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1. WO2020117713 - LECTURE IN SITU DE CODES-BARRES ADN

Numéro de publication WO/2020/117713
Date de publication 11.06.2020
N° de la demande internationale PCT/US2019/064071
Date du dépôt international 02.12.2019
CIB
C12Q 1/6813 2018.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
QPROCÉDÉS DE MESURE OU DE TEST FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES, DES ACIDES NUCLÉIQUES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
68faisant intervenir des acides nucléiques
6813Tests d’hybridation
CPC
C12Q 1/6818
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6813Hybridisation assays
6816characterised by the detection means
6818involving interaction of two or more labels, e.g. resonant energy transfer
C12Q 1/6841
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6813Hybridisation assays
6841In situ hybridisation
C12Q 1/6874
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6869Methods for sequencing
6874involving nucleic acid arrays, e.g. sequencing by hybridisation
C12Q 1/6876
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
G01N 1/30
GPHYSICS
01MEASURING; TESTING
NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
1Sampling; Preparing specimens for investigation
28Preparing specimens for investigation ; including physical details of (bio-)chemical methods covered elsewhere, e.g. G01N33/50, C12Q
30Staining; Impregnating ; Fixation; Dehydration; Multistep processes for preparing samples of tissue, cell or nucleic acid material and the like for analysis
Déposants
  • CALIFORNIA INSTITUTE OF TECHNOLOGY [US]/[US]
Inventeurs
  • ASKARY, Amjad
  • ELOWITZ, Michael, B.
  • BUDDE, Mark, W.
  • LOIS, Carlos
  • GUARDADO, Luis, Sanchez
  • CAI, Long
  • LINTON, James
Mandataires
  • CHANG, Y., Paul
Données relatives à la priorité
62/774,75403.12.2018US
62/936,30715.11.2019US
Langue de publication anglais (EN)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) IN SITU READOUT OF DNA BARCODES
(FR) LECTURE IN SITU DE CODES-BARRES ADN
Abrégé
(EN)
Disclosed herein include systems, methods, compositions, and kits for in situ readout of barcodes, such as DNA barcodes. Barcode constructs containing a promoter (e.g., a phage promoter) that is inactive in live cells can be integrated in the genomes of cells. Cells can be fixed, and phage RNA polymerase can be used for transcription of the barcode to RNA transcripts. The RNA transcripts can be detected using, for example, fluorescent imaging and used to determine barcode sequences.
(FR)
L'invention concerne des systèmes, des procédés, des compositions et des kits pour la lecture in situ de codes-barres, tels que des codes-barres ADN. Des constructions de codes-barres contenant un promoteur (par exemple, un promoteur de phage) qui est inactif dans des cellules vivantes peuvent être intégrées dans les génomes de cellules. Des cellules peuvent être fixées, et une ARN polymérase de phage peut être utilisée pour la transcription du code-barres sur des transcrits d'ARN. Les transcrits d'ARN peuvent être détectés à l'aide, par exemple, d'une imagerie fluorescente et utilisés pour déterminer des séquences de codes-barres.
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