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1. (WO2019048068) COMBINAISON DE VARIATIONS STRUCTURELLES ET DE MODIFICATIONS DE NUCLÉOTIDES SIMPLES DANS UN MODÈLE STATISTIQUE POUR UNE SÉLECTION DE TRAITEMENT MÉDICAMENTEUX ANTIMICROBIEN AMÉLIORÉE
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N° de publication : WO/2019/048068 N° de la demande internationale : PCT/EP2017/072757
Date de publication : 14.03.2019 Date de dépôt international : 11.09.2017
CIB :
C12Q 1/689 (2018.01) ,G06F 19/18 (2011.01) ,G06F 19/22 (2011.01)
[IPC code unknown for C12Q 1/689]
G PHYSIQUE
06
CALCUL; COMPTAGE
F
TRAITEMENT ÉLECTRIQUE DE DONNÉES NUMÉRIQUES
19
Équipement ou méthodes de traitement de données ou de calcul numérique, spécialement adaptés à des applications spécifiques
10
Bio-informatique, c. à d. procédés ou systèmes pour le traitement de données génétiques ou se rapportant aux protéines en biologie moléculaire informatique
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pour la génomique ou la protéomique fonctionnelle, p.ex. associations génotype-phénotype, déséquilibre de liaison, mutagénèse, génotypage ou annotation génomique, interactions protéines-protéines ou interactions protéines-acides nucléiques
G PHYSIQUE
06
CALCUL; COMPTAGE
F
TRAITEMENT ÉLECTRIQUE DE DONNÉES NUMÉRIQUES
19
Équipement ou méthodes de traitement de données ou de calcul numérique, spécialement adaptés à des applications spécifiques
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Bio-informatique, c. à d. procédés ou systèmes pour le traitement de données génétiques ou se rapportant aux protéines en biologie moléculaire informatique
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pour la comparaison de séquences impliquant des nucléotides ou des acides aminés, p.ex. recherche d'homologie, identification de motifs ou de SNP [polymorphismes de nucléotides simples] ou alignement de séquences
Déposants :
ARES GENETICS GMBH [AT/AT]; Karl-Farkas-Gasse 18 1030 Vienna, AT
Inventeurs :
BACKES, Christina; DE
GALATA, Valentina; DE
KELLER, Andreas; DE
SCHMOLKE, Susanne; DE
STÄHLER, Cord Friedrich; DE
Mandataire :
SCHNAPPAUF, Georg; DE
Données relatives à la priorité :
Titre (EN) COMBINATION OF STRUCTURAL VARIATIONS AND SINGLE NUCLEOTIDE CHANGES IN ONE STATISTICAL MODEL FOR IMPROVED ANTIMICROBIAL DRUG THERAPY SELECTION
(FR) COMBINAISON DE VARIATIONS STRUCTURELLES ET DE MODIFICATIONS DE NUCLÉOTIDES SIMPLES DANS UN MODÈLE STATISTIQUE POUR UNE SÉLECTION DE TRAITEMENT MÉDICAMENTEUX ANTIMICROBIEN AMÉLIORÉE
Abrégé :
(EN) The invention relates to a method of determining an antimicrobial drug resistance profile for a microorganism, wherein nucleic acid sequences of the microorganism are analyzed for structural variations of the genome comprising at least a change in the genome comprising more than one base, as well as for single nucleotide polymorphisms (SNPs), as well as a method of determining an infection of a patient with a microorganism potentially resistant to antimicrobial drug treatment and a method of selecting a treatment of a patient suffering from an infection with a potentially resistant microorganism, wherein the data of the antimicrobial drug resistance profile are applied.
(FR) La présente invention concerne une méthode de détermination d’un profil de résistance au médicament antimicrobien pour un micro-organisme, les séquences d’acides nucléiques du micro-organisme étant analysées pour des variations structurelles du génome comprenant au moins un changement dans le génome comprenant plus d'une base, ainsi que pour des polymorphismes mononucléotidiques (SNP), ainsi qu'une méthode de détermination d'une infection d'un patient par un micro-organisme potentiellement résistant à un traitement medicamenteux antimicrobien et une méthode de sélection d'un traitement d'un patient souffrant d'une infection par un micro-organisme potentiellement résistant, les données du profil de résistance au médicament antimicrobien étant appliquées.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)