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1. WO2020161344 - MANIPULATION D'INFORMATIONS DE SÉQUENCE BIOLOGIQUE

Numéro de publication WO/2020/161344
Date de publication 13.08.2020
N° de la demande internationale PCT/EP2020/053220
Date du dépôt international 07.02.2020
CIB
G16B 50/00 2019.1
GPHYSIQUE
16TECHNOLOGIES DE L’INFORMATION ET DE LA COMMUNICATION SPÉCIALEMENT ADAPTÉES À DES DOMAINES D’APPLICATION SPÉCIFIQUES
BBIO-INFORMATIQUE, c. à d. TECHNOLOGIES DE L’INFORMATION ET DE LA COMMUNICATION SPÉCIALEMENT ADAPTÉES AU TRAITEMENT DES DONNÉES GÉNÉTIQUES OU PROTÉIQUES DANS LA BIOLOGIE MOLÉCULAIRE INFORMATIQUE
50TIC pour la programmation d’outils ou de systèmes de bases de données spécialement adaptées à la bio-informatique
G16B 40/00 2019.1
GPHYSIQUE
16TECHNOLOGIES DE L’INFORMATION ET DE LA COMMUNICATION SPÉCIALEMENT ADAPTÉES À DES DOMAINES D’APPLICATION SPÉCIFIQUES
BBIO-INFORMATIQUE, c. à d. TECHNOLOGIES DE L’INFORMATION ET DE LA COMMUNICATION SPÉCIALEMENT ADAPTÉES AU TRAITEMENT DES DONNÉES GÉNÉTIQUES OU PROTÉIQUES DANS LA BIOLOGIE MOLÉCULAIRE INFORMATIQUE
40TIC spécialement adaptées aux biostatistiques; TIC spécialement adaptées à l’apprentissage automatique ou à l’exploration de données liées à la bio-informatique, p.ex. extraction de connaissances ou détection de motifs
G16B 30/10 2019.1
GPHYSIQUE
16TECHNOLOGIES DE L’INFORMATION ET DE LA COMMUNICATION SPÉCIALEMENT ADAPTÉES À DES DOMAINES D’APPLICATION SPÉCIFIQUES
BBIO-INFORMATIQUE, c. à d. TECHNOLOGIES DE L’INFORMATION ET DE LA COMMUNICATION SPÉCIALEMENT ADAPTÉES AU TRAITEMENT DES DONNÉES GÉNÉTIQUES OU PROTÉIQUES DANS LA BIOLOGIE MOLÉCULAIRE INFORMATIQUE
30TIC spécialement adaptées à l’analyse de séquences impliquant des nucléotides ou des aminoacides
10Alignement de séquence; Recherche d’homologie
CPC
G16B 15/00
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
15ICT specially adapted for analysing two-dimensional or three-dimensional molecular structures, e.g. structural or functional relations or structure alignment
G16B 20/20
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
20ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
20Allele or variant detection, e.g. single nucleotide polymorphism [SNP] detection
G16B 30/10
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
30ICT specially adapted for sequence analysis involving nucleotides or amino acids
10Sequence alignment; Homology search
G16B 30/20
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
30ICT specially adapted for sequence analysis involving nucleotides or amino acids
20Sequence assembly
G16B 50/10
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
50ICT programming tools or database systems specially adapted for bioinformatics
10Ontologies; Annotations
G16B 50/50
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
50ICT programming tools or database systems specially adapted for bioinformatics
50Compression of genetic data
Déposants
  • BIOKEY BV [BE]/[BE]
Inventeurs
  • VAN HYFTE, Dirk
  • VAN HYFTE, Arnout
  • BRANDS, Ingrid
  • VAN HYFTE, Ewald
Mandataires
  • WAUTERS, Davy
  • EGO, Christophe
  • VAES, Peter
  • CLOET, Arvid
  • HERTOGHE, Kris
  • VAN BLADEL, Marc
  • GONZÁLEZ CÁMARA, Fernando
Données relatives à la priorité
19156085.307.02.2019EP
19190899.508.08.2019EP
BE2019/507707.02.2019BE
Langue de publication anglais (EN)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) BIOLOGICAL SEQUENCE INFORMATION HANDLING
(FR) MANIPULATION D'INFORMATIONS DE SÉQUENCE BIOLOGIQUE
Abrégé
(EN)
In a first aspect, the present invention relates to a repository of fingerprint data strings for a biological sequence database, each fingerprint data string representing a characteristic biological subsequence made up of sequence units, each characteristic biological subsequence having in the biological sequence database a combinatory number which is lower than the total number of different sequence units available thereto, the combinatory number of a biological subsequence being defined as the number of different sequence units that appear in the biological sequence database as a consecutive sequence unit of the biological subsequence.
(FR)
Selon un premier aspect, la présente invention concerne un référentiel de chaînes de données d'empreintes digitales pour une base de données de séquences biologiques, chaque chaîne de données d'empreintes digitales représentant une sous-séquence biologique caractéristique constituée d'unités de séquence, chaque sous-séquence biologique caractéristique ayant dans la base de données de séquence biologique un nombre combinatoire qui est inférieur au nombre total de différentes unités de séquence disponibles sur celle-ci, le nombre combinatoire d'une sous-séquence biologique étant défini comme étant le nombre de différentes unités de séquence qui apparaissent dans la base de données de séquences biologiques en tant qu'unité de séquence consécutive de la sous-séquence biologique.
Également publié en tant que
EP2020704821
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international