOGÈNES
Abrégé
(EN) A system and method for identification of target sites in a pathogenic genome and combating a pathogenic infection have been provided. The present disclosure utilizes the fact that a conserved stretch of nucleotide sequence in genomic neighborhood of genes important for bacteria can be targeted to disrupt the overall functioning of the pathogen. The method involves identification of nucleotide repeat sequences in the DNA. The method and system also involves administration of a cocktail comprising antimicrobial drugs, biofilm inhibitors and a construct. The genomic neighborhood or vicinity or 'flanking genes' refers to regions lying within a predefined number of genes to the identified conserved stretch of nucleotide repeat sequence (or its reverse complement) on the candidate pathogen genome or within a distance of predefined number of bases with respect to the conserved stretch of nucleotide repeat sequence (or its reverse complement) on the candidate pathogen genome.
(FR) L'invention concerne un système et un procédé d'identification de sites cibles dans un génome pathogène et luttant contre une infection pathogène. La présente invention utilise le fait qu'un étirement conservé de séquence nucléotidique dans le voisinage génomique de gènes importants pour les bactéries peut être ciblé pour perturber le fonctionnement global de l'agent pathogène. Le procédé implique l'identification de séquences de répétition nucléotidiques dans l'ADN. Le procédé et le système impliquent également l'administration d'un cocktail comprenant des médicaments antimicrobiens, des inhibiteurs de biofilm et une construction. Le voisinage génomique ou les « gènes flanquants » se réfèrent à des régions se trouvant dans un nombre prédéfini de gènes par rapport à l'étirement conservé identifié de la séquence de répétition nucléotidique (ou son complément inverse) sur le génome d'agent pathogène candidat ou à l'intérieur d'une distance d'un nombre prédéfini de bases par rapport à l'étirement conservé de la séquence de répétition nucléotidique (ou son complément inverse) sur le génome d'agent pathogène candidat.
Documents de brevet associés
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