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1. WO2020112964 - SÉQUENCAGE PAR COALESCENCE

Numéro de publication WO/2020/112964
Date de publication 04.06.2020
N° de la demande internationale PCT/US2019/063551
Date du dépôt international 27.11.2019
CIB
C12Q 1/6876 2018.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
QPROCÉDÉS DE MESURE OU DE TEST FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES, DES ACIDES NUCLÉIQUES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
68faisant intervenir des acides nucléiques
6876Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p.ex. amorces ou sondes
C12Q 1/6874 2018.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
QPROCÉDÉS DE MESURE OU DE TEST FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES, DES ACIDES NUCLÉIQUES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
68faisant intervenir des acides nucléiques
6869Méthodes de séquençage
6874faisant intervenir des réseaux d’acides nucléiques, p.ex. séquençage par hybridation
G16B 30/20 2019.01
GPHYSIQUE
16TECHNOLOGIES DE L’INFORMATION ET DE LA COMMUNICATION SPÉCIALEMENT ADAPTÉES À DES DOMAINES D’APPLICATION SPÉCIFIQUES
BBIO-INFORMATIQUE, c. à d. TECHNOLOGIES DE L’INFORMATION ET DE LA COMMUNICATION SPÉCIALEMENT ADAPTÉES AU TRAITEMENT DES DONNÉES GÉNÉTIQUES OU PROTÉIQUES DANS LA BIOLOGIE MOLÉCULAIRE INFORMATIQUE
30TIC spécialement adaptées à l’analyse de séquences impliquant des nucléotides ou des aminoacides
20Assemblage de séquences
CPC
C12Q 1/6874
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6869Methods for sequencing
6874involving nucleic acid arrays, e.g. sequencing by hybridisation
C12Q 1/6876
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
G16B 30/20
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
30ICT specially adapted for sequence analysis involving nucleotides or amino acids
20Sequence assembly
Déposants
  • XGENOMES CORP. [US]/[US]
Inventeurs
  • MIR, Kalim
Mandataires
  • LOVEJOY, Brett, A.
  • KWAK, Byung, Cheol
  • NG, Jennifer
  • TALUKDER, Gargi
  • MANN, Jeffry, S.
Données relatives à la priorité
62/772,97929.11.2018US
Langue de publication anglais (EN)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) SEQUENCING BY COALASCENCE
(FR) SÉQUENCAGE PAR COALESCENCE
Abrégé
(EN)
A method of sequencing a single, elongated target polynucleotide molecule can include the steps of seeding a plurality of separately resolvable origins of polynucleotide synthesis along the single, elongated target polynucleotide; contacting the target polynucleotide with a polymerase and labelled nucleotides; incorporating a labelled nucleotide, using the polymerase, into a plurality of sequence fragments complementary to the target polynucleotide and originating from the origins of polynucleotide synthesis; identifying and storing the identity and positions of the labelled nucleotide incorporated into each of the plurality of sequence fragments; and repeating the incorporating and identifying steps until adjacent sequence fragments coalesce and result in continuous sequence reads spanning two or more adjacent sequence fragments.
(FR)
Un procédé de séquençage d'une seule molécule polynucléotidique cible allongée peut consister à ensemencer une pluralité d'origines de synthèse de polynucléotides pouvant être résolues séparément, le long du polynucléotide cible allongé unique; à mettre en contact le polynucléotide cible avec une polymérase et des nucléotides marqués; à incorporer un nucléotide marqué, à l'aide de la polymérase, en une pluralité de fragments de séquence complémentaires du polynucléotide cible et provenant des origines de synthèse de polynucléotides; à identifier et stocker l'identité et les positions du nucléotide marqué incorporé dans chaque fragment de la pluralité de fragments de séquence; et à répéter les étapes d'incorporation et d'identification jusqu'à ce que des fragments de séquence adjacents coalescent et conduisent à des lectures de séquence continue couvrant au moins deux fragments de séquence adjacents.
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