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1. WO2020112566 - SURVEILLANCE DE PATHOLOGIE LIÉE À L'ADN TUMORAL CIRCULANT PERSONNALISÉE PAR SÉQUENÇAGE D'ADN REPRÉSENTATIF

Numéro de publication WO/2020/112566
Date de publication 04.06.2020
N° de la demande internationale PCT/US2019/062857
Date du dépôt international 22.11.2019
CIB
C12Q 1/6883 2018.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
QPROCÉDÉS DE MESURE OU DE TEST FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES, DES ACIDES NUCLÉIQUES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
68faisant intervenir des acides nucléiques
6876Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p.ex. amorces ou sondes
6883pour les maladies provoquées par des altérations du matériel génétique
CPC
C12Q 1/6883
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
6883for diseases caused by alterations of genetic material
C12Q 2600/106
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
2600Oligonucleotides characterized by their use
106Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
C12Q 2600/118
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
2600Oligonucleotides characterized by their use
118Prognosis of disease development
Déposants
  • VENTANA MEDICAL SYSTEMS, INC. [US]/[US]
  • THE FRANCIS CRICK INSTITUTE LIMITED [GB]/[GB]
  • THE ROYAL MARSDEN NHS FOUNDATION TRUST [GB]/[GB]
  • F. HOFFMANN LA ROCHE AG [CH]/[CH] (CL)
Inventeurs
  • ALEXANDER, Nelson R.
  • STANISLAW, Stacey
  • LITCHFIELD, Kevin Richard
  • TURAJLIC, Samra
Mandataires
  • FINETTI, Thomas
Données relatives à la priorité
62/772,65029.11.2018US
Langue de publication anglais (EN)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) PERSONALIZED CTDNA DISEASE MONITORING VIA REPRESENTATIVE DNA SEQUENCING
(FR) SURVEILLANCE DE PATHOLOGIE LIÉE À L'ADN TUMORAL CIRCULANT PERSONNALISÉE PAR SÉQUENÇAGE D'ADN REPRÉSENTATIF
Abrégé
(EN)
Disclosed herein is a method of deriving a plurality of genetic variants from a homogenized input sample. Also disclosed herein are methods of identifying a plurality of genetic variants in a sample comprising: homogenizing one or more input samples to provide a homogenized sample; preparing genomic material isolated from the homogenized input sample for sequencing; and identifying the plurality of genetic variants within sequencing data derived after sequencing the prepared genomic material.
(FR)
Procédé d'obtention d'une pluralité de variants génétiques dérivés à partir d'un échantillon d'entrée homogénéisé. L'invention concerne également des procédés d'identification d'une pluralité de variants génétiques dans un échantillon comprenant : l'homogénéisation d'un ou plusieurs échantillons d'entrée pour fournir un échantillon homogénéisé; la préparation d'un matériel génomique isolé à partir de l'échantillon d'entrée homogénéisé pour le séquençage; et l'identification de la pluralité de variants génétiques dans des données de séquençage dérivées après le séquençage du matériel génomique préparé.
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