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1. WO2020009916 - SYSTÈME ET PROCÉDÉ D'UTILISATION DU MICROBIOME POUR ATTÉNUER LES RISQUES ASSOCIÉS AU DÉVELOPPEMENT DE MÉDICAMENTS

Numéro de publication WO/2020/009916
Date de publication 09.01.2020
N° de la demande internationale PCT/US2019/039717
Date du dépôt international 28.06.2019
CIB
C12Q 1/02 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
QPROCÉDÉS DE MESURE OU DE TEST FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES, DES ACIDES NUCLÉIQUES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
02faisant intervenir des micro-organismes viables
G06N 3/12 2006.01
GPHYSIQUE
06CALCUL; COMPTAGE
NSYSTÈMES DE CALCULATEURS BASÉS SUR DES MODÈLES DE CALCUL SPÉCIFIQUES
3Systèmes de calculateurs basés sur des modèles biologiques
12utilisant des modèles génétiques
G16B 5/20 2019.01
GPHYSIQUE
16TECHNOLOGIES DE L’INFORMATION ET DE LA COMMUNICATION SPÉCIALEMENT ADAPTÉES À DES DOMAINES D’APPLICATION SPÉCIFIQUES
BBIO-INFORMATIQUE, c. à d. TECHNOLOGIES DE L’INFORMATION ET DE LA COMMUNICATION SPÉCIALEMENT ADAPTÉES AU TRAITEMENT DES DONNÉES GÉNÉTIQUES OU PROTÉIQUES DANS LA BIOLOGIE MOLÉCULAIRE INFORMATIQUE
5TIC spécialement adaptées à la modélisation ou aux simulations dans la biologie des systèmes, p. ex. réseaux de régulation génétique, réseaux d’interaction entre protéines ou réseaux métaboliques
20Modèles probabilistes
G16C 20/50 2019.01
GPHYSIQUE
16TECHNOLOGIES DE L’INFORMATION ET DE LA COMMUNICATION SPÉCIALEMENT ADAPTÉES À DES DOMAINES D’APPLICATION SPÉCIFIQUES
CCHIMIE COMPUTATIONNELLE; CHÉMO-INFORMATIQUE; SCIENCE INFORMATIQUE DES MATÉRIAUX
20Chémo-informatique, c. à d. TIC spécialement adaptées au traitement des données physicochimiques ou structurelles des particules, des éléments, des composés ou des mélanges chimiques
50Conception moléculaire, p.ex. de médicaments
CPC
G06N 20/00
GPHYSICS
06COMPUTING; CALCULATING; COUNTING
NCOMPUTER SYSTEMS BASED ON SPECIFIC COMPUTATIONAL MODELS
20Machine learning
G16B 20/00
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
20ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
G16B 40/20
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
40ICT specially adapted for biostatistics; ICT specially adapted for bioinformatics-related machine learning or data mining, e.g. knowledge discovery or pattern finding
20Supervised data analysis
G16B 40/30
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
40ICT specially adapted for biostatistics; ICT specially adapted for bioinformatics-related machine learning or data mining, e.g. knowledge discovery or pattern finding
30Unsupervised data analysis
G16C 20/10
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
CCOMPUTATIONAL CHEMISTRY; CHEMOINFORMATICS; COMPUTATIONAL MATERIALS SCIENCE
20Chemoinformatics, i.e. ICT specially adapted for the handling of physicochemical or structural data of chemical particles, elements, compounds or mixtures
10Analysis or design of chemical reactions, syntheses or processes
G16C 20/50
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
CCOMPUTATIONAL CHEMISTRY; CHEMOINFORMATICS; COMPUTATIONAL MATERIALS SCIENCE
20Chemoinformatics, i.e. ICT specially adapted for the handling of physicochemical or structural data of chemical particles, elements, compounds or mixtures
50Molecular design, e.g. of drugs
Déposants
  • YALE UNIVERSITY [US]/[US]
Inventeurs
  • GOODMAN, Andrew
  • ZIMMERMANN, Michael
  • ZIMMERMANN, Maria
Mandataires
  • LI, Dan
Données relatives à la priorité
62/693,74103.07.2018US
Langue de publication anglais (EN)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) SYSTEM AND METHOD FOR USING MICROBIOME TO DE-RISK DRUG DEVELOPMENT
(FR) SYSTÈME ET PROCÉDÉ D'UTILISATION DU MICROBIOME POUR ATTÉNUER LES RISQUES ASSOCIÉS AU DÉVELOPPEMENT DE MÉDICAMENTS
Abrégé
(EN)
The invention provides a system and method to quantitatively disentangle host and microbiome contributions to drug metabolism. The system includes a non-transitory storage medium storing information of levels of parent drug and drug metabolites for a plurality of oral drugs, by each of a plurality of microbiotas and by each of a plurality of genome- sequenced microbes in pure culture. A processor executes a predictor module which implements a computational model to quantitatively disentangle host and microbiota contributions to drug metabolism, predict how a person's microbiome will metabolize a drug candidate, predict how the metabolization impacts the drug candidate and metabolite exposure in circulation, and predict whether the drug candidate will be metabolized by a microbiota.
(FR)
L'invention concerne un système et un procédé pour dissocier quantitativement les contributions de l'hôte et du microbiome au métabolisme d'un médicament. Le système comprend un support de stockage non transitoire stockant des informations de teneurs en médicament parent et en métabolites de médicament pour une pluralité de médicaments oraux, par chacun d'une pluralité de microbiotes et par chacun d'une pluralité de microbes à génome séquencé en culture pure. Un processeur exécute un module de prévision qui applique un modèle de calcul pour dissocier quantitativement des contributions de l'hôte et du microbiote au métabolisme d'un médicament, prévoir la manière dont le microbiome d'une personne métabolise un médicament candidat, prévoir comment la métabolisation affecte le médicament candidat et l'exposition aux métabolites en circulation, et prévoir si le médicament candidat sera métabolisé par un microbiote.
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